甲基化对限制酶活性的影响.pdf

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1、甲基化对限制酶活性的影响很多DNA都含有被甲基化的碱基,下表记载了至今为止文献等报道的甲基化碱基对限制酶活性的影响及其相关的甲基化酶,以及因甲基化而切不开的碱基序列等。*1:4mM:AorCR:AorGS:CorGC:N4-methylcytosine5mK:GorTY:CorTH:AorCorTC:C5-methylcytosine5hmN:AorCorGorTW:AorTD:AorGorTC:C5-hydroxymethylcytosine6mA:N6-methyladenine*2:CGmethyla

2、se时,有时能部分切断。*3:5mAccI:缓慢地对Hemi-methylatedGTMKAC的Unmethylatedstrand切出Nick。5mAccIII:缓慢切断TCCGGA(1/75)。5m5mAfaI:缓慢切断Hemi-methylatedGTAC,但切不断Bi-methylatedGTAC。5mBalI:与dcmsite相重叠的情况下(TGGCCAGG),其切断速度非常缓慢(1/50以下)。5m4m5mBglI:缓慢切断Hemi-methylatedGCCN5GGC、GCCN5GGC、GCC

3、N5GGC,但切不断Bi-methylatedM.HaeIII-BglIsite。5mClaI:缓慢切断Hemi-methylatedATCGAT。5m5mEcoRI:缓慢切断Hemi-methylatedGAATTC,切不断Bi-methylatedGAATTC。5mFokI:缓慢切断CATCC(1/2~1/4)。5mHaeII:非常缓慢地切断RGCGCY。5mHaeIII:在Hemi-methylatedGGCC的Unmethylatedstrand上切出Nick。5mHindIII:缓慢切断Hemi-

4、methylatedAAGCTT。5mHinfI:缓慢切断GANTC(1/10)。5mHin1I:非常缓慢切断GRCGYC。5m5m5m5mKpnI:有受Hemi-methylatedGGTACC、GGTACC影响的报道文献,缓慢切断Hemi-methylatedGGTACC。5m5mMboII:有文献报道切不断Hemi-methylatedTCTTC。6mMflI:缓慢切断AGATCY。5mMspI:非常缓慢切断GGCCGG。5m5mPstI:缓慢切断Hemi-methylatedCTGCAG。5m5mP

5、vuII:缓慢切断Hemi-methylatedCAGCTG。5mSalI:缓慢切断Hemi-methylatedGTCGAC。5m6mSau3AI:在Hemi-methylatedGATC的Unmethylatedstrand切出Nick。另外,也有报告说对AGATC的切断较慢。5mSmaI:在Hemi-methylatedCCCGGG的Unmethylatedstrand切出Nick。5mSpeI:缓慢切断Hemi-methylatedACTAGT。5mXbaI:能切断Hemi-methylatedTC

6、TAGA,但速度很慢(1/100以下)。5mXhoI:非常缓慢切断CTCGAG。注)Hemi-methylatedDNA为只有一条链被甲基化的DNA,()表示的为相对速度。*4:TaKaRaunpublishedobservations。

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