琼脂糖凝胶电泳

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时间:2022-02-04

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1、DNA琼脂糖凝胶电泳指导教师:龚熹生物基础实验中心实验目的:学习和掌握琼脂糖凝胶电泳的原理和基本操作。实验原理:1.琼脂糖凝胶电泳是最常用的鉴定DNA的方法,它简便易行,只需少量DNA。2.琼脂糖(聚丙酰胺)是一种天然聚合长链状分子,可以形成具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度。3.DNA(核糖、碱基、磷酸)分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应。DNA分子的迁移速率与其相对分子质量的对数成反比。4.观察琼脂糖凝胶中DNA的最简便方法是利用荧光染料溴乙锭(EB)染色,EB在紫外灯照射下,发红色荧光。EB结构与核酸碱基相似,容易插入DNA中,

2、因而其有强的致癌性。实验器材:移液器水平电泳槽一次性手套微波炉紫外检测仪水平仪tip量筒锥形瓶实验器材:实验试剂:1.pH8.0TAE缓冲液2.凝胶上样缓冲液:0.2%溴酚蓝(指示位置),50%蔗糖(增加比重,可换甘油)3.琼脂糖4.1mg/mlEB溶液5.Marker6.PCR扩增特异DNA片段操作:1.琼脂糖凝胶的制备称取0.45g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入30mlTAE缓冲液,保鲜膜封口,置微波炉加热至完全澄清透明取出摇匀,琼脂糖的浓度为1.5%。待琼脂糖凝胶溶液冷却至50℃,再加入1.5ml溴乙锭,使其终浓度为0.5微克/毫升。3mlgoldview白色

3、荧光(摇匀注意手法)2.凝胶板的制备用制胶器将紫外透光凝胶盘固定好,采用水平仪调整平衡使凝胶盘位于同一水平面。将适宜的梳子垂直架在凝胶盘内槽的一端,使梳齿距玻璃板之间尚有0.5-1mm的距离。将冷到50℃左右的琼脂糖凝胶,缓缓倒入凝胶盘内槽,厚度适宜(注意不要有气泡)。3.点样待凝胶凝固后,小心取出梳齿,将凝胶盘放入电泳槽內(注意方向)。加入足够的TAE电泳缓冲液,使液面略高出凝胶面。取5微升PCR扩增产物,向其中加入1微升的上样缓冲液,混匀后用移液器取3ml将其加入加样孔,记录样品点样次序与点样量。Mark2ml4.电泳接通电泳槽与电泳仪的电源,调节电压100

4、V30min,当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1-2cm处,停止电泳。5.观察在紫外灯下观察凝胶,有DNA处应显出橘红色荧光条带。记录电泳结果。注意事项:1.倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃,否则温度太高会使凝胶盘变形。2.胶一定要凝固好才能拔梳子,方向一定要竖直向上,不要弄坏点样孔。3.点样时枪头下伸,点样孔内不能有气泡。4.EB有毒,切勿用手接触,更不要污染环境,胶勿乱扔,紫外线照射不宜太久。作业:画出电泳图,分析观察到的结果。

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