番鸭呼肠孤病毒感染的分子致病机制的转录组学研究

番鸭呼肠孤病毒感染的分子致病机制的转录组学研究

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2、的互作指导教师;张彥定教授f.^申请学位级别:博±研究生论文提交日期:2015年12月8日论文评阅人:直室论文答辩日期:2015年11月30日答辩委员会主席一帆教授:黄学位授予单位:福建师范大学学位授予日期:2015年12月19日"*-2015年12月界\:兰餐1%\公—4'.?.?t,fl挙巧编马10394图书分类号0959.9学与R2m"in密级么开@巧走巧必火學全日制学术学位研究生博±学位论文番鸭呼肠孤病毒感染的分子致病机制的转录

3、组学研究TranscritomicsanalsisofthemolecularpyathoenicmechanismofMuscovyduckpgreovirusinfection王全溪学科专业:动物学研究方向:宿主与病原的互作指导教师;张彥定教授申请学位级别:博壬研究生论文提交日期:2015年12月8日论文评阅人:论文答辩日期:2015年n月30日答辩委员会主席一帆教榜:黄学位授予单位:福建师范大学学位授予日期15年12月19日:202015年12

4、月中文摘要中文摘要番鸭呼肠孤病毒(Muscovyduckreovims,MDRV)是近10年来发现的引起維番鸭较高发病率和死亡率的病毒。肝脏和脾脏是MDRV感染的主要範器官。为探讨,本研究W肝脏和脾脏为主要研究对象MDRV感染的分子致病机制,应用转录组学方法,对10日龄番鸭转录组进行测序、组装和注释;筛选和分析了MDRV感染后肝脏和脾脏的差异表达基因,并对差异表达基因进行了功能分析;最后对MDRV感染激活机体先天性免疫功能,诱导细胞调亡的分子机制和导致肝脏脂肪变性的分子机制进行了分析和验证。研

5、究结果阐明了MDRV感染的分子致病机理,主要结果如下:1.本研究得到总长度17G的转录组序列,组装得到65,535个Unigenes,平均长度%7bp;COG注释共获得41,651个Unigenes的注释,包含25个生物学功能。2.MDRV感染5日龄维番鸭后第5天,差异表达基因筛选发现,脾脏有1,352个基因表达量上调,4,906个基因表达量下调;GO显著性富集分析表明,这些基因共参与了48个生物学功能,KEGG显著性富集229个Pathw巧。31.差异表达基因筛选发现巧脏有4190个基因表达量上调

6、,113个基因下调。,,GO显著性富集分析表明,这些基因共参与了48个生物学功能,KEGG显著性富集237个Pathw巧。4.MDRV感染肝脏和脾脏差异基因的比较分析发现,脾脏的差异表达基因W下调为主,350,GO功能,肝脏W上调为主两个器官的共有差异表达基因1,个分析表明,送些共有差异表达基因参与了42个生物学功能,KEGG功能分析表明,共有差异表达基因涉及的免疫功能的有炎症因子,先天性免疫功能,抗原提呈过程等。共有差异表达基因的获得将为进一步阐明MDRV感染的致病机理提供了有力的依据。5MD

7、RV感染上调了脾脏中模式识别受体RIG-A.KEGG分析表明,,I,MD5,TLR---1,TLR2,TLR4的表达来识别MDRV,活化IRF7促进I型IFN的分泌和调-JAK-STAT信号节NF成信号通路促进炎症因子IL6的分泌,激活,刺激IFN的分-PCR验证泌,增强机体先天性免疫功能。结果经Q,证实转录组数据准确可靠。6.TUN化法和流式细胞术证实,MDRV感染诱导了巧脏细胞调亡。KEGG分析as-民P表明,MDRV感染通过激活了F信号通路,正1信号通路,抑制了I3K/AKT信号I中文摘要e

8、stern-通路诱导细胞调亡。Wblot和QPCR验证表明。,转录组数据准确可靠><7.MDRV感染肝脏中脂肪酸含量极显著的増加(/0.01,从而诱导肝脏脂肪)变性。KEGG分析表明,MDRV感染抑制了肝细

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