鮈亚科鱼类的分子系统发育关系研究

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1、万方数据Schoolcode：10246Studentcode：11210700005FudanUniversityAThesisSubmittedforDegreeofMasterPhilosophyStudiesonmolecularphylogenyoftheGobioninae(Teleostei：Cyprinidae)School：SchoolofLifeScienceSubject：ZoologyName：AnhuiChenSupervisor：Prof．CuizhangFuDate：May20

2、14万方数据—————————————————————』堕L—————一J脚Y舢2舢8舢6删5删6舢3册删6删一目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯i第一章绚亚科鱼类的系统发育关系研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯l1．1物种组成⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．11．2绚亚科鱼类的系统发育位置研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯ll1．3绚亚科鱼类属间系统发育关系研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯131．4立项依据⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．171．5研究目的⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．171．6研究思路⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．17第二章绚亚科鱼类的系统发育位置⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯～192．1研究方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．192．2研究结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯272．3讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．272．4小结⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．28第三章基于线粒体基因组证据的绚亚科鱼类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．29属间系统发育关系⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。293．1研究方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．293．2研究结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯443．3讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．473．4小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．48第四章基于核基因多位点证据的绚亚科鱼类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．49属问系统发育关系⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．494．1研究方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．494．2研究结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．574．3讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．604．4小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．6l结论

6、与展望⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯63参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一65万方数据目录附录硕士在读期问已发表、拟投稿论文及获奖情况⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一71致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一73万方数据摘要绚亚科Gobioninae鱼类隶属于辐鳍鱼纲Actinopterygii、真骨鱼部Teleostei、骨鳔总目Ostariophysi、鲤形目Cypfiniformes、鲤科Cyprinidae，包括30

7、属201种，主要分布在东亚。关于绚亚科鱼类的系统发育位置，形态与分子证据的研究间没有取得一致的结论，但是分子证据的研究均强烈支持绚亚科、鲡亚科Achcilognathinae、丁鲮亚科Tincinae、雅罗鱼亚科Leuciscinae与Oxygastrinae亚科鱼类形成单系群，但是这些亚科问鱼类的关系没有解析清楚。关于绚亚科鱼类属间系统发育关系，基于形态学证据的研究主要是对觞亚科鱼类进行了大类群的划分，然而没有取得一致的结论。基于分子证据的研究强烈地支持‘鲭属Hemibarbus+银绚属Squalidus

8、’谱系以及绚族Gobionini是单源群，然而鲸族Sarcocheilichthyini鱼类的单系性则缺乏统计支持度。因此，本论文聚焦于解析觞亚科鱼类的系统发育关系亟需解决的两个问题：1)约亚科在鲤科鱼类中的系统发育位置。2)绚亚科鱼类内部各属之问的系统发育关系。本研究基于线粒体基因组全序列与核基因多位点的分子证据，重建了拘亚科鱼类的分子系统发育关系。主要研究结果如下：1、约亚科鱼类的系统发育位置基于12个核基因