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1、第19卷第2期云南农业大学学报Vol119No122004年4月JournalofYunnanAgriculturalUniversityApr.2004XQTL作图主要统计方法及主要作图群体1232林谦,毛孝强,杨德,张雪梅(1.云南农业大学基础与信息工程学院,云南昆明650201;2.云南农业大学农学与生物技术学院,云南昆明650201;3.云南农业大学园林园艺学院,云南昆明650201)摘要:系统而简要的介绍了数量性状基因位点作图(QTL作图)及其主要方法、计算机软件及相应作图群体等。QTL作图的主要统计分析方法有采用t-检验、方差分析、
2、回归分析等方法的单标记分析方法,基于两个侧连标记的区间作图法和复合区间作图法,以及近几年由KAO和ZENG利用Cockerham模型发展起来的多重区间作图法等。分别介绍了QTL作图的主要作图群体如回交,F2,DH,RIL等,并对这几种作图群体进行了比较。关键词:QTL作图;统计分析方法;作图群体中图分类号:Q348文献标识码:A文章编号:1004-390X(2004)02-0121-07TheIntroductionofMajorStatisticalMethodsandMappingPopulationsofQTLMapping1232LIN
3、qian,MAOXiao2qiang,YANGDe,ZHANGXue2mei(1.CollegeofBasicScienceAndInformationEngineering,YAU,Kunming650201,China;2.CollegeofAgricultureScienceAndTechology,YAU,Kunming650201,China;3.CollegeofGardenandHorticulture,YAU,Kunming650201,China)Abstract:Inthisarticle,mappingquantitati
4、vetraitloci(QTLMapping)anditsmajorstatisticalmethods,references,computersoftwareandcorrespondingmappingpopulationsareintroduced,reviewedanddis2cussed.Themajorstatisticalmethodsinclude:(1)singlemarkeranalysisusingt2test,ANOVAandregres2sionanalysis;(2)Intervalmappingbasedontwo
5、flankingmarkers;(3)CompositeintervalmappingandmultipleintervalmappingusingCockerhammodeldevelopedbyKaoandZeng.Themajormappingpopula2tionssuchasbackcross,F2,DH,RIL,etcarealsointroducedandcompared.Keywords:QTLmapping;statisticalmethods;mappingpopulation基因作图是找出基因位于某一染色体的特定地绘制遗传
6、图谱从而应用现代分子技术更好地操的区段,并测定基因在染色体上线性排列的顺序和纵、控制这些基因。因此,探讨数量性状的基因作相互间的距离。利用遗传重组率作为基因间的距图(QTLMapping),特别是高精确度的作图方法具离而得到的图谱则称为遗传连锁图谱。在作物中,有重要的意义。许多重要的性状如产量等均为数量性状,找到影响数量性状往往由效应相对较小的多个基因所这些数量性状的基因位置可以帮助我们更为精确控制,其表现呈连续变异,同时这些变异的表现又X收稿日期:2003-05-07基金项目:国家自然科学基金重点项目(96C004Z);云南省教育厅科研基金资
7、助项目(0141350;02QY051)作者简介:林谦(1971-),女,湖北黄冈人,硕士,讲师,主要从事分子数量遗传学研究。122云南农业大学学报第19卷呈由小变大,由少变多的渐变,个体上仅有数量或r表示标记与QTL之间的重组率。t检验统程度上的不同;因此,对数量性状基因进行定位特计量为:^^别是精确定位困难较大。由于数量性状遗传的特μAA-μAatM=(113)殊性,所以,分子标记和统计方法,特别是混合模型211ÎM(+)的方法在数量性状的基因定位中起着重要的作用。n1n22近年来数量性状的基因定位的统计方法是当ÎM为两个标记基因型间样本方
8、差,n1,n2分今世界的一个热点研究领域,其发展非常迅猛,经别为性状值为AA和Aa的个体数,tM～t(N-2),历了传统的单标记分析方法(SMA)、基
