多项实验操作技术

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1、华中科技大学博士学位论文实验用方法步骤Sup1.1PCR(使用TransgenePCRTaqMix,货号:20915)1.在PCR反应管中调制反应液:ReagentQuantity,for25µlofreactionmixtureTaqDNAPolymeraseMix12.5µl10µMPrimer上游1µl10µMPrimer下游1µlcDNA1µlSteriledeionizedwaterUpto25µlTotal25µl/Sample①反应体系根据实际情况调整②将上述各成分加入到0.2ml的PCR薄壁管中;2.PCR扩增:StepTempe

2、rature,°CTime,minNumberofcyclesNote起始变性9531变性940.530-35退火温度比理论退火温度大概低5°C,再根据反应结果优化退火60-700.5延伸720.5-1.5每分钟延伸1000bp最终延伸72101反应结束后,取扩增样品5µl,琼脂糖凝胶电泳分析结果,DNAmarker判断扩增片段的大小或冷冻保存,以备分析使用。30华中科技大学博士学位论文Sup1.2琼脂糖核酸电泳1.用蒸馏水将制胶模具和梳子冲洗干净,放于制胶板上,架好梳子;2.根据DNA片段大小用凝胶缓冲液配制适宜浓度的凝胶:称量琼脂糖干粉,加入

3、三角烧瓶内,加入TAE电泳缓冲液(20~30ml);3.微波炉内加热熔化,冷却片刻,加入荧光染料(EB),充分混匀凝胶溶液,倒入电泳槽中,待其凝固;4.室温下凝胶完全凝结后,拔出梳子,将凝胶安放在电泳槽内;5.倒入电泳缓冲液(量以没过胶面1mm为宜),除去样品孔内气泡;6.DNA样品中加入10×Loadingbuffer,混匀,将样品混合液缓慢加入被浸没的凝胶加样孔内;7.接通电源,红色为正极,黑色为负极,使DNA样品由负极往正极泳动(靠近加样孔的一端为负)。电压60~100V,电泳时间20~40min;8.根据指示剂泳动的位置,待指示剂到达胶3

4、/4处时终止电泳;9.在凝胶成像仪上观察电泳带及位置,并与核酸分子量标准Marker比较被扩增产物的大小。琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围琼脂糖凝胶浓度线形DNA的最佳分辨范围(bp)0.5%1,000~30,0000.7%800~12,0001.0%500~10,0001.2%400~7,0001.5%200~3,0002.0%50~2,000Sup1.3胶回收纯化DNA1.琼脂糖电泳,将目的条带用刀切下放入到EP管中,称量重量;2.按照每100mg加400µl的量加入bindingbuffer,57℃振荡器中温育振荡,直至溶解;3.取

5、出纯化柱,将上述溶解液转移至柱中,室温下放置2min,8,000rpm离心1min,弃EP管中的液体,将纯化柱放回EP管中;4.加700µl的washbuffer至柱中,8,000rpm离心30sec,弃收集管中的液体;5.加500µl的washbuffer重复洗涤一次,最后将纯化柱放入EP管中10,000rpm离心30sec,除去残留的washbuffer;6.将纯化柱放入一个新的EP管中。加30~40µlH2O或者Elution30华中科技大学博士学位论文buffer至纯化柱膜的中央,室温放置2min,10,000rpm离心1min洗脱DNA

6、,将DNA溶液放置-20℃保存备用。Sup1.4酶切(应用NEB限制性内切酶,双酶切)1.确定待切样品的浓度,选择合适的限制性内切酶和Buffer。2.在0.5ml的EP管中加入如下成分:ReagentQuantity,for40µlofreactionmixture10×ReactionBuffer4µl限制性内切酶12µl限制性内切酶22µl待切样品xµl(根据浓度确定)SteriledeionizedwaterUpto40µlTotal40µl/Sample3.混匀样品,离心使样品沉于管底。4.将离心管置于37℃中温育1-3hr。5.用未酶

7、切的质粒或DNA片段作为对照,琼脂糖电泳鉴定酶切结果。Sup1.5连接(应用NEBT4DNA连接酶)1.确定待经酶切回收后的载体和片段的浓度。2.在EP管中加入如下成分:ReagentQuantity,for40µlofreactionmixture10×ReactionBuffer4µlT4DNA连接酶2µl待连接样品载体与片段的mol比为1∶4SteriledeionizedwaterUpto40µlTotal40µl/Sample3.混匀样品,短暂离心使样品沉于管底。4.16℃连接过夜,连接完的样品直接用于转化或-20℃冰箱保存备用。Sup

8、1.6转化(应用Transgene公司DH5α感受态细胞)1.取一只感受态细胞于冰上融化。30华中科技大学博士学位论文1.加入1μl纯质

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