植物基因表达的启动子复习课程.ppt

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1、植物基因表达的启动子(1)TATA框(TATAbox):位于5′端转录起始点上游约20-30个核苷酸的地方。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAA。TATA框是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,mRNA的转录就会从不正常的位置开始。(2)CAAT框(CAATbox):位于5′端转录起始点上游约70-80个核苷酸的地方。CAAT框是启动子中另一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为GGCTCAATCT。CAAT框是RNA聚合酶的另一个结

2、合点,一般认为它控制着转录的起始频率,而不影响转录的起始点。当这段顺序被改变后,mRNA的形成量会明显减少。1.核心启动子元件(corepromoterelement):指RNA聚合酶起始转录所必需的最小的DNA序列,包括TATA盒和CAAT盒。核心元件单独起作用时只能确定转录起始位点和产生基础水平的转录。11281tttcccgccttcagtttagcttcatggagtcaaagattcaaatagaggacctaacagaac11341tcgccgtaaagactggcgaacagttcatacagagtctct

3、tacgactcaatgacaagaaga11401aaatcttcgtcaacatggtggagcacgacacacttgtctactccaaaaatatcaaagata11461cagtctcagaagaccaaagggcaattgagacttttcaacaaagggtaatatccggaaacc11521tcctcggattccattgcccagctatctgtcactttattgtgaagatagtggaaaaggaag11581gtggctcctacaaatgccatcattgcgataaaggaaaggcca

4、tcgttgaagatgcctctg11641ccgacagtggtcccaaagatggacccccacccacgaggagcatcgtggaaaaagaagacg11701ttccaaccacgtcttcaaagcaagtggattgatgtgatatctccactgacgtaagggatg11761acgcacaatcccactatccttcgcaagacccttcctctatataaggaagttcatttcatt11821tggagagaacacgggggactcttgac花椰菜花叶病毒35S启动子=CaMV3

5、5S启动子TATA框(TATAbox)CAAT框(CAATbox)2.上游启动子元件(upstreampromoterelement):包括通常位于-70bp附近的CAAT盒和GC盒、以及距转录起始点更远的上游元件。这些元件与相应的蛋白因子结合能提高或改变转录效率。不同基因具有不同的上游启动子元件,其位置也不相同,这使得不同的基因表达分别有不同的时间与空间表达调控。这些上游启动子元件中,最普遍的是增强子元件。3.增强子(enhancer)是一种能够提高同一条DNA链上基因转录效率的顺式调控元件。最早是在SV40病毒中发现

6、的长约200bp的一段DNA,可使旁侧的基因转录提高100倍,其后在多种真核生物和原核生物中都发现了增强子。增强子通常长100-200bp,也和启动子一样由若干组件构成,基本核心组件常为8-12bp,可以单拷贝或多拷贝串连形式存在。增强子的作用有以下特点:①增强子可以远距离作用。通常可距离1-4kb、个别情况下离开所调控的基因30kb仍能发挥作用,而且在基因的上游或下游都能起作用。②增强子作用与其序列的正反方向无关。将增强子方向倒置依然能起作用。而将启动子倒就不能起作用,可见增强子与启动子是很不相同的。③增强子要有启动

7、子才能发挥作用。没有启动子存在,增强子单独不能表现活性。④增强子对启动子没有严格的专一性。同一增强子可以影响不同类型启动子的转录。例如当含有增强子的病毒基因组整合入宿主细胞基因组时,能够增强整合区附近宿主某些基因的转录;当增强子随某些染色体段落移位时,也能提高移到的新位置周围基因的转录。带增强子的35S启动子4.静止子(silencer)最早在酵母中发现,以后在T淋巴细胞的T抗原受体基因的转录和重排中证实这种负调控顺式元件的存在。目前对这种在基因转录降低或关闭中起作用的序列研究还不多,但从已有的例子看到:静止子的作用可不

8、受序列方向的影响,也能远距离发挥作用,并可对异源基因的表达起作用。1.组成型启动子可以在所有细胞、组织和器官中持续发挥作用的启动子。如看家基因的启动子。组成型启动子用来控制基因的持续表达,如抗病、抗虫、抗不良环境的基因。在植物基因工程中,用于控制基因组成型表达的启动子主要有2个来源:微生物和植物。二、启动子的类型1.

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