重庆地区儿童急性腹泻相关博卡病毒的基因类犁及其流行特征调查-论文.pdf

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1、2014年8月第25卷第8期MedJChinPAPF.Vo1.25.No.8.August.2014797重庆地区儿童急性腹泻相关博卡病毒的基因类型及其流行特征调查赵进,黄豆豆,李思思,郭辰涛,许红梅,张小爱,刘玮【摘要】目的了解重庆地区急性腹泻患儿博卡病毒(humanbocavirus,HBoV)的基因型和流行特征,为HBoV相关腹泻的防控提供依据。方法以重庆医科大学附属儿童医院为哨点医院,收集2011年急性腹泻儿童患者的粪便样本504份,使用荧光定量PCR筛选阳性标本,使用巢氏PCR方法对阳性标本进行扩增,对扩增序列进行

2、序列比对并建立进化树进行基因分型。结果504份腹泻标本中,49份为HBoV阳性,阳性率为9.72%。不同季节HBoV的检出率不同,夏季检出率(19.72%)最高(P=0.003)。序列比对和进化树结果提示49份HBoV阳性标本中,HBoV1、HBoV2和HBoV3的例数分别25、23和I,其中检出的23份HBoV2全部为HBoV-2B型。结论不同季节HBoV的检出率不同,其中夏季病毒检出率最高;重庆地区检出的HBoV以HBoV1型和HBoV2B型为主。【关键词】博卡病毒;急性儿童腹泻;调查研究;基因型【中国图书分类号】R51

3、2.5InvestigationofhumanbocavirusinpediatricpatientswithacutediarrheainChongqing.ChinaZHAOJin,HUANGDoudou,LISisi,GUOChentao,XUHongmei,ZHANGXiaoai,andLIUWei.1.StateKeyLabora—toryofPathogenandBiosecurity,BeijingInstituteofMicrobiologyandEpidemiology,Beijing100071,Chin

4、a;2.DepartmentofInfec—tionGastroenterology,Children’SHospitalofChongqingMedicalUniversity,Chongqing400014,China【Abstract】ObjectiveToinvestigatetheprevalence,genotypesandepidemiccharacteristicsofhumanbocavirusassociatedwithacutepediatricdiarrheainChongqingarea.Metho

5、dsPediatricpatientswithacutediarrheawererecruitedandstoolsampleswerecollectedinChildren’SHospitalofChongqingMedicalUniversityduring2011.Real—timePCRandnestedPCRwereperformedtodeterminethepresenceofHBoVandtheirgenotypes.ResultsAtotalof504stoolspecimenswerecollected,

6、fromwhich49HBoVpositivesampleswereidentified,withadetectionrateof9.72%.AseasonaldistributionofHBoVwasobserved,withapeak(19.72%)insummer.NodistributionofageorgenderspecificwasobtainedfortheHBoVpositivedetection.BasedonBlastandMEGAanalysis,25HBoV1,23HBoV2and1HBoV3wer

7、edetermined.AlltheHBoV2strainsdetectedbelongedtoHBoV一2Bgeno—type.ConclusionsThedetectionrateofHBoVhasobviousseasonality,withapeakinsummer.HBoV1andHBoV-2Barethemajorgenotypes.【Keywords】humanbocavirus;acutepediatricdiarrhea;investigation;genotype人博卡病毒(humanbocavirus,

8、HBoV)属于细大学附属儿童医院作为监测哨点医院,对2011-01小病毒科,是最近发现的可以引起人类急性胃肠炎到2011.12急性腹泻的儿童进行HBoV的调查研的新发病原体。HBoV无包膜,衣壳蛋白呈二十究,以了解重庆地区儿童腹泻相关HBoV的型别及面体对称,蛋白内包含一条长为5300bp

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