胃癌与癌旁组织mirna差异表达谱的研究

胃癌与癌旁组织mirna差异表达谱的研究

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1、医学分子生物学杂志,2010,7(4):283~90JMedMolBiol,2010,7(4):283-290DOI:10.3870/j.issn.1672-8009.2010.04.001⋯一l论著if⋯一-胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱的研究张岱,王振宁,罗阳,徐岩,刘彦山,杨威,张学中国医学科学院基础医学研究所医学遗传学系医学分子生物学国家重点实验室北京市,100005中国医科大学附属第一医院肿瘤外科沈阳市,110001中国医科大学基础医学院医学基因组学教研室卫生部细胞生物学重点实验室沈阳市,110001【摘要】目的研究胃癌

2、中表达失调的miRNA及其生物学功能,从而进一步阐明miRNA在胃癌发生中的分子机制。方法将总RNA加ploy(A)尾后进行反转录PCR扩增特异miRNA,使用QuantityOne软件进行定量分析,计算每对样本胃癌与癌旁组织比值(T/NRatio),使用SAM软件进行统计分析。MTT法检测miR-21和miR一17-5p对胃癌细胞系生长的影响。结果在8对胃癌及癌旁组织样本中对237个miRNA进行了表达谱分析。对于检测到表达的161个miRNA,使用SAM软件进行统计分析,确认22个在胃癌中表达上调,2个在胃癌中表达下调(FDR=0

3、.0963)。进一步通过生长抑制试验证实在胃癌组织中表达异常增高的miR-21和miR一17-5p对胃癌细胞的生长有明显的促进作用。结论这些在胃癌中异常表达的miRNAs具有成为新一代胃癌标记物的潜力,能够为胃癌的精确诊断分型提供依据,同时针对这些靶点可以开发新的核酸治疗技术,通过抑制或增强其功能来达到治疗胃癌的目的。【关键词】胃癌;miRNA;表达谱;miR一17-5p;miR-21【中图分类号】R394.3DiferentialExpressionofmiRNAsinHumanGastricCancerVersusNon.Tumo

4、rA4iacentTissuesZHANGDai,WANGZhenning,LUOYang。,XUYan,LIUYanshan,YANGWei,ZHANGXue。,McKusick—ZhangCenterforGeneticMedicineandStateKeyLaboratoryofMedicalMolecularBiolo-gY,InstituteofBasicMedicalSciences,ChineseAcademyofMedicalSciences&PekingUnionMedi—calCollege,Beng,100005

5、,ChinaDepartmentofSurgicalOncology,thefirstHospitalofChinaMedicalUniversity,Shenyang,110001,ChinaeResearchCenterforMedicalGenomics,ChinaMedicalUniversity,Shenyang,110001,China【Abstract】ObjectiveToinvestigatethemiRNAexpressionprofilesofgastriccancer,andtrytounravelthebio

6、logicalmechanismofcertainderegulatedmiRNAsongastrictumorigenesis.Meth.odsTotalRNAwaspolyadenylatedbypoly(A)polymerase,andthencDNAwassynthesizedbyaspecificreversetranscription(RT)primerandreversetranscriptaseusingthepoly(A).tailedtotalRNAastemplates.Then.weusedQuantityOn

7、esoftwaretocalculatetheratiobetweeneachpairofgastrictumorsVS.non-tumoradjacenttissues(T/NRatio)toevaluatemiRNAexpression资助项目:国家杰出青年科学基金(No.30125017),国家自然科学基金(No.30370640),国家重点基础研究发展规划项目(973计划)(No.G1998051203)通讯作者:张学(电话:010-65295110,E.mail:xuezhang@pumc.edu.cn)Thisworkwa

8、ssupportedbygrantsfromtheNationalScienceFundforDistinguishedYoungScholars(No.30125017),theNatianalNaturalScien

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