丙型肝炎病毒基因分型检测方法研究进展-论文.pdf

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1、2014年8月第34卷第8期中国实用内科杂志819综述丙型肝炎病毒基因分型检测方法研究进展周一萌，窦晓光，张琳O0l：10．7504／nI(2014070703中图分类号：R512．6+3文献标志码：A关键词：丙型肝炎病毒；基因型Keywords：hepatitisCvirus；genotype丙型肝炎病毒(HCV)是引起慢性肝病的主要病原之我国慢性丙型肝炎患者基因亚型分布总体上以1b亚型一，属黄病毒科，基因组为单股正链RNA，全基因组约为主，2a亚型其次，但是存在地区差异性。2002年Chen9．6kb。目前全世界HCV感染者很可能已超过

2、2．0等73、2005年Lu等以及Dong等研究显示，1b型仍为亿。我国人群抗HCV阳性率为3．2％，约有近4千万感染我国HCV流行的主要基因型，1型和2型在年老的患者中较者。大部分HCV感染转为慢性感染，其中20％慢性丙型多，而3型和6a型在年轻人中较多。HCV基因型地区分布肝炎患者发展为肝硬化，另外20％进展为肝细胞癌。HCV不是固定不变的，影响因素有人群的流动、静脉吸毒者增加、基因分型与病程发展和干扰素治疗应答有密切的关系J，因血液透析等治疗措施的普及以及使用检测方法的不同。比此，HCV基因分型的检测对控制丙型肝炎的传播、提高丙型如由

3、于人口的流动，西南边境地区6a型已取代2a型成为第肝炎的治疗效果非常重要。本文将对HCV基因分型检测方二流行基因型j。法研究现状做一综述。1．3HCV基因型的临床意义欧洲肝病学会诊疗指南指出，HCV基因1型患者，经标准剂量的聚乙二醇干扰素1HCV基因型的研究现状(PEG—IFN)联合利巴韦林(RBV)治疗48周后，40％～54％1．1HCV基因分型1993年Simmonds等。通过比较不同的患者获得SVR。HCV基因2型或3型患者，经标准剂量的HCV毒株编码非结构蛋白5(NS5)区域的核苷酸序列，进行PEG—IFN联合RBV治疗24周后，6

4、5％～82％的患者获得系统进化分析，按照发现的先后顺序将HCV分为1—6型，SVR。不同基因型利巴韦林的治疗剂量也不同，基因l、4、5、每个型下面有若干亚型，以a、b、c等表示。该分型法能与先6型患者的RBV剂量为15rag／(kg·d)，基因2型和3型的前的各种分型命名法相对应，不仅协调了以前的分型命名方患者RBV剂量为800mg／d_l2J。不同基因型HCV患者肝脏法，而且可以命名新的型和亚型，因此得到了大多数学者的的病变程度也不同。回顾性研究发现：1b亚型患者肝脏组认同。不同基因型的全基因组序列差异达30％以上，氨基织学分级、病程进展

5、速度以及平均HCV病毒载量均明显高酸序列差异达25％～30％。同一基因型中不同亚型间的同于2型，lb亚型会引起较强的肝坏死炎症和肝纤维化。因源性在70％～85％，大于85％归为同一株。根据HCV基因此，HCV基因分型的检测对控制丙型肝炎的传播、提高丙型组高突变区(HVR)的变异，还可以把HCV分为许多准种，肝炎的治疗效果非常重要。病毒在感染者体内一般以多个准种的形式共存。2HCV基因型分子学检测方法1．2HCV基因型分布目前HCV主要有6种基因型，8O多个亚型。1、2、3型呈全球分布，在美国、欧洲、日本及中2．1直接测序分析法通过聚合酶链式

6、反应(PCR)扩增国，70％以上的HCV为1b型，主要由血液传播。2a及2b型HCV基因组有代表性的片段(如E1、NS5b、C区)，再进行核占HCV感染患者的10％一30％，在北美、欧洲及日本也很普苷酸序列测定，直接测序后与GenBank中已上传的基因序列遍；2e型主要发现于意大利北部地区。3型主要在印度及南进行序列比对后，描绘出系统进化树，根据进化距离及种系非地区流行，欧洲及美国的毒品静脉注射者中也比较常见。关系确定HCV的基因型。目前为HCV基因分型方法中最4型主要分布于非洲及地中海北部国家如埃及。南非发现经典、最准确的方法，是HCV基

7、因分型的“金标准”。由基因5型，基因6型主要在中国香港及东南亚地区流行。于测序分析法所扩增的基因组具有高异质性，能准确区分出亚型，因此许多其他分型方法都将序列分型作为参考标准。基金项目：沈阳市科技计划项目(F12—193—9—27)该方法所获的序列信息最多，可以明确被测区域的多态性，作者单位：中国医科大学附属盛京医院感染科，沈阳110004并能发现新的基因型，但又因为这些区域序列变异大，导致通信作者：张琳，电子信箱：zhangl@一hospita1．org有时不能成功进行逆转录PCR(1iT—PCR)和测序。而且该测ChineseJourn

8、alofPracticalImemalMedicineAug．2014Vo1．34No．8序法操作繁琐、工序复杂，只能在有限范围内应用，难以对较过LIPA条带放射自显影就能检测H