python下科学计算包numpy和scipy的安装

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1、Python下大多数工具包的安装都很简单，只需要执行“pythonsetup.pyinstall”命令即可。然而，由于SciPy和numpy这两个科学计算包的依赖关系较多，安装过程较为复杂。网上教程较为混乱，而且照着做基本都不能用。在仔细研读各个包里的README和INSTALL之后，终于安装成功。现记录如下。系统环境：OS：RedHat5 Python版本：Python2.7.3 gcc版本：4.1.2各个安装包版本：scipy-0.11.0 numpy-1.6.2 nose-1.2.1 lapack-3.4.2 atlas-3.10.0依赖关系：sc

2、ipy的安装需要依赖于numpy、lapack、atlas（后两者都是线性代数工具包，不清楚的自行google之。。。），而numpy和sci的测试程序的运行又依赖于nose，因此，整个安装过程必须要按顺序执行的，否则是无法执行下去的。 安装步骤：1、安装nose这个安装比较简单，解压缩nose的安装文件，进入nose的目录，直接运行setup.py即可：tar-zxvfnose-1.2.1.tar.gz cdnose-1.2.1 pythonsetup.pyinstall 2、安装lapack由于最新版本的ATLAS可以直接集成lapack的安装压缩文

3、件进行编译，因此，如果仅在python下使用的话，可以不用安装lapack。只需要下载压缩文件：lapack-3.4.2.tgz即可。3、安装ATLAS这个的安装主要是配置一些选项，包括配置成64位库文件、位置无关的以及共享的链接库。详细的配置说明在atlas安装包doc/下的pdf文件中。可查阅。 下面是我的安装过程：tar-jxvfatlas3.10.0.tar.bz2 cdATLAS mkdirobj64 ../configure-b64-Faalg-fPIC-shared--prefix=/配置atlas的安装路径/atlas--with-net

4、lib-lapack-tarfile=/lapack安装压缩文件存放的目录/lapack-3.4.2.tgz (注：这个配置时间非常长，在Corei7处理上，大概1个小时左右)make（下面是一些检查过程，保证没有问题之后再进行安装）makecheck maketime makeinstall至此，atlas安装完成。不过我们要记录下编译过程中所用的fortran编译器类型，这个信息在下面安装numpy和scipy的时候要用。还是在目录obj64/下，执行fgrep'F77='Make.inc可以看到F77=gfortran记下这个编译器类型gfortr

5、an. 4、安装numpy numpy和scipy的安装过程都要显式的指明所用fortran编译器的类型，而且要与前面编译atlas时一致（在本文中即：gfortran），这一点非常重要，否则很多功能都会出错。 首先配置numpy目录下的site.cfg文件，指明atlas库的位置：tar-zxvfnumpy-1.6.2.tar.gz cdnumpy-1.6.2 cpsite.cfg.examplesite.cfg vimsite.cfg配置成如下格式：[DEFAULT] library_dirs=/usr/local/lib:/atlas的安装目录/a

6、tlas/lib include_dirs=/usr/local/include:/atlas的安装目录/include [blas_opt] libraries=f77blas,cblas,atlas [lapack_opt] libraries=lapack,f77blas,cblas,atlas [amd] amd_libs=amd [umfpack] umfpack_libs=umfpack接下来配置安装numpy所需要的Fortran编译器类型： 如果前面得到的Fortran编译器是gfortran的话，执行：pythonsetup.pybui

7、ld--fcompiler=gnu95如果前面得到的Fortran编译器是g77的话，执行：pythonsetup.pybuild--fcompiler=gnu然后执行pythonsetup.pyinstall安装完成5、安装scipy与安装numpy类似：tar-zxvfscipy-0.11.0.tar.gz cdscipy-0.11.0 vimsite.cfg配置成如下格式：[DEFAULT] library_dirs=/usr/local/lib:/atlas的安装目录/atlas/lib include_dirs=/usr/local/inclu

8、de:/atlas的安装目录/include [blas_opt] librar