长江流域种群遗传多样性和遗传结构分析.pdf

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1、第38卷第4期水生生物学报Vo1．38．NO．420l4年7月ACTAHYDROBIOLOGICASINICAJu1．．2014doi：10．7541／2014．89长江流域鳖种群遗传多样性和遗传结构分析范启，2何舜平(1．中国科学院水生生物研究所，水生生物多样性与保护重点实验室，武汉430072；2．中国科学院大学，北京100049)摘要：鱼类群体遗传学研究主要集中在经济鱼类或濒危物种，然而一些经济价值较低的物种的遗传结构却甚少关注。因此，研究选择了经济价值较低的~]m(Hemiculterleucisculus)，共计323尾个体分别来自13个长江

2、流域及其附属湖泊的自然群体。通过扩增线粒体DNACytb基因序列片段(1100bp)，以探讨餐种群遗传结构和遗传多样性。遗传多样性分析呈现出高单倍型多样性和高核苷酸多样性的模式，表明该种群在长江流域较为稳定。另外，基于线粒体细胞色素b基因的系统发育分析，显示餐有5个线粒体谱系(谱系A．F)组成。中性检验和核苷酸错配分布分析均显示谱系A、B、E、F曾经历过种群扩张，并且呈现从上游向中游扩张的规律。谱系问较高且显著的遗传分化指数和显著的系统进化关系，均表明谱系A．F之间存在明显的遗传分化，暗示长江流域可能至少存在4个不同线粒体DNA水平上的种。餐种群的遗传

3、结构和多样性可能受到了长江流域特定格局的影响。关键词：餐；遗传结构；细胞色素b基因；遗传多样性；长江流域中图分类号：Q346~．5文献标识码：A文章编号：1000．3207(2014)04．0627．9miculterleucisculus(Basilewksy,1855)隶们更为全面地了解鱼类生态系统的资源状况，同样属于鲤形目鲐亚科餐属，是一种繁殖快、生活力强具有重要的意义。线粒体DNA，由于其严格的母性的小型鱼类。其形态特征是：体扁而长，头后背面平遗传以及在大部分动物中几乎不存在重组现象，因直，腹部略外凸，鳔2室。腹棱完全[1]。侧线在胸鳍此已经成

4、为群体遗传学中运用比较普遍的分子标上方急剧向下弯曲，至臀鳍基底后方又弯折上行至记。而关于餐种群的遗传结构和多样性的研究几乎尾柄正中。头尖，口端位，口裂向上倾斜。上、下颌没有报道，故本文通过采用线粒体Cytb基因对长几乎等长，眼大、侧位、背鳍末根不分支鳍条是光江中上游的餐种群进行遗传分化的研究，旨在揭示滑硬刺，其长度短于头长。体呈银白色，北部为青灰长江流域及中游一些湖泊这种特殊的地理格局对这色。餐在静水、流水中都能生长、繁殖。目前，对种广泛分布的物种的遗传结构和物种分化产生的影经济价值相对较低的餐遗传多样性研究得比较少，响，以期结合生物地理学探讨餐在群体

5、水平上对长餐的研究主要集中在分类学、生物学特性和营养学江流域复杂生境的适应。方面【2，。本种在我国分布极广，自南至北诸河流及1材料与方法湖泊均有，也分布于越南、朝鲜、俄罗斯，因此是作为群体遗传学研究的好材料。目前大部分针对鱼类1．1样本鉴定与收集的群体遗传学研究主要集中在经济鱼类或者濒危鱼本研究所用的餐样本依据《中国动物志》(硬骨类，而对经济相对偏低的小型鱼类的研究常被忽纲，鲤形目)(中卷)的检索系统进行标本鉴定。采用视。但是，这些鱼类同样也是鱼类生态系统的重要的323尾餐分别来自13个采样地，其中采自乐山市组成部分，对其进行群体遗传结构的研究可以使我

6、五通桥区(编号WTQ)19尾、四川合江(HJ)5尾、四收稿日期：2013—05．08；修订日期：2013．12一O1基金项目：重大基金项目(Y11321—1—101)资助作者简介：~(1986-)，男，湖北浠水人；硕士研究生；主要从事种群遗传研究。E-mail：fanqi0．618@163．corn通信作者：何舜平，E—mail：clad@ihb．ac．cn628水生生物学报38卷川泸州(LZ)37尾、重庆木洞(MD)28尾、宜昌秭归相关系数，地理距离可以大致通过取样点的经纬度(zo)35尾、岳阳洞庭湖(DT)29尾、湖北洪湖(HH)26坐标(表1)来

7、测定。尾、湖北嘉鱼县(JY)5尾、武汉金口(JK)IO尾、武汉联合使用Fu’Fs检验、Ta{ima’D中性检验和核苷东湖(DH)30尾、鄂州梁子湖(LZH)41尾、湖北武穴酸不配对分布(Mismatchdistribution)推断群体是否发(wx)31尾、江西鄱阳湖(PYH)的27尾。选取1尾生扩张的历史。一般地，群体如果遵守严格分子钟模翘嘴~t(Culteralburnus)作为构建进化树的外类群。式，则可以用群体的扩张时间(=r／2u)进行估算，f1．2DNA提取、扩增和测序是根据广义非线性最／bZ-乘法所估计的群体扩张参DNA提取的方法是，取其

8、左侧偶鳍或者背侧肌数；／,／依据U=2x#xk计算，其中是基因序列每肉，置于95％酒精中，保存