linux下文献管理软件bibus的安装与使用

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1、Linux下文献管理软件——Bibus的安装与使用[已发布在12期linuxer的上,谢绝转载]对于做科研的人来讲,没有文献管理软件是不可思议的。比如我(硕士可以算作科研人员的,呵呵),一个生物学方面的学生,因为经常要看很多文献,并且在写论文的时候,常常需要引用别人的文章,而科研论文的格式是非常严格的,这个时候,就必须要有一个高效的组织管理这些文献的工具,否则,累死了写的论文还不过关。Windows下面的文献管理软件很多,有Endnote,ReferenceManager等,并且简单、方便、实用,当然它们是需要掏钱的。那有没有不掏钱的文献管理软件呢?答案是肯定的,并

2、且其功能与Endnote不相上下,那就是Bibus(参考http://bibus-biblio.sourceforge.net/wiki/index.php/Main_Page),并且最重要的是,Bibus更适合于在Linux下面使用。当然还有其他好用的软件,比如Zetoro,但我只用过Bibus,所以这里就只谈论Bibus。对于使用Tex/LaTex写文章的人来说,不存在这个问题,因为它们本身具有这个功能,这篇文章适合于习惯使用Word,OpenOffice写文章的人。首先介绍一下Bibus的特点(参考http://bibus-biblio.sourceforge

3、.net/wiki/index.php/Main_Page),Bibus的功能和Endnote很相近,可以将你在数据库中搜索到的文献信息存起来,不同的是,Bibus是将文献信息存入MySQL的,这个Idea非常好,充分发挥了MySQL的数据库功能(其实,Bibus还支持另外一种数据库SQlite,但在FC5和FC6下不支持,所以这里不谈);可以在Word和OO中插入文献,它会在文后像Endnote一样自动生成文献目录,并且已经有了很多种杂志的风格模板可供使用,比如Nature,Cell等;还有,它支持中文,也已经有了中文文献的风格模板(参考http://blog.5

4、d.cn/user2/skyline-moon/200609/307892.html,下载地址http://blog.5d.cn/user2/skyline-moon/upload/2006-09/5_138.txt);可在多个平台使用,如32-bitMSWindows(95/98),32-bitMSWindows(NT/2000/XP),All32-bitMSWindows(95/98/NT/2000/XP),AllPOSIX(Linux/BSD/UNIX-likeOSes),Linux,Win2K,WinXP。一、下面我将结合我的经验介绍在FC6下怎么安装和使用

5、Bibus参考http://bibus-biblio.sourceforge.net/wiki/index.php/Main_Page。第一步:安装依赖软件确认你的电脑上是否安装了OpenOffice.org2.0,wxWidgets>2.6,pyMySQL,MySQL,Python,其实我在安装(FC6上)的过程中还需要另外一个什么东东,但我现在想不起来了,不过你遇到的时候直接在网上搜索一下,下下来安装一下就可以了,不是很麻烦。如果以上几个软件还没有装,那就先装上它们,在FC6的安装盘上有这几个软件的RPM包,打开光盘,在终端下rpm-ivhsoft_name.r

6、pm就可以了。不过,目前还不支持64位平台。第二步:下载并安装Bibus下载:地址http://sourceforge.net/project/showfiles.php?group_id=110943。安装(前面的#号不用输入):#cpbibus_1.3.0.orig.tar.gz/usr/local/share/.#cd/usr/local/share#tarzxvfbibus_1.3.0.orig.tar.gz#exportLD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/openoffice.org2.0/program#exportPYTHONPATH=/

7、usr/lib/openoffice.org2.0/program/bin#cdbibus-1.3.0#cdSetup#pythonsetup.py#ln-s/usr/local/share/bibus-1.3.0/bibusStart.py/usr/local/bin/bibus第三步:配置MySQL这里需要一点MySQL知识,可以参考相关的书籍,这里不再赘述。#servicemysqldstart(如果你的MySQL服务没有开启的话,FC6默认是开启的)#cd/usr/local/share/bibus-1.3.0/db_models#vimysql_41.

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