实验一琼脂糖凝胶电泳.doc

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1、实验一琼脂糖凝胶电泳一、实验目的与要求学习与掌握DNA电泳的概念、分类以及技术方法,利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度、含量以及分子量,及分离不同大小DNA片段。二、实验原理带电颗粒在电场作用下,向着与其相反的电极移动,称为电泳。DNA分子是两性电解质,在高于其等电点的溶液(pH8.0-pH8.3)中,碱基几乎不解离,磷酸基团全部解离,DNA分子带负电荷,在电场中向正极移动。核酸分子在琼脂糖凝胶中泳动时,具有电荷效应和分子筛效应,但主要为分子筛效应。因此,核酸分子的迁移率由下列几种因素决定:(1)DNA的分子大小线状双链D

2、NA分子在一定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率与DNA分子量对数成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难于在凝胶孔隙中移动,因而迁移得越慢。(2)DNA分子的构象。当DNA分子处于不同构象时,它在电场中移动距离不仅和分子量有关,还和它本身构象有关。相同分子量的线状、开环和超螺旋质粒DNA在琼脂糖凝胶中移动的速度是不一样的,超螺旋DNA移动得最快,而开环状DNA移动最慢。如在电泳鉴定质粒纯度时发现凝胶上有数条DNA带难以确定是质粒DNA不同构象引起还是因为含有其他DNA引起时,可从琼脂糖凝胶上将DNA带逐个回收,用同一种限制性内切

3、酶分别水解,然后电泳,如在凝胶上出现相同的DNA图谱,则为同一种DNA。(3)电源电压。在低电压时,线状DNA片段的迁移速率与所加电压成正比。但是随着电场强度的增加,不同分子量的DNA片段的迁移率将以不同的幅度增长,片段越大,因场强升高引起的迁移率升高幅度也越大,因此电压增加,琼脂糖凝胶的有效分离范围将缩小。要使大于2kb的DNA片段的分辨率达到最大,所加电压不得超过5v/cm。(4)离子强度影响。电泳缓冲液的组成及其离子强度影响DNA的电泳迁移率。在没有离子存在时(如误用蒸馏水配制凝胶),电导率最小,DNA几乎不移动;

4、在高离子强度的缓冲液中(如误加10×电泳缓冲液),则电导很高并明显产热,严重时会引起凝胶熔化或DNA变性。溴化乙啶(Ethidiumbromide,EB)溴化乙淀(EB)是核酸的染色剂,DNA分子中形成荧光结合物,EB在紫外线照射下的发射荧光。荧光的强度与DNA的含量成正比,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置及估计出待测样品的浓度。三、实验试剂与器材(一)材料电泳仪,电泳槽,样品梳子、琼脂糖等(二)试剂及药品TAE试剂、琼脂糖、GoldView四、实验步骤1、琼脂糖凝胶的制备:称取1g琼脂糖,置于三角瓶中,加入100m

5、lTAE缓冲液中,将该三角瓶置于微波炉中加热使琼脂糖溶解,冷却至50~60℃时,加入5μlGoldView,充分混匀。2、胶板的制备:①取有机玻璃内槽,洗净、晾干。②将有机玻璃内槽置于一水平位置模具上,安好挡板。③将温热琼脂糖溶液倒入胶膜中,使胶液缓慢地展开,直到在整个有机玻璃板表面形成均匀的胶层。在凝胶槽中放入梳子,注意调节好数字之间的距离。凝胶的厚度在3~5mm之间。④室温下静置30min左右,待凝固完全后,轻轻拔出梳子,在胶板上即形成相互隔开的上样孔。制好胶后将铺胶的有机玻璃内槽放在含有0.5~1×TAE(Tris

6、-乙酸)工作液的电泳槽中使用,没过胶面1mm以上。3、点样:用移液枪取5ul待测DNA样品,与loadingbuffer液混合均匀,小心地加入到凝胶上样孔中。4、打开电泳仪,插好导线,电压110V,电泳30min。也可根据指示染料移动的位置,确定电泳是否终止。5、电泳完成后切断电泳,取出凝胶,置于紫外透射仪上观察电泳结果,并照相记录。五、实验结果图.DNA琼脂糖凝胶电泳图图中,1.泳道代表的是Marker5.6.7.8.9泳道是本组的实验结果。六、讨论由图可知,本组DNA条带还可以,不过还可以更清晰。主要可以从以下几条来

7、改进:1)点样的时候要小心,不要戳到点样孔。2)称量的时候严格按照配方。3)制胶的时候要等胶降到低于60℃之后再加入EB。 那是心与心的交汇,是相视的莞尔一笑,是一杯饮了半盏的酒,沉香在喉,甜润在心。  红尘中,我们会相遇一些人,一些事,跌跌撞撞里,逐渐懂得了这世界,懂得如何经营自己的内心,使它柔韧,更适应这风雨征途,而不会在过往的错失里纠结懊悔一生。  时光若水,趟过岁月的河,那些旧日情怀,或温暖或痛楚,总会在心中烙下深深浅浅的痕。生命是一座时光驿站,人们在那里来来去去。一些人若长亭古道边的萋萋芳草,沦为泛泛之交;一些

8、人却像深山断崖边的幽兰,只一株,便会馨香满谷。  人生,唯有品格心性相似的人,才可以在锦瑟华年里相遇相知,互为欣赏,互为懂得,并沉淀下来,做一生的朋友。  试问,你的生命里,有无来过这样一个人呢?  张爱玲说“因为懂得,所以慈悲”.  于千万人群中,遇见你要遇见的人,没有早一步,也没有晚一步,四目相对,只淡淡的问候一

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