利用苹果引物对不同山楂品种的ssr分析

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1、第29卷第2期河北林果研究Vol.29No.22014年6月HEBEIJOURNALOFFORESTRYANDORCHARDRESEARCHJun.2014文章编号:1007-4961(2014)02-0165-04DOI:10.13320/j.cnki.hjfor.2014.0036利用苹果引物对不同山楂品种的SSR分析韩志校1,毕振良2,陆凤勤2,高朋3,张朋飞2,李舰航2,张军1(1河北农业大学林学院,河北保定071000;2兴隆县林业局,河北兴隆067300;3宁河县林业局,天津宁河301500)摘要:从37对苹果SSR引物中筛选出12对有多态性引物,对采自河北省兴隆县

2、的36份山楂品种进行分析,共扩增条带52条,其中多态性条带44条,每对引物可检测到等位位点数为2~6条,多态率在50%~100%之间。利用DPS软件计算各样品间的遗传距离变化范围为0.0000~0.8440,表明供试样品之间具有丰富的遗传多样性。通过聚类分析发现,在遗传距离为0.59处,36份山楂品种可以分为两大类群,第一类群包括34个山楂系统品种资源和1个伏山楂系统品种,这一类群的山楂系统品种资源有部分样品没有互相区分开,可能与所选样品全为山楂系统资源,其亲缘关系较近有关,也可能与选择引物较少有关;第二类群只有雾灵红1个样品,说明采自兴隆县的雾灵红品种与其他品种之间的亲缘关系

3、相差较远,可能是一个新种。关键词:山楂;SSR;遗传多样性中图分类号:S661.5文献标志码:AAnalysisoftherelativerelationshipofdifferenthawthorncultivarsbyappleSSRprimers1,BIZhen-liang2,LUFeng-qin2,GaoPeng3,ZHANGPeng-fei2,HANZhi-xiao2,ZHANGJun1LIJian-hang(1CollegeofForestry,AgriculturalUniversityofHebei,Baoding071000,China;2XinglongFo

4、restryBureau,Xinglong067300,China;3NingheForestryBureau,Ninghe301500,China)Abstract:36differenthawthorncultivarsfromXinglongCountyofHebeiProvincewereana-lyzedbyscreeningout12pairsofprimerswithpolymorphismfrom37appleSSRprimers.Atotalof52bandswereamplifed,ofwhich44werepolymorphic.Thenumberofal

5、leliclocide-tectedbyeachpairofprimerrangedfrom2to6,withthepolymorphicrateof50.0%~100%.Thegeneticdistanceswerefrom0.0000to0.8440withDPSsoftware.Theresultsshowedthatthehawthorncultivarhasabundantgeneticdiversity.Throughclusteranalysis,thegeneticdistanceof0.59,36copiesofhawthornvarietiescanbedi

6、videdintotwoclusters.ClusterⅠcontains34hawthornsystemresourcesandhawthornvarietiesofavoltsystem,Somesamplescouldnotbedistinguishedwhichmaybeduetoselectingsamplesashawthornwholesystemresourcesortheveryclosergeneticrelationshipofprimers.ClusterⅡcontainsasampleofWulinghong,indicatingadistantkin

7、shipofWulinghongvarietyandothervarie-tiescollectedfromXinglongCountyandWulinghongsamplemaybeanewspecies.Keywords:Crataeguspinnatifida;SSR;geneticdiversity收稿日期:2014-02-24;修改稿收期:2014-03-18基金项目:国家林业局林业公益性行业科研专项资助项目“北方主要林木品种指纹库构建及分子鉴定技术研究”(201104039)。作

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