土壤腐殖酸清除剂.doc

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1、技术咨询电话:400-607-9999土壤腐殖酸清除剂SoilHumicAcidErasol货号:M090138产品及特点土壤和湖海沉积物中都含有棕黑色或黑色的腐殖酸,它们对PCR等后续反应有极大的抑制作用,所以有效去除土壤中腐殖酸是提取土壤微生物DNA的重要环节,但是目前市场上没有专门的产品,针对这一情况,本公司开发了本产品,专门用于对提取DNA用的土壤进行预处理,以清除腐殖酸成分。1.清除效果好,一次能使腐殖酸的浓度降低50%左右。2.适合于黄色、红色、黑色和棕黑色等各种质地的土壤和河海沉积物。3.操作过程简单快速,一次处理只需

2、要10分钟。4.扩容性好,可小规模操作,也可以大规模操作。规格及成分成份100mL包装本产品100mL使用手册1份运输及保存常温运输,4℃保存,有效期一年。使用方法1.按每1克土壤加10mL本产的比例将土壤样品与本产品混合。2.震荡器上震荡3-5分钟。3.3000-5000g室温离心5分钟,弃上清,沉淀的土壤可直接用于DNA提取。注意:此操作可以多次重复。具体次数取决于土壤中腐殖酸的浓度,一般每洗涤1次就可以取掉50%以上的腐殖酸,一般土壤洗涤1-3次即可。注意:本制品仅供研究使用,请勿用于临床治疗等其他用途技术咨询电话:400-6

3、07-9999疑难解答Q:如何判断提取的DNA没有腐植酸污染?A:方法一是目测法,即看得到的溶液是否无色。如果呈淡棕黑色或淡黄色,说明可能是少量残留的未除尽的腐植酸。方法二是检测最大光吸收。注意:有腐植酸污染并不表示DNA不能使用,有的腐殖酸并不抑制PCR扩增。Q:腐殖酸的最大吸收波长是多少?A:腐植酸(humicacid)是一大类呈棕黑色或黑色的物质,其结构千差万别,土壤中腐殖酸的组成和特点随土壤不同而不同,所以其最大吸收波长也各不相同。有的土壤的腐殖酸的最大吸收波长在260nm(见Appl.Environ.Microbiol.,

4、63:4993,1997),有的则在340nm,所以用特定的波长测定OD值时波长的选定要根据土壤而决定。Sigma,Fluka等公司出售的腐植酸产品成分一般比较简单,其最大吸收波长不能推广到成分更为复杂的土壤腐殖酸样品。Q:是否腐植酸都会抑制后续的DNA反应?A:否,因为腐植酸是一大类物质的统称,他们的结构和特性各不相同,所以是否对后续反应有影响最好通过实验来验证。如果用提取的DNA溶液原液进行反应而反应没发生,而对照样品(已知的不含污染的DNA)能够发生,说明可能有抑制作用。Q:有什么有效方法去除DNA样品中的腐植酸?A:可以先电

5、泳,然后用超大片段胶回收试剂MagicGelDNABACK(CAT#:M060021)纯化DNA,还可以使用本公司的柱式腐植酸清除剂(CAT#:M090146)。Q:在用土壤DNA进行细菌专一性PCR时,为何没加DNA模版的阴性对照有扩增产物出现?A:这是由于使用的TaqDNA聚合酶一般从E.coli表达菌株中提取,提取过程中污染了E.coli的基因组DNA,而使用的广谱细菌专一性引物可以识别所有细菌DNA基因组DNA模版,所以会产生扩增。建议使用高质量的TaqDNA聚合酶。注意:本制品仅供研究使用,请勿用于临床治疗等其他用途技术咨

6、询电话:400-607-9999技术资料腐殖酸及其特点腐植酸(humicacid)是动、植物的残骸经过微生物的分解转化和成千上万年的复杂化学反应而产生的,广泛存在于土壤表面和江海沉积物中的一大类呈棕黑色或黑色的物质,其典型的分子结构如下:腐殖酸的特点一是结构千差万别,二是能与金属离子复合,三是能跟很多有机分子相互作用。由于这些特点,一般DNA提取方法很难将各种腐殖酸分子与土壤DNA分离。污染的腐植酸可以抑制PCR反应和限制性内切酶酶切反应,还可以降低DNA的杂交效率和质粒的转化效率。由于腐殖酸是一大类物质,其组成和特点随土壤不同而不

7、同,所以其最大吸收波长也各不相同,有的土壤的腐殖酸在260nm有最大吸收(见Appl.Environ.Microbiol.,63:4993,1997),有的则在340nm。所以用特定的波长测定OD值不是定量腐殖酸的最佳方法,波长的选定要根据土壤的不同而决定。Sigma,Fluke等公司出售的腐植酸产品成分一般比较简单,其最大吸收波长不能推广到成分更为复杂的土壤腐殖酸样品。注意:本制品仅供研究使用,请勿用于临床治疗等其他用途

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