新型鸭呼肠孤病毒RT-PCR检测方法建立与初步应用-论文.pdf

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1、·24·试验研究广东畜牧兽医科技2014年(第39卷)第1期新型鸭呼肠孤病毒RT—PCR检测方法建立与初步应用孔丰,袁远华,肖成谋。,黄淑坚貅(1.遂溪县遂城畜牧兽医站,广东湛江524300;2.大沥镇农林服务中心,广东佛山528231;3.佛山科学技术学院生命科学学院,广东佛山528231)摘要:为建立一种能够快速检测新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)的方法,本研究参考GenBank上登录的NDRVs3基因保守序列设计特异性引物经条件优化后,建立了检测NDRV的RT-PCR方法。对其特异性、敏感性和重复性进行检验。结果显示:该方法仅能从NDRV分

2、离毒中扩增到与预期大小相符,长度为298bp的特异性目的片段,检测灵敏度达到83.4Pg病毒RNA;而其它病毒:番鸭呼肠孤病毒、禽呼肠孤病毒、鸭病毒性肝炎病毒、鸭瘟病毒、鸭新城疫病毒和禽流感病毒等样品的扩增结果均为阴性。采用该方法对在广东不同地区采集的15份鸭病料样品进行检测,NDRV阳性率为53.33%。表明建立的RT-PCR方法特异性强、敏感度高,可用于NDRV的l临床诊断和流行病学调查。关键词:新型鸭呼肠孤病毒;RT-PCR;检测中图分类号:$852.659.4文献标识码:B文章编号:1005—8567(2014)O1—0024—04E

3、stablishmentandApplicationofRT—PCRMethodforDetectionofNDRVKongFeng,YuanYuanhua,XiaoChengmou,HuangSh~ian3(1.SuichengAnimalHusbandryandVeterinaryMedicineStation,SuixiCounty,Zhanjiang524300,China;2.DaliTownAgriculturalServiceCenter,Foshan528231,China;3.CollegeofLifeScience,Fos

4、hanUniversity,Foshan528231,China)Abslract:Todevelopamethodfordetectionofnew—typeduckreovirus(NORV),aRT—PCRmethodwasestablishedwith1paksofspecificprimersdesignedbasedontheconservedsequencesofS3geneofNDRV.RT—PCRresultsshowedthata298bpspecificalfragmentcouldbedetectedonlyfromt

5、heRNAofNDRV—QYstrain,andthesensitivityofRT—PCRreachedto83.4PgNDRVRNA.FifteentissuesamplesofsickducksfromdiferentareasofGuangdongprovinceweredetectedrespectivelybytheRT—PCRandthepositiveratewas53.33%(8/15)forNDRVwhichindicatedthattheRT—PCRmethodfordetectingNDRVwasrapid,speci

6、ficandsensitive,andcouldbeusedinclinicdiganoses.Keywords.New—typeduckreovims;RT—PCRdetection新型鸭呼肠孤病毒(New-typeduckre—前该病的诊断只能采用病毒分离和血清学方法。但ovirus,NDRV)病,是一种以肝脏不规则坏死、出血这些方法繁琐、费时,不适用于本病的快速诊断[6]。斑/点和心肌、腔上囊出血为主要特征的新疫病,王劭等吲研究证实NDRVs3基因存在一个变异区其发病率和病死率差异较大,但患病鸭日龄愈小,(390~975nt)。因此,本

7、实验根据已发表的NDRV发病率、病死率愈高。本病最早由陈少莺等报道f1]。NP03株S3基因序列(GenBank登录号:GQ888710)随后在我国各地也报道了此病,并从感染组织中设计了1对特异引物,建立了针对新型鸭呼肠孤分离到病毒q]。2005年冬季以来,该病在福建、广病毒S3基因的RT—PCR检测方法,为临床快速诊东、浙江、安徽等地番鸭、半番鸭、北京鸭、麻鸭群断及分子流行病学调查提供有效手段。中相继暴发。因该病病因不明,缺乏有效的防治措1材料与方法施而迅速蔓延,极大地威胁着养鸭业的发展_5]。目1.1病毒、病料及禽胚收稿日期:2013-1

8、2—26:通讯作者新型鸭呼肠孤病毒RT-PCR检测方法建立与初步应用一孔丰,等试验研究·25·新型鸭呼肠孤病毒(NDRV—QY)、鸭病毒性肝30s,72oC延伸30

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