单晶结构分析解析----原理与实践.pdf

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1、单晶结构分析的原理与实践陈小明蔡继文中山大学化学与化学工程学院X射线→→2003年3月单晶结构分析原理与实践目录常见符号的定义第一章引言(p.1-5)1.1.晶体的特征1.2.单晶结构分析简史1.3.单晶结构分析的重要性1.4.单晶结构分析的过程第二章衍射几何与结构因子(p.6-19)2.1.X射线与衍射几何2.1.1.X射线的产生2.1.2.衍射几何2.1.3.分辨率2.1.4.晶面与晶面指标2.1.5.倒易点阵2.2.衍射强度与结构因子2.2.1.原子散射因子2.2.2.原子的热振动参数2.2.3.结构因子与相角问题第三章晶体对称性与空间群（p.20-44）3.1.

2、晶格3.1.1.晶胞参数3.1.2.原子参数3.1.3七个晶系3.2.十四种布拉维晶格3.3.晶体的对称性3.3.1.简单对称元素3.3.2.对称元素的组合3.3.3.包含平移的对称性元素3.3.4.不对称单元3.4.空间群i3.4.1.空间群和劳埃群3.4.2.空间群的国际记号3.4.3.系统消光与空间群的测定第四章晶体培养与衍射实验(p.45-70)4.1.单晶的培养4.1.1.溶液中晶体的生长4.1.2.界面扩散法4.1.3.蒸汽扩散法4.1.4.凝胶扩散法4.1.5.水热方法4.1.6.升华法4.2.晶体的挑选与安置4.2.1.晶体的挑选4.2.2.晶体安置4.

3、3.四圆衍射仪与衍射数据的收集4.3.1.四圆衍射仪4.3.2.晶体对心4.3.3.取向矩阵的确定4.3.4.衍射峰形和扫描方法4.3.5.数据收集的范围4.3.6.监测点4.3.7.强度测定4.4.面探测器衍射仪与数据收集4.4.1.面探测器衍射仪的原理4.4.2.面探测器的衍射数据收集4.5.数据的还原与校正4.5.1.Lp校正4.5.2.标准不确定度4.6.吸收校正4.6.1.数字吸收校正4.6.2.基于ψ-扫描的经验吸收校正4.6.3.DIFABS方法4.7.衍射数据质量的检查与评估4.8.其他衍射方法第五章晶体结构解析(p.71-95)5.1.结构解析的过程与

4、相角问题5.1.1.结构解析的过程ii5.1.2.相角问题5.1.3.结构模型5.2.傅立叶合成5.2.1.傅立叶合成5.2.2.差值傅立叶合成5.3.帕特森法5.3.1.帕特森方法基本原理5.3.2.重原子坐标5.4.直接法5.4.1.哈克尔—卡斯帕不等式5.4.2.归一化结构因子5.4.3.塞尔方程式5.4.4.三重积关系式5.4.5.原点的固定5.4.6.确定相角的策略5.5.结构解析中的若干问题5.5.1.晶胞的错误确定5.5.2.空间群错误指认5.5.3.有问题的结构5.5.4.赝对称结构第六章结构精修(p.96-121)6.1.结构精修与最小二乘法6.1.1

5、.最小二乘法6.1.2.结构精修的参数26.1.3.基于Fo或Fo数据的精修6.2.权重方案与残差因子6.2.1.权重方案6.2.2.晶体学上的R值6.3.精修技巧6.3.1.初期的精修策略6.3.2.模型结构的完成6.3.3.氢原子的确定6.3.4.受限制的精修6.3.5.阻尼控制6.3.6.对称性限制6.3.7.残余电子密度iii6.4.结构精修中的若干问题6.4.1.原子的错误指认6.4.2.原子位移参数6.4.3.无序结构6.4.4.多种可能空间群之间的选择6.4.5.反常散射与绝对结构6.4.6.孪晶6.4.7.消光效应6.4.结构精修结果的检查第七章晶体结构

6、的表达（p.121-142）7.1.晶胞参数与分子式7.2.分子几何7.2.1.键长与键角7.2.2.键长与原子半径7.2.3.最佳平面、扭角与而面角7.3.分子间的作用7.3.1.氢键7.3.2.π−π堆积作用7.4.结构图7.5.结果数据表7.6.模拟粉末衍射花样7.7.电子密度第八章晶体学信息文件与程序资源（p.143-157）8.1.CIF的定义与产生方法8.2.CIF格式简介8.3.CIF实例8.4.晶体学数据库8.5.一些单晶结构分析与绘图程序简介第九章结构解析的实际例子（p.158-178）9.1.经典配合物与空间群P19.2.有机天然产物与绝对结构（构型

7、）的确定9.3.配位聚合物—空间群Cc与C2/c9.4.外消旋化合物与手性空间群9.5.含有多个分子的独立单元9.6.晶体结构与氢键及其表达iv9.7.具有孔洞结构的配位聚合物9.8.非缺面孪晶第十章SHELXTL程序与结构解析和精修（p.179-209）10.1.SHELXTL主要子程序简介10.2.XPREP10.2.1.XPREP的主要功能和应用10.2.2.空间群的确定10.2.3.定义晶胞中的化学组分10.2.4.吸收校正10.3.XS10.3.1.初始结构模型的建立10.3.2.设置和运行XS10.3.3.XS计算结果的评估1