单晶结构分析

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1、一、软件简介SHELXTL系列结构分析软件包足巾徳闲Gocltingen大学Sheldrick教授等编写的，主耍版本宵：Shclx86,Shelx93,Shelx97及SHELXTL5.*,其屮Shclx86版提供了整套软件，包括XP、但白从SIEMENS(BRUKER)公司购买了该套软件并命名为SHELXTL之后，就不再免费提供XP及XPREI二、软件结构SHELXTL软件包包含五个主要程序：XPREP,XS,XP,XL,XCIF.它们使用的文件力“name.ext”，其中“name”是一个描述结构的自己定义的字符巾，不同的“ex

2、t”则代表若不同的文件类型。在SHELXTL结构分析过程中，主要涉及到三个数据文件:name.hkl；name.ins；nanie.res,其中INS和RES文件具有相似的数据格式，区别只足INS足指今(instruction)文件，它主耍足充当XS及XL的输入文件，而RES足结果(reSUlt＞文件，主耍保存XS及XL的结果，RES屮包含有盘接法XS或圾小二乘法XL产生的差Fourier峰。HKL文件是ASCH型的衍射点数据文件，包含H,K.L，I和0(1)，其格式:()0136.571.31100487057.132178.691

3、hklIo(I)HKL文件的格式决定了它不能进行除了DIFABS型校正之外作何校正。INS和RES文件中主要包含单胞参数.分-了•式(原子类型)，原子位S坐标及XL指令等.它们是山一些指令定义的ASCII文件。单品衍射实验室为用户提供了下列数据文件：①*l.raw，*2.raw...CCD鉍原始文件，为校正而保留(2)*._ls记录数裾处理文件，包含数据完成度及圾后精修单胞参数所川的衍射点®*.abs校正结來文件，主耍包含Tmin，Tmax®*.hkl经SADABS校正后的衍射点文件⑤*.p4p矩阵文件，包贪单胞参数SHELXTL运行

4、阁三、数据校正——SADABSSMARTCCD由于设备的特殊性使得它不具有四岡-•样的PSI校T:(巾于品体外观的不对称性)，但巾于在CCD所收粜的数裾屮宥很多对的等效点，W而也可拟合出一条经验校正曲线。SADABS就足Sheldrick特别为CCD数裾编写的校正程序。由于SADABS使用等效点，因而要求输入正确的Laue群，只有正确的Lauc群才能保证校iE的正确性，SADABS还提供了与0有关的校正——所洞的球形校正，它的原理就是在不同的()角衍射时，X射线通过的光程不同，因而吸收也不同,该校正耍求位，其中R为砧体几何尺寸中敁小的

5、边长，而晶体的吸收闪子M足山化合物的分子式决定的，因而只冇在结构完全解释出來之后才能进行这个校正，而这种校正口前有些刊物足耍求提供的，也正因为如此，耍求保留鉍原始的数裾文件*.RAW»㈧、数裾处理——XPREPXPREP主耍完成数据处理工作，它耍求存在RAW或HKL文件，它的使用命令足：Xprcpname它是一个交互式菜电駆动程序并提供了一个缺杆运行过程：1.从name.hkl文件(若存在戚narac.raw文件中读入衍射点;2.从name.p4p或键盘获得单胞参数及误差；3.判断品格类型：XPREP首先对衍射点数裾进行统计:3910

6、Reflectionsreadfromfileylid.hkl;mean(I/sigma)=27.80Latticeexceptions:PABCIN(total)=01948195119811945N(int〉3sigma)=0189018781918Meanintensity-0.0109.2106.3103.4Meanint/sigma=0.027.826.728.0SelectOption[P]:ObvRevAll294025962604391018812843251425243780111.71063108.5110.310

7、8.827.727.527.827.727.8XPREP按照平均I/o(I)來确定一个晶格类型，但实际上山于较弱的衍則点其0(1)也可能较小，因而这个判断标推未必很徘确，平均强度值应该足一个更为准确的判断标准，芯某一项的平均强度远小于全部衍射点的平均强度时，就应该认为具有这祌品格的消光性质，即应选取这种品格，但标准却难以决定。4.寻找辰商对称性中.胞参数只足品体对称性的外在表现形式，衍射点的对称才是品休对称性的㈧在表现。扱然SMART屮也对品格类型进行判断，例巾于CCD中搜寻衍射点的对称性的代价较为吊贵，通常在收巣数据吋不检淵衍射点的

8、对称性，这样导致在收粜数据时所判断的对称性不准确，而irtr丁•此时进行指杯化的衍射点未必很好，导致某些轴之叫的偏肩比设定的偏筘大从而不能得到离正的对称性，即使选定的对称性比实呩的对称性耍低。而在SAINT以人枭的衍射点