dna条形码技术及其在畜牧产品中的应用前景

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1、科研◎畜牧善匿2014年第1期(下半月)DNA条形码技术及其在畜牧产品中的应用前景廖俊应孟周张晓芹顾选。(1.丽水市松阳县畜牧兽医局。浙江丽水3230002;2.北京中医药大学中药学院,北京100102)[摘要】近年来,随着国际上DNA条形码技术的发展,中国也越来越多的将DNA条形码技术应用到植物及中药材的鉴定及相关研究中,然而此技术在畜牧产品中的应用却还少见报道。本文综述了DNA条形码技术的原理、方法流程及其在动物研究中的应用,并对DNA条形码在畜牧产品中的应用前景进行展望。【关键词】DNA条形码CO1畜牧产品前景【中图分类号】Q819【文献标识码】A【

2、文章编号】1003—1650(2014)01—0252—02近年来,DNA条形码技术受到了国际和国内的高度关注,并的测序技术也在进一步提高。在动植物的鉴定领域得到了广泛应用。DNA条形码技术首先是4.获得DNA条形码将测序返回的结果利用Chommas软由Tal】tz【啐在2002年提出,并将其应用于生物分类系统,Hebert件查看峰图质量,ContingExpress软件进行双向序列拼接,等在2003年首次提出DNA条形码(DNABarcoding)概念,并Bioedit软件进行序列编辑,最终获得DNA条形码。将其用于快速鉴定物种的标记物。到目前为止,国际

3、上已经建三、DNA条形码技术在动物研究中的应用立了包括生命条码联合会(ConsortiumfortheBarcodeofLife,1.DNA条形码在昆虫中的应用CBOL,http:HWWW.barcodeoflife.org),生命条码数据库(Bar—早在2l世纪初,我国学者就已经利用线粒体COl基因对codeofLifeDatasystems,BOLD,http:llwww.boldsystems.org),线虫、蛔虫、水蚤和吸虫等线形动物进行了序列差异研究。之以及国际生命条码计划(InternationalBarcodeofLife,iBOL,后Haj

4、ibabaeiM等基于CO1基因对鳞翅目521种昆虫进行了http:llwww.ibo1.org)在内的3个大型资源网站,吸引了50多序列分析,发现对其物种鉴别效率可以达到97.9%。潘程莹等个国家的投资者及合作组织。这些生命条码组织的成立,进一对7种蝗虫的线粒体COl基因进行了研究,发现基于COl基步推动了DNA条形码技术的发展。近年来,中国本土也形成因可以实现对蝗虫的鉴别,并揭示了蝗虫的系统进化历程。这了很多包括植物、动物及中药材在内的生物DNA条形码数据表明DNA条形码在昆虫类的鉴别研究中已经相当成熟。库,为物种鉴定及生物系统发育研究的发展提供了有力

5、的基2.DNA条形码在鱼类中的应用因证据。DNA条形码在鱼类中的开发和应用也较为广泛。Ward等一、DNA条形码技术的原理对澳大利亚207种海洋鱼类进行分析,发现所有物种在CO1条形码技术是一种通过对条形码进行电子扫描,从而实基因上都有一定差异,通过系统发育关系的构建,发现CO1基现对信息进行快速、准确的自动识别方法,目前已广泛应用与因可作为海洋鱼类DNA条形码的标准序列。此外,Zemlak等商品零售业【4】。DNA条形码与之类似,即利用基因组中一段公用COl基因研究印度洋沿岸35种鱼的229个样本发现,南非认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定及其相关

6、研究。和澳大利亚海域的同种鱼类存在很大的差异,指出南非和澳DNA序列是由A、T、G、c4种碱基组成,不同的碱基数目分大利亚海域应该还有很多隐存种没有被人发现。王中铎等利别以不同的顺序进行排列组合就会有足够多数目的基因序用CO1基因对南海硬骨鱼类进行研究时发现,CO1基因可用列,从而包括所有物种的基因型。于硬骨鱼类的物种鉴别,并可用于低级分类阶元的系统进化二、DNA条形码操作的方法流程分析。这些研究表明,COl基因不仅可以用于动物物种的鉴1.样品处理及DNA提取首先对样品进行液氮冷冻及酒定,还可以用于分析物种的系统进化历程,寻找物种基因差异精消毒等处理工作。

7、其次是进行DNA提取,DNA提取方法一性原因,这对于动物隐存种的发现及生物多样性的保护具有般包括破碎细胞壁并释放DNA,分离DNA,纯化DNA,DNA一定的实际意义。浓缩、沉淀与洗涤等基本步骤】。目前常用的DNA提取方法3.DNA条形码在软体动物中的应用有CTAB~法,高盐低pHtg~法,SDSt~法以及试剂盒提取法等。软体动物种类较多,现存种类大约8万种,为世界第二大对于植物样品,一般选择CTAB法[111,对于动物样品,一般采门类,目前海洋生软体动物已有不少报道。Johnson等对2O个用SDS(十二烷基硫酸钠)原理提取DNA㈣。随着近年来种类的帽贝(

8、Lepetodriluslimpets)进行分析发现,大部分种都D

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