基于rna-seq技术的宫颈鳞癌转录组学研究

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1、？Ｗ：．广．＇．■．－＇—■？■ｒＭ京诚和皆聲從中固＃５钟令獻博±研究生学位论文臟北京协和医学院研究生院中国医学科学院－北京协和医学院博±研巧生学位论文学校代码：１００２３学号：Ｂ２０１２００１０２５博±学位论文基于ＲＮＡ－ｓｅｑ技术的宮颈鮮痛转录组学研究所院：北京协和医学院姓名：郭朋指导教师：向阳教授导师小组；朱宝利教授学科专业：妇产科学研究方向：妇科肿瘤完成日期：２０巧年５月Ｉ中国医学科学院－北京协和医学院谤±

2、研究生学位论文ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｒｏｆｉｌｉｎｏｆｃｅｒｖｉｃａｌｓｕａｍｏｕｓｃｅｌｌｃａｒｃｉｎｏｍａｐｇｑｂｙＲＮＡｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ乂ＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎＳｕｂｍｉｔｔｅｄ化ＰｅｋｉｎｇＵｎｉｏｎＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌ巧ｅＡｐｐｌｙｉｎｇｆｏｒｔｈｅＤｏｃｔｏｒａｌｄｅｒｅｅＭａｏｒｏｎＯｂｓｔｅｔｒｉｃｓａｎｄＧｙｎｅｃｏｌｏｇｊｇｙＢｙｅｎＧｕｏＰｇＵｎｄｅｒｔｈｅＧｕｉｄａｎｃｅｏｆ．．ＰｒｏｆＹａｎＸ

3、ｉａｎａｎｄＰｒｏｆＢａｏｌｉＺｈｕｇｇＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＯｂｓｔｅｔｒｉｃｓａｎｄＧｙｎｅｃｏｌｏｇｙＰｅｋｉｎＵｎｉｏｎＭｅ化ｃａｌＣｏｌｌｅｅＨｏｓｉ化１ｇｇｐＣｈｉｎｅｓｅ乂ｃａｄｅｍｏｆＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ＆ＰｅｋｉｎＵｎｉｏｎＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌｅｅｙｇｇＭ巧２０１５，Ｂｅｉｊｈｉｇ，ＣｈｉｎａＩＩ中国医学科学院－化京协和医学院博±研巧生学位论文目录中文摘要１４一－ＲＮＡｅ７第部分基

4、于ｓｑ技术的宫颈鱗癌和癌旁组织的差异表达基因分析前Ｓ７材料与方法１２２３４７５３参考文献５４－第二部分基于ＲＮＡｓｅｑ技术的宫颈鱗癌和癌旁组织的可变剪接分析６８６８Ｉｔ胃材料与方法７３结果７７ｉｍ８６结论８９９０９９论文综述１００英文缩略词１１４攻读博±期间论文发表和基金资助情况１１６致谢１１７学位论文独创性声明及版权使用授权书１１８Ｉ凸中国医学科学院－北京协和医学院博±研巧生学位论文中文

5、搪要一第部分基于ＲＮＡ－ｓｅｑ技术的宫颈鱗痛和癌旁组织的差异表达基因分析目的：一宫颈癌是妇科最常见的恶性肿瘤之，居女性癌症患者死亡原因的第４位。除ＨＰＶ感染外，被感染细胞的基因组异常才能最终导致宫颈癌的发生发展，因此与细胞生长分化相关的基因表达调控异常在宫颈癌的发病机制中同样具有重要作用。转录姐是基因功能及结构研究的基础和出发点－ｓｅ。本研究拟应用ＲＮＡｑ技术全面分析宫颈鱗癌组织和癌旁组织的转录组，筛选出差异表达基因，进而分析差异表达基因的相互作用、涉及的信号通路、（＾］？及差异表达基

6、因与宫颈鱗癌临床病理因素的相关性，寻找可能的宫颈鱗癌诊断的分子标记物和帮向治疗目标，为宫颈癌的诊治提供实验依据和理论基础。方法：ｃＤＮＡ－构建文库后，应用ＲＮＡｓｅｑ全面分析３对宫颈鱗癌和对应癌旁组织的转录组，筛选出宫预鱗癌组织和癌旁组织的差异表达基因。应用ＧＯＧｅｎｅＯｎｔｏｌｏ法（ｇｙ访分析差异表达基因的功能聚类，应用ＫＥＧＧ（ＫｙｏｔｏＥｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａｏｆＧｅｎｅｓａｎｄＧｅｎｏｍｅｓ）信号通路富集性方法分析差异表巧基因相关的信号通路。构建蛋白质相互作用网络，分

7、析差异表达基因之间的相互作用，筛选出重要的差异表达基因。应用实时蒙光定量ＰＣＲ和免疫组化的方法验证宫颈鱗癌组织和癌旁组织的差异基因的表达水平，并分析差异基因与宫颈鱗癌临床病理因素的相关性。结果：一３对宫颈鱗癌组织和癌旁组织共有３４７个差异表达基因，包括１０４个表达致上一调的基因、１４８个表达致下调的基因３４７个差异表达基因被分为７３，。个功能聚类一一１０４个表达致上调的差异表达基因被分为３４个功能聚类，１４８个表达致下调的差异表法基因被分为８０个功能聚类。通过ＫＥＧＧ信号通路富集性分析，我

8、们发现差异表达基因富集到６条信号通路上－，包括细胞因子细胞因子受体相互作用信号通路、１中国医学科学院－北京协和医学院博±研巧生学位论文补体系统及凝血相关信号通路、视黄醇代谢相关信号通路、趋化因子相关信号通路、细胞色素ｐ４５０外源性物质代谢相关信号通路、黑素原生成相关信号通路。蛋白质相互作用网络分析发现Ｈ个重要的差异表达基