持久性有机污染物4,4’-DDE和CB-153的反向虚拟筛选.pdf

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1、物理化学学~(WuliHuaxueXuebao)2276ActaP．一Chim．Sin．2013，29(10)，2276-2285October[Article]doi：10．3866／PKU．WHXB201307161www．whxb．pku．edu．C13持久性有机污染物4，4-DDE和CB-153的反向虚拟筛选许先进’苏计国刘斌’李春华’谭建军’张小轶’陈慰祖’王存新(北京工业大学生命科学与生物工程学院，北京100124；燕山大学理学院，河北秦皇岛066004)摘要：持久性有机污染物(POPs)会导致人类和动植物各种疾病的发生，已经成为一种新的全球性环境问题．研究发现，POP

2、s分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上，发挥其致病机制．本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法，从蛋白质结构数据库中筛选出配体分子可能的受体蛋白质，研究了持久性有机污染物4，4-DDE和CB．153潜在的受体蛋白质．结合实验信息，讨论分析了排在前5％的蛋白质受体．值得注意的是，已知的一些蛋白质受体都排在了虚拟筛选结果的前列．该研究不仅有助于进一步了解这些有毒污染物分子的致病机制，还将为设计针对该类污染物分子的生物传感器提供有用的信息．关键词：持久性有机污染物：反向虚拟筛选：蛋白质靶点：生物传感器中图分类号：O641ReverseVirtualScreeningonPers

3、istentOrganicPollutants4，4'-DDEandCB一153XUXian—Jin’SUJi．GuoLIUBinLIChun．Hua’TANJian．Jun’ZHANGXiao．Yi’CHENWei．Zu’WANGCun．Xin’-’(CollegeoilScienceandBioengineering,BeijingUniversityoiTechnology,BeUing100124,PR．ChinaCollegeofScience，YanshanUniversity,Qinhuangdao066004,HebeiProvince,R．China1Abstra

4、ct：Persistentorganicpollutants(POPs)causevariousdiseasesinbothhumanandwildlifeandhavebecomeanewglobaIenvironmentalproblem。ThetoxiceffectsofPOPscanbeinducedthroughtheirbindingtospecificproteinsinthebody．Inthepresentwork．areversevirtualscreeningmethodbasedOI3moleculardockingwasusedtosearchforpot

5、entialproteintargetsfortwoPOPs，4，4'-dichlorodiphenyldichloroethane(4，4一DDD)and2，2，4，4，5，5-hexachlombiphenyl(CB-153)，fromaproteinstructuredatabase．Targetsrankedinthetop5％werechosenforanalysisusingexperimentalinformation．Allknowntargetsappearedinthetop5％oftargets．Thisstudynotonlyincreasesunderst

6、andjngofthetoxicmechanismofPOPs，butmayalsoaidthedesignofnovelrecognitionelementsinbiosensors．KeyWords：Persistentorganicpollutant；Reversevirtualscreening；Proteintarget；Biosensor1引言业化合物、燃烧产物以及所使用的农药．当这些污持久性有机污染物(POPs)因其具有长期残留染物被释放到环境中，能够长期稳定地存在于土性、生物蓄积性、高毒性以及长程迁移等特性，已经壤、水及大气环境中，并随着大气和水的流动实现成为一种全

7、球性的环境问题．。POPs主要来源于工长距离的越境迁移，通过生物富集作用可在食物链Received：Aprill0，2O13；Revised：July15，2013；PublishedonWeb：Julyl6，2013．‘Correspondingauthor．Email：cxwangbjut@gmail．com；Tel：+86-10-67392724．TheprojectwassupportedbytheIntemationalScienceandTechnolog