结球甘蓝高密度遗传图谱构建及耐裂球、球色、球形基因定位

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1、分类号:单位代码:密级:学号:博士学位论文结球甘蓝高密度遗传图谱构建及耐裂球、球色、球形基因定位研究生:指导教师:刘玉梅研究员合作指导教师:沈火林肖兴国教授申请学位门类级别:农学博士专业名称:蔬菜学研究方向:蔬菜遗传育种与生物技术所在学院:农学与生物技术学院年月分类号:单位代码:密级:学号:博士学位论文结球甘蓝高密度遗传图谱构建及耐裂球、球色、球形基因定位研究生苏彦宾指导教师刘玉梅研究员合作指导教师沈火林肖兴国教授申请学位门类级别农学博士专业名称:蔬菜学研究方向:蔬菜遗传育种与生物技术所在学院:农学与生物技术学院

2、年月ChinaAgriculturalUniversityPh.D.DISSERTATIONConstructionofthehigh-densitygeneticlinkagemapandmappingofheadsplittingresistance,headcolorandheadshapeincabbagePh.D.Candidate:Yan-binSuSupervisor:Prof.Yu-MeiLiuProf.Huo-LinShenProf.Xing-GuoXiaoMajor:VegetableScie

3、nceResearchinterest:VegetableBreedingandBiotechnologyMay,2015独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中已经注明引用和致谢的内容外,论文中不包含本人和其他人巳经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得中国农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研宄所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。学位论文作者签名参》声时间:年丨了日关于学位论文使用授权的说明本

4、人完全了解中国农业大学有关保留、使用学位论文的规定。本人同意中国农业大学有权保存及向国家有关部门和机构送交论文的纸质版和电子版,允许论文被査阅和借阅;本人同意中国农业大学将本学位论文的全部或部分内容授权汇编录入《中国博士学位论文全文数据库》或《中国优秀硕士学位论文全文数据库》进行出版,并享受相关权益。保密的学位论文在解密后应遵守此协议)学位论文作者签名:时间:年广月导师签名:时间年力、縮略词表缩略词英文名称中文名称扩增片段长度多态性判别标准酶切扩增多态性序列十六烷基三甲基溴化铵加倍单倍体表达序列标签基于全基因组测

5、序基因分型球色球宽球形指数球高裂球指数耐裂球永久群体插入缺失连锁群标记辅助选择二代测序技术聚合酶链式反应数量性状位点随机扩增多态性标记限制性片段长度多态性单核苷酸多态性简单序列重复摘要叶球作为甘蓝的商品和食用器官,类型丰富、形态多样、营养价值高。近年来,市场上对其叶球的外观商品品质愈加重视,不仅要求甘蓝球形美观、球色绿、还要耐裂球、耐储运。目前有关甘蓝耐裂球、球色及球形相关性状的研究尚处于起步阶段,对其遗传规律、相关基因定位研究及耐裂新品种选育亟待进行。本研究在制定甘蓝耐裂球评价方法的基础上,比较不同耐裂球性甘蓝

6、细胞壁组分及相关酶代谢变化规律,初步探索外源喷施和对减缓裂球的影响;利用耐裂球、球色及球形存在显著差异的亲本配制巧,通过游离小孢子培养构建群体;以群体为试材,揭示耐裂球、球色及球形相关性状遗传规律;同时构建、图谱和基于群体重测序构建的超高密度图谱,结合两年重复表型数据对相关性状定位和基因预测。为深入研究叶球相关性状遗传机理及遗传改良和相关基因的克隆奠定理论基础。主要结果如下:制定了甘蓝耐裂球评价方法,通过对份甘蓝材料进行耐裂球鉴定,筛选获得不同耐裂性种质资源;不同耐裂球性甘蓝叶球生长发育期细胞壁组分含量及相关酶活

7、性变化规律不同,耐裂球甘蓝整个生长发育期纤维素、原果胶含量显著高于易裂球,而纤维素酶、果胶酶活性低于易裂球,且变化较缓和,这种差异在叶球成熟期表现最大;外源喷施及对易裂甘蓝无影响,从结球初期至叶球成熟多次喷施,能够减缓中耐材料的裂球率和裂球指数。以耐裂球、球色及球形相关性状存在显著差异的个高代自交系为亲本配置个通过游离小孢子培养技术构建了两个永久群体,结合主基因多基因混合遗传分离分析及相关性分析,明确了甘蓝耐裂球、球色及球形相关性状的遗传模式及重要农艺性状间相关关系。以上述群体为作图群体,构建了张传统遗传图谱。同

8、时,通过对其中一个群体及双亲全基因组重测序,结合生物信息学分析,构建了一张包含个位点个,平均每个包含个总长度为,平均图距为永久遗传图谱,该图谱是目前甘蓝类蔬菜最饱和的一张参考图谱,不仅可以用于甘蓝重要性状的精细定位、比较基因组学研究,还能够辅助甘蓝基因组序列的拼接、组装及纠错。利用上述图谱,结合两年的表型数据,共定位了个与耐裂球、球色及球形相关的,分布于甘蓝的条染色体上,

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