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《斑马鱼3种胰蛋白酶原基因的克隆_序列分析及组织表达.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第52卷第1期中山大学学报(自然科学版)Vol.52No.12013年1月ACTASCIENTIARUMNATURALIUMUNIVERSITATISSUNYATSENIJan.2013斑马鱼3种胰蛋白酶原基因的克隆、*序列分析及组织表达陈文波,李卫国,张珍,焦春磊,吴帆(河南理工大学资源环境学院,河南焦作454000)摘要:胰蛋白酶是丝氨酸蛋白酶类超家族成员之一,在动物蛋白消化中起着重要作用。为深入研究胰蛋白酶在鱼类中的蛋白结构和生理功能,利用RT-PCR和RACE方法,成功获得了斑马鱼3种胰蛋白酶原cDNA序列(zftry1a、zftry1b和zftry
2、2)。结果表明,zftry1a和zftry1b均有242个氨基酸残基组成,其中包括15个氨基酸的信号肽和5个氨基酸(LDDDK)的激活肽。zftry2由247个氨基酸残基组成,其中包括15个氨基酸的信号肽和9个氨基酸(APLGDDDDK)的激活肽。氨基酸序列比对结果显示,三者具备胰蛋白酶原的保守结构特征,如含有催化三联体氨基酸(His-57、Asp-102和Ser-195),12个半胱氨酸,位于底物结合口袋底部Asp-189和口袋开口处的Gly-216、Gly-226等。进化树结果显示,斑马鱼zftry1a和zftry1b属于groupI,为阴离子胰蛋白酶原
3、;斑马鱼zftry2属于groupII,为阳离子型胰蛋白酶原。RT-PCR结果显示,三者组织分布模式类似,且在肠中有最高表达量。这些结果为研究鱼类胰蛋白酶原的基因进化和功能以及进一步探讨鱼类消化生理的分子机制奠定了基础。关键词:斑马鱼;胰蛋白酶原;克隆;组织表达中图分类号:Q785;S917文献标志码:A文章编号:0529-6579(2013)01-0111-07MolecularCloning,SequenceAnalysisandTissueExpressionofThreeFormsTrypsinogensinZebrafish,DaniorerioC
4、HENWenbo,LIWeiguo,ZHANGZhen,JIAOChunlei,WUFan(SchoolofResourceandEnvironment,HenanPolytechnicUniversity,Jiaozuo454000,China)Abstract:Trypsin,onememberoftheserineproteasefamily,playsimportantrolesinanimalproteindi-gestion.Itissynthesizedandsecretedasproenzymetrypsinogen,andremovedth
5、eN-terminalactivationpeptidebyenterokinaseconvertingtoactiveformintheintestine.TheactivetrypsincanspecificallycleavageatthepeptidebondonthecarboxylsideofbasicL-aminoacidssuchasarginineorlysineresi-duse.Forstudyingtheproteinstructureandphysiologicalfuntionsoftrypsinogeninfish,wesucc
6、essfullygotthreetrypsinogencDNAs(zftry1a、zftry1bandzftry2)fromzebrafishbyRT-PCRandRACE.Theresultsshowedzftry1aandzftry1bconsistedof242aminoacidswhichcontainedasignalpeptide(SP)of15aminoacidsandanactivationpeptide(AP)offiveaminoacids,LDDDK.zftry2consistedof247a-minoacidswhichcontain
7、edaSPof15aminoacidsandanAPofnineaminoacids,APLGDDDDK.Thealignmentbasedontheaminoacidsequencesrevealedthattheyhadtheconversedstructuralcharacteris-tics,suchasthecatalytictriad(His-57,Asp-102,andSer-195),12cysteinesforming6disulfidebonds,Asp-189atthebottomofthesubstrate-bindingpocket
8、andGly-216andGly-226lining
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