中国汉族人群中stk39基因、mccc1lamp3基因与散发性帕金森病的相关性研究

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1、中南大学博士学位论文中国汉族人群中STK39基因、MCCC1/LAMP3基因与散发性帕金森病的相关性研究姓名：余日丽申请学位级别：博士专业：神经病学指导教师：唐北沙20120530八年制博±学位论文中文摘要摘要背景随着人类基因组计划的完成，GWAS广泛应用于探索复杂性疾病的遗传学研究，到目前为止，在各种人群的帕金森病(Parkinson’Sdisease，PD)的GWAS研究中已发现了数十种基因的多态与PD相关。最近国际帕金森病遗传协会(InternationalParkinsonDiseaseGenomicsConsortium)对5个美国人群和

2、欧洲人群的PD的GWAS研究进行meta分析，除了发现既往报道的位点外，还发现了5个新的位点：ACMSD、STK39(rs2102808)、MCCCl／LAMP3(rsl1711441)、SⅢJ和CCDC62／HIPIR基因。而后在一组犹太人群的GWAS研究中发现了更多的SNPs与PD相关，包括之前报道的位点，也有S础9(rs3754775)、LAMP3(rsl2493050)基因。因此，不同的GWAS研究同时发现S刀好9基因、MCCCl／LAMP3基因与PD发病相关，我们推测这两个基因很有可能为PD发病的易感基因。目的通过对中国汉族人群散发PD患

3、者及对照组的研究分析STK39基因的rs2102808、rs3754775位点，脚∞J『删御3基因的rsl1711441、rsl2493050位点与PD的相关性。方法本研究拟采用聚合酶链式反应和DNA直接测序法检测501例散发性PD及492例正常对照的基因型，分析S础9、加Ca删脚3基因相应位点是否与PD相关．。结果1)在rs2102808、rs3754775、rsl2493050位点的的检测结果中，八年制博士学位论文中文撼要发现基因型和等位基因在未分组人群、早发性PD、迟发性PD、男性PD、女性PD与相关对照组人群闻均无显著性差异性(P>0．01

4、25)；2)在勰11711441的检测结果中，发现基因型和等位基因来分组人群、早发性PD、迟发性PD、男性PD、女性PD与相关对照组人群间均有显著性差异性(p<0．001，OR

5、2493050位点与PD发病无相关性。关键词帕金森病，单核昔酸多态性，全基因组关联分析{重八年制博士学位论文英文摘要ABSTRACTBackgroundWiththecompletionoftheHumanGenomeProject，GWASarewidelyusedinexploringthegeneticstudiesofcomplexdiseases．Sofar,GWASofParkinson’Sdiseaseinvariouspopulationshavefounddozensofsinglenucleitidepolymorphismas

6、sociatedwithPD．Ameta-analysisofdatasetsfromfiveParkinson’SdiseaseGWASfromtheUSAandEuropefound1locithatsurpassedthethresholdforgenome—widesignificance(P<5×1O一8)，fivewerenewlyidentifiedloci似CMSD，STK39，MCCCl／LAMP3，SYTll，andCCDC62／HIPlR)．GWASoftheAshkenaziJewishpopulationalsoident

7、ifiedlocis：includingSTK39(rs3754775)、LAMP3(rsl2493050)gene。SincetheassociationbetweenSTK39、MCCCl／LAMP3geneandPDwasconfirmedindifferentpopulations，wesuspectedthatthetwogeneswerecandidategenesforPDprobably．Consideringthereisnosuchresearch，weconductedacase-controlcorhorttoclarify

8、theassociation．ObjectiveWeanalyzedtheassociationbetweenthefou