放牧对布氏田鼠种群遗传多样性的影响

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1、索取号:Q341密级:公开硕士学位论文放牧对布氏田鼠种群遗传多样性的影响研究生:戴靖指导教师:徐来祥教授薛慧良教授培养单位:生命科学学院一级学科:生物学二级学科:遗传学完成时间:2016年3月10日答辩时间:2016年6月12日万方数据硕士学位论文生物学戴靖曲阜师范大学万方数据曲阜师范大学研究生学位论文独创性声明(根据学位论文类型相应地在“□”划“√”)本人郑重声明:此处所提交的博士□/硕士□√论文《放牧对布氏田鼠种群遗传多样性的影响》,是本人在导师指导下,在曲阜师范大学攻读博士□/硕士□√学位期间

2、独立进行研究工作所取得的成果。论文中除注明部分外不包含他人已经发表或撰写的研究成果。对本文的研究工作做出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确的方式注明。本声明的法律结果将完全由本人承担。作者签名:日期:曲阜师范大学研究生学位论文使用授权书(根据学位论文类型相应地在“□”划“√”)《放牧对布氏田鼠种群遗传多样性的影响》系本人在曲阜师范大学攻读博士□/硕士□√学位期间,在导师指导下完成的博士□/硕士□√学位论文。本论文的研究成果归曲阜师范大学所有,本论文的研究内容不得以其他单位的名义发表。本人完全了解

3、曲阜师范大学关于保存、使用学位论文的规定,同意学校保留并向有关部门送交论文的复印件和电子版本,允许论文被查阅和借阅。本人授权曲阜师范大学,可以采用影印或其他复制手段保存论文,可以公开发表论文的全部或部分内容。作者签名:日期:导师签名:日期:万方数据摘要摘要鼠害给我国畜牧业和农业生产带来严重危害,鼠害的发生具有一定的时空特异性,研究害鼠的种群数量波动机制有利于有效预防和控制鼠害的发生。布氏田鼠(Lasiopodomysbrandtii)是我国北方草原地区害鼠的优势种之一,其严重破坏草原植被,影响我国农

4、业和畜牧业生产。影响草原鼠害的因素较多,放牧是影响草原鼠害的主要原因之一,但放牧对内蒙古草原主要害鼠布氏田鼠种群数量的调控效应还不清楚,放牧是否会影响害鼠种群的遗传结构等一系列问题还未见报道。本研究以内蒙古草原动物生态研究站(JointResearchStationofAnimalEcologyinInnerMongoliaGrassland,JRSAEIMG)中度放牧处理围栏的布氏田鼠种群为实验材料,对照围栏的布氏田鼠种群作为对照,筛选10个布氏田鼠微卫星标记,检测中度放牧处理围栏及对照围栏中布氏

5、田鼠种群的遗传多样性,探究放牧对布氏田鼠种群数量及遗传多样性的影响。以围栏中布氏田鼠的脚趾为实验材料,用常规的酚/氯仿抽提法提取基因组DNA,用琼脂糖凝胶电泳和分光光度计检测基因组DNA;以所提取基因组为模板,筛选10个布氏田鼠微卫星标记的引物序列进行PCR扩增,对每个个体的每个微卫星标记位点进行基因分型,并对纯合子进行克隆测序,构建数据库,再利用Popgene软件对每个位点的等位基因数(Na),有效等位基因数(Ne),观测杂合度(Ho),期望杂合度(He),多态信息含量(PIC)等遗传多样性指数进

6、行统计分析。分析结果表明,中度放牧处理围栏在BVM02、BVM03、BVM04、BVM05、BVM06、Mb13n、Mb17n、Mb28n、Mb29n、Mb31n位点检测到的等位基因数分别为5,5,3,4,5,6,8,7,6,3;有效等位基因数分别为2.75,5.40,2.16,2.05,5.23,7.71,6.75,7.36,6.48,2.42;观测杂合度分别为0.64,0.71,0.54,0.51,0.51,0.67,0.85,0.66,0.65,0.59;期望杂合度分别为0.65,0.84,0

7、.55,0.53,0.83,0.89,0.88,0.89,0.87,0.60;多态信息含量分别为0.48,0.60,0.47,0.47,0.50,0.54,0.64,0.66,0.63,0.52;10个位点的平均等位基因数为5.20,平均有效等位基因数为4.83,平均观测杂合度为0.63,平均期望杂合度为0.75,平均多态信息含量为0.55。对照围栏在BVM02、BVM03、BVM04、BVM05、BVM06、Mb13n、Mb17n、Mb28n、Mb29n、Mb31n位点检测到的等位基因数分别为6,

8、7,8,6,5,7,10,9,8,8;有效等位基因数分别为4.86,6.82,6.98,5.26,3.81,4.69,7.96,6.24,5.88,6.43;观测杂合度分别为0.74,0.83,0.75,0.73,0.67,0.78,0.86,0.81,0.80,0.76;期望杂合度分别为0.81,0.87,0.87,0.82,0.75,0.80,0.89,0.85,0.84,0.86;多态信息含量分别为0.69,0.81,0.72,0.71,0.65,0.75,0.

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