四倍体棉花纤维品质相关性状qtl定位及元分析

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1、分类号：$562．035密级：—尘五单位代码：羔迦竖学号：2Q!Q12四倍体棉花纤维品质相关性状QTL定位及元分析QTLMappingandMeta-analysisforFiberQualityTraitsinTetraploidCotton学位申请人：指导教师：学科专业：学位类别：授予单位：答辩日期：杨鑫雷张桂寅研究员作物遗传育种农学博士河北农业大学二。一三年五月二十六日独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得塑兰垦盔些盘

2、堂或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：锅磊雷签字日期：砌，弓年f月2罗日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解塑皇垦壅些盘堂有关保留、使用学位论文的规定，有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权塑皇堡垒些盘堂可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名：伽毳考导师签名：签字日期：w，弓年，月力同签字日期：学位

3、论文作者毕业后去向：工作单位：通讯地址：袱驾劢，弓年，月彭日电话：邮编：摘要棉花是全世界重要的经济作物。随着纺织技术的革新，改良棉花纤维品质性状就显得极其重要。本研究目的在于筛选不同来源的纤维品质性状相关QTL或者在不同遗传背景中能共同表达的QTL，并通过图谱映射和元分析为挖掘、寻找一致性QTL或真实性QTL，为图位克隆和分子标记辅助育种提供理论依据。主要包含三方面的研究内容：(1)以陆地棉标准系“TM．1”和具有陆地棉三元杂种血缘的“渝棉l号”组配高代回交自交群体BC4F2为研究材料，进行纤维品质性状的QTL筛选。并通过以陆地棉标准系“TM．1”为轮回亲本，“AcalaS

4、J”为供体亲本同样组配BC4F2群体，此群体为验证相同受体亲本定位获得的QTL在不同遗传背景下的表现：(2)以SSR标记和具有差异表达TDFs转录标记，加密BCl[(中棉所8号×Pima90．53)×中棉所8号1遗传图谱，通过复合区间作图法(CIM)重新分析上半部平均长度、整齐度指数、马克隆值、伸长率和断裂比强度等5个纤维品质性状的QTL；(3)以本实验室加密后的f(中棉所8号×Pima90．53)×中棉所8号】BCl遗传图谱为参考图谱，对本实验室已构建的F2和BClF2图谱进行标记整合，并将已定位的与纤维品质性状相关的QTL采用图谱映射寻找一致性QTL或QTL热点区。主要

5、结果如下：1、以3980对SSR引物、238对SRAP组合引物和85对TRAP组合引物对亲本TM．1和渝棉1号进行多态性筛选，共获得288对多态性引物，多态性比例为6．69％。本研究最终用于陆地棉种内图谱构建的SSR标记位点数为103个，SRAP和TRAP标记位点34个。图谱构建的连锁测验标准LOD值大于等于8．0，最大连锁距离设为50cM。119个多态性标记位点定位到26个连锁群上，标记间平均遗传距离为5．50cM，连锁图谱覆盖654．1cM，约占棉花基因组的14．70％。所得连锁群可以定位到14条染色体和3条未知连锁群上。通过复合区间作图法(CIM)对Popl群体纤维品

6、质性状进行QTL定位，共获得31个与纤维品质性状相关的QTL，其中纤维伸长率相关6个、纤维长度7个、马克隆值4个、纤维比强度5个、纤维整齐度1个、成熟度指数3个、短纤维指数5个，贡献率分别为17．77％．24．70％、14．01％一24．67％、22．57％．24．19％、20．43％．36．66％、22．9％、23．65％．24．65％、22．32％．24．37％。利用Pop2群体验证Popl定位获得的QTL，研究结果表明，在染色体24上发现1个与比强度相关的QTL与Popl中相同位置的QTL具有相同的标记区间(NAU5379．NAUll25)，贡献率为20．14％。2、

7、基于本实验室前期构建的[(中棉所8号×Pima90—53)×中棉所8号】BCl遗传图谱，标记位点209个。在此基础上增加了370个标记位点，通过作图软件MAPMAKER3．0对标记进行连锁分析，连锁图谱包含579个标记位点(LOD=4．0，最大遗传距离为50cM)，56个连锁群，标记间平均距离为7．2cM，覆盖全基因组4168．72cM。43个连锁群通过204个锚定标记被分配到26条染色体上，13个连锁群未被定位在特定染色体上，暂时命名为unknownl一13。采用卡方(x2)测验判断标记是否偏离(1：1)孟德尔分