革兰阴性杆菌产超广谱β内酰胺酶的分布及基因型

革兰阴性杆菌产超广谱β内酰胺酶的分布及基因型

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  革兰阴性杆菌产超广谱β内酰胺酶的分布及基因型孟灵张润玲尤崇革王应芳【摘要】  目的:了解临床分离的革兰阴性杆菌中产ESBLs的流行特征及ESBLs基因型.方法:对我院临床分离的革兰阴性杆菌,采用改良三维试验检测产ESBLs菌株,用PCR对ESBLs基因进行分型.结果:175株革兰阴性杆菌分离出49株产ESBLs菌,阳性率28%,包括大肠埃希菌、克雷伯菌属、阴沟肠杆菌、弗劳地枸椽酸杆菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌.其中,第一位是阴沟肠杆菌(34.7%,17/49),其次是大肠埃希菌(30.6%,15/49).每种细菌产ESBLs率前三位是阴沟肠杆菌(56.6%,17/30),大肠埃希菌(37.5%,15/40),肺炎克雷伯菌(25.0%,6/24).各病区中神经科产ESBLs菌分离率最高(32.7%).49株产ESBLs菌携带TEM,SHV,CTXM分别为34,5,16株,有17株同时携带两种β内酰胺酶基因的菌株,占34.7%,其中TEM+CTXM型13株,占基因双阳性菌株的76.5%.结论:我院产ESBLs菌以阴沟肠杆菌、大肠埃希菌为主.神经科是主要产ESBLs菌的病区.ESBLs基因以TEM型、CTXM型为主,携带双基因的菌株在我院有流行.【关键词】革兰阴性杆菌β内酰胺酶类三维试验基因型0引言超广谱β内酰胺酶(Extendedspectrumbetalactamases,ESBLs)是质粒介导的由β内酰胺酶(BLA)基因突变而形成的一类酶,是丝氨酸蛋白酶的衍生物.它可水解头孢噻肟(CTX),头孢他啶(CAZ)等三代头孢菌素和单环酰胺类抗生素,并可被β内酰胺酶抑制剂(如克拉维酸)抑制〔1〕.自1983年德国首次从臭鼻克雷伯杆菌中分离出SHV2基因型ESBL以来,其数量及种类已在世界各地迅速增长.ESBLs基因型主要分为SHV,TEM,CTXM,OXA型和其他型,目前已发现200多种().不同的国家、地区、医院因其使用抗生素的种类和剂量不同,产ESBLs细菌的检出率、耐药性、基因型也有所差异.为了解兰州大学第二医院革兰阴性杆菌产ESBLs的流行状况和基因分型,我们对49株革兰阴性杆菌进行了ESBLs的确认及其基因型测定.1材料和方法1.1材料头孢噻肟(CTX,30μg/片),头孢硝噻吩纸片(Nitrocefin),MH琼脂购自英国Oxiod公司;克拉维酸(山西威奇达药业有限公司),氯唑西林(山西博康药业有限公司 );TaKaRa质粒DNA纯化盒,TaKaRaPCR扩增盒,DNAMarkerD3405A,引物购自宝生物(大连)有限公司.PCR分析仪(美国PERKINELMER),凝胶成像仪(德国Herolab),ABIDNA测序仪(美国PE),电泳仪(北京六一仪器厂).大肠埃希菌ATCC25922、肺炎克雷伯菌700603(卫生部临检中心).200505~09我院临床分离菌175株革兰阴性杆菌.1.2方法1.2.1改良三维试验对待测菌株利用冻融法获取粗酶提取液,滤菌器过滤后测定β内酰胺酶呈阳性待用.将CTX纸片贴于涂布了大肠埃希菌ATCC25922的MH平板中央,具其5mm处用刀片向外分别切四个裂隙,在各裂隙中分别加入待测粗酶液(30μL),粗酶液(30μL)+克拉维酸液(2mmol/L10μL),粗酶液(30μL)+氯唑西林液(2mmol/L10μL),粗酶液(30μL)+克拉维酸液(2mmol/L10μL)+氯唑西林液(2mmol/L10μL),35℃过夜培养.1.2.2ESBLs基因型酶(TEM,SHV,CTXM1型)PCR扩增①引物设计:TEM型T1(5'ATAAAATTCTTGAAGACGAAA3'),T2(5'GACAGTTACCAATGCTTAATCA3'),终产物1075bp;SHV型S1(5'GGGTTATTCTTATTTGTCGC3'),S2(5'TTAGCGTTGCCAGTGCTC3'),终产物928bp;CTXM1型C1(5'GGCCCATGGTTAAAAAATCACTGC3'),C2(5'CCGTTTCCGCTATTACAAACCGTCG3')终产物826bp.②质粒提取:挑选待测菌单个菌落接种至2.5mL含有氨苄西林(50mg/L)的LB培养基35℃过夜培养,经23000g离心2min,沉淀物采用碱裂解法提取质粒DNA.③反应体系:引物各0.25μL,10×PCRBuffer(+)(Mg2+PLus)5μL,dNTP4μL,Taq酶0.25μL,质粒模板2μL,加去离子水至50μL.④反应参数:TEM型变性94℃45s,退火50℃45s,延伸72℃1min共30个循环;SHV型变性94℃30s,退火55℃30s,延伸72℃1min共30个循环;CTX–M型变性94℃45s,退火59℃45s,延伸72℃1min共30个循环.1.2.3PCR产物测序PCR产物送宝生物(大连)有限公司,采用Sanger双脱氧链终止法测序,结果直接在GenBank中(.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)进行序列比对分析.1.2.4PCR产物聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR产物点样于40g/L聚丙烯酰胺凝胶,以8V/cm的电压下进行电泳30min后,经0.5mg/L溴化乙锭染色,凝胶置于凝胶成像仪摄像.2结果 2.1产ESBLs革兰阴性杆菌的菌株分布175株临床分离菌株检出49株ESBLs表型阳性菌,阳性率28%.产ESBLs菌株中,最常见的是阴沟肠杆菌,其次是大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌,最少见的是弗劳地枸橼酸菌(表1).各类革兰阴性杆菌产ESBLs率最高为阴沟肠杆菌,其次是大肠埃希菌、克雷伯菌属,铜绿假单胞菌产ESBLs率最低.表1革兰阴性杆菌产ESBLs的分离率2.2产ESBLs革兰阴性杆菌的科室分布产ESBLs菌在医院各科室广泛存在,神经科中比例最高,达32.7%(表2).表249株产ESBLs菌的病区分布2.3产ESBLs革兰阴性杆菌基因分型携带TEM型β内酰胺酶基因的菌株为34株(69.3%),携带SHV型、CTXM型基因的菌株分别为5株(10.2%)、16株(34.7%),其他型别11株(22.4%).其中,有17株同时携带两种β内酰胺酶基因的菌株,占34.7%,TEM+CTXM型13株(26.5%),TEM+SHV型3株(10.2%),SHV型+CTXM1株(2.0%).各型PCR扩增产物电泳见图1,菌株详细ESBL基因分型.3讨论  产ESBLs菌株主要引起医院感染和流行.从对本院的研究表明,我院产ESBLs菌分布范围广,分离率高.其中所占比例最高的是阴沟肠杆菌(34.7%),其次是大肠埃希菌(30.6%).近年来,我国各地区产ESBLs大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌分离率,一般在15%~35%左右〔2〕,2003年以来,部分城市已高达40%〔3〕.本研究产ESBLs大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌的分离率分别是37.5%,25%,与全国水平相当.各地区对产ESBLs阴沟肠杆菌的分离率差异较大,佘丹阳等〔4〕在106株阴沟肠杆菌中发现单纯产ESBLs占10.4%(11/106),肖庆忠等〔5〕报告阴沟肠杆菌产ESBLs达55.2%(117/212),本院阴沟肠杆菌产ESBLs率高达56.6%,与广州地区相似,可能与本院菌株分布,用药种类不同或存在局部流行有关.  我院多个科室中均分离到ESBLs菌,表明全院面临产ESBLs菌感染的威胁,应引起高度重视.其中,ESBLs菌在神经科最常见(32.7%).推测原因神经科入住的危重患者多,第三代头孢菌素使用量较大,在抗生素的选择性压力下,导致了ESBLs产生株增多.  PCR结果表明本院产ESBLs革兰阴性杆菌主要产TEM型β内酰胺酶,以大肠埃希菌和阴沟肠杆菌为主,其次是CTXM型,主要集中于阴沟肠杆菌.本院SHV型β内酰胺酶少见,主要由克雷伯菌属产生.产TEM型、CTXM型β 内酰胺酶在鲍曼不动杆菌检出,但不排除存在其他型别的可能.李蓉等〔6〕检测15株鲍曼不动杆菌主要为TEM型、PER型β内酰胺酶基因和OXA23型碳青霉烯酶基因.本研究中三株铜绿假单胞菌均不含blaTEM,blaSHV,blaCTX,说明可能为其他型别,有待进一步研究.有报道,铜绿假单胞菌最常见为PER型〔3〕.值得关注的是,本院产ESBLs菌TEM,SHV,CTX基因双阳性的比率达34.7%,表明产ESBLs菌携带两种β内酰胺酶耐药基因是我院的流行特点.其中,阴沟肠杆菌TEM型和CTXM型阳性占52.9%(17/9),多个耐药基因的存在造成阴沟肠杆菌的耐药谱扩大〔7〕.北京张永利等〔8〕在12株阴沟肠杆菌中检出5株同时携带blaTEM,blaCTX,推测产ESBLs菌可通过质粒进行细菌间耐药基因的交换,同一菌株质粒上有2种或2种以上ESBLs编码基因.  本研究我们发现CTXM型β内酰胺酶在我院有流行,具有重要的意义.国内报道产ESBLs的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌的基因型主要是CTXM型〔9〕,与我国头孢噻肟用量多于其他三代头孢菌素有关.我院头孢噻肟的用量也有此特点.CTXM型ESBLs菌株可通过转座子从染色体转移至质粒,并通过质粒使耐药性广泛传播,从而存在爆发流行的潜在性.因此,临床要避免滥用抗生素,重视细菌耐药的检测,控制耐药菌株的传播,减少医院感染的发生.【

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