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1、棉花学报CottonScience2015袁27渊2冤院118―125陆地棉耐盐性状与SSR分子标记的关联分析*邵冰欣袁王红梅袁赵云雷袁陈伟袁郭志军袁龚海燕袁桑晓慧袁叶武威袁王俊娟渊中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室袁河南安阳455000冤摘要院本研究以134份陆地棉栽培种为试验材料袁测定其在0.3%盐浓度渊质量分数冤下的出苗率袁并使用74对SSR引物对这些材料进行基因组变异扫描遥利用Structure2.3.4软件分析该自然群体的遗传结构袁在此基础上采用Tassel2.1软件对耐盐性状与SSR分子
2、标记进行关联分析袁寻找与棉花耐盐性状相关的分子标记遥研究结果表明院渊1冤134份陆地棉栽培种的出苗率呈极显著差异袁并筛选出27个盐敏感材料和10个耐盐材料遥渊2冤74个SSR分子标记共检测出148个多态性位点袁涉及246个等位变异袁变异范围为2～7袁平均每个标记3.32个曰基因多样性指数变异范围为0.0295～0.4959袁平均值为0.2897曰SSR分子标记多态性信息含量渊PIC冤变幅为0.0290～0.3729袁平均值为0.2381遥渊3冤通过群体结构分析袁将该自然群体划分2个亚群体袁分别包含89份和45份材料
3、遥渊4冤关联分析共发现8个与棉花耐盐性状相关的SSR分子标记位点袁表型变异解释率变幅为2.91%～7.82%袁平均值为4.32%遥此研究结果可以为棉花耐盐性状分子标记辅助选择育种提供参考遥关键词院陆地棉曰关联分析曰SSR分子标记曰耐盐性中图分类号院S562.035文献标志码院A文章编号院1002-7807渊2015冤02-0118-08院10.11963/issn.1002-7807.201502004*ShaoBingxin,WangHongmei,ZhaoYunlei,ChenWei,GuoZhijun,Gon
4、gHaiyan,SangXiaohui,YeWuwei,WangJunjuan(455000,)Inthisstudy,134samplesofuplandcottoncultivarswereselected.TheseedlingemergenceratesweretestedunderNaClstressataconcentrationof0.3%(massfraction).SSRmarkers(74)wereusedtoscanthegenomeofthesematerials.TofindtheSSRm
5、arkersassociatedwithsalttolerance,anassociationanalysisbetweensalttoleranceandSSRmarkerswasperformedusingTASSEL2.1,basedontheanalysisofgeneticstructurebyStructure2.3.4.Theresultsshowedthefollowing.(1)Theseedlingemergenceratesof134cultivarsweresignificantlydiff
6、erent,with27saltsensitiveand10salttolerantvarietiesidentified.(2)Onehundredforty-eightlociwerefoundin74SSRmarkersinvolving246allelicvariations,rangingfrom2to7withanaverageof3.32variationsperSSRmarker.Thegenediversityrangedfrom0.0295to0.4959withameanof0.2897.Th
7、epolymorphicinformationcontentrangedfrom0.0290to0.3729withameanof0.2381.(3)ThisnaturalpopulationwasclassifiedintotwosubgroupsbyStructure2.3.4.Thesetwosubgroupscontained89and45samples,respectively.(4)EightSSRsitesassociatedwithsalttolerancewerefoundthroughassoc
8、iationanalysis,withtherateofexplanationrangingfrom2.91to7.82%,withameanof4.32%.Theresultscouldprovideareferenceformolecularmarkerassistedbreedingofsalttoleranceincotton.uplandcotto
