化学软件应用-ChemOffice.ppt

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1、化学办公软件ChemOfficeChemOffice简介•分子式和结构式是化学家的语言，这类特殊的数据需要专门软件来处理。目前已经有了许多化学软件问世，其中ChemOffice是世界上最优秀的化学软件，集强大的应用功能于一身，其结构绘图是国内外重要论文期刊制定的格式。化学工作者可以用ChemOffice去完成自己的想法，与同行交流化学结构、模型和相关信息。是化学工作者的必备软件。ChemOffice构成•版本为ChemOfficeUltra2010版。主要包含如下软件和组成：•ChemDrawUltra11.0：化学结构绘图。•Chem3DUltra

2、11.0：分子模型及仿真。•ChemFinderUltra11.0：化学信息搜寻整合系统•E-Notebook11.0：整理化学信息、文件和数据，并从中取得所要的结果。3.1ChemDraw•ChemDraw是ChemOffice中使用最为频繁的组件，是国际上绝大多数杂志指定的论文排版软件，为不同的杂志备有不同的模板，应用最为广泛。•其理念是“化学家能懂的，ChemDraw也应该懂”。主要功能•AutoNom：依照IUPAC命名化学结构；•ChemNMR：预测13C和1H的NMR近似谱图；•ChemProp：预测BP、MP、临界温度、临界气压、吉布斯

3、自由能、logP、折射率、热结构等性质；•Chemspec：可输入JCAMP及SPC频谱资料，用以比较ChemNMR预测的结果；•ClipArt：高品质的实验室玻璃仪器图库，可搭配ChemDraw使用；•Name=Struct：输入IUPAC化学名称后就可自动产生ChemDraw结构。菜单栏常用工具栏选取框质谱碎片橡皮文本工具笔箭头轨道绘图元素括号化学符号询问工具高级工具模板环己烷环丁烷环辛烷椅式环己烷苯环套索结构透视实线单键多重箭虚线键碎线键碎线楔键粗键楔形键空楔形键波浪键序列工具脂肪族链环丙烷环戊烷环庚烷椅式环己烷环戊二烯状态栏格式工具栏绘图窗口

4、•1.1主界面•ChemDraw主界面自上而下分为菜单栏、工具栏和绘图窗口。绘图窗口左侧是垂直工具栏，其中的工具和模板是化学专用的。有些模板按钮下面带有箭头，单击该按钮不松开，会在其右侧弹出子工具栏。【箭头】【轨道】【绘图元素】【括弧】【化学符号】【询问工具】氨基酸（AminoAcids）•1.2模板垂直工具栏上的【模板】包含了多种较复杂的分子种类和玻璃仪器模板。分别如下：氨基酸（AminoAcidsSideChains）芳香族（Aromatics）双环（Bicyclics）玻璃仪器（Clipware）构象异构体（Conformers）环戊二烯（Cp

5、Rings）环烷（Cycloalkans）DNA官能团（FunctionalGroups）己醣（Hexoses）苯环（PhRings）纳米管（Nanotubes）多面体（Polyhedra）RNA立体中心（Stereocenters）超分子（Supramolecules）ChemDraw包括了众多的模板，我们想画的东西多数已经包括在其中了，熟悉这些模板，我们可以根据这些模板迅速组合成希望的分子形状。以阿司匹林结构式的绘制为例：1.启动ChemDraw；2.选中垂直工具栏最下端的按钮，鼠标变成苯环的样子；OOHO1.3绘图实例我们主要利用ChemDra

6、w绘制一些结构式，预测反应方程式，搭建化学反应仪器等。O1.3.1绘制结构式3.在绘图区单击鼠标，出现一个苯环；4.单击（单键）按钮，将鼠标移至苯环的一个角上，出现深色的正方形连接点，如图所示。5.自连接点横向拉出一根实线单键，松开鼠标，自单键终点向右下方再次拉出一根单键，与前一根单键夹角约为109°，余类推。6.多重键的方法同5。7.选中垂直工具栏中的文本工具，分别将鼠标移至应该出现羟基或氧原子的位置，待出现连接点后，点击键盘上的O键。在绘制过程中，化学键键角难以精确掌握，且拖拉化学键或键点的过程中难免会造成键长的变化和图形的扭曲，因此需要对图形进

7、行整理。除了手动调整外，还可以通过ChemDraw的相关菜单命令进行整理。8.单击选取框按钮，选中画好的阿司匹林结构式。9.执行【Structure】/【CleanUpStructure】命令，整理图形，即可将结构式整理到最佳状态。该命令可多执行几次，直到结构式的形状不再变化。•1.3.2图形存盘画好的分子结构图形可以保存为文件，以备将来使用或修改。ChemDraw文件的扩展名为“cdx”。【File】/【SaveAs】，弹出【另存为】对话框，即可保存。【保存类型】有多种选项，可另存为ChemDraw3.x版的格式（“chm”），或“gif”、“bm

8、p”图形格式，或另存为ISIS格式。•3.1.3.3图形的旋转或缩放如果不改变图形模板的话，在绘图区每单击一