四川猪流行性腹泻病毒流行株s基因的分子特征与s蛋白抗原性的初步分析

四川猪流行性腹泻病毒流行株s基因的分子特征与s蛋白抗原性的初步分析

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1、A类号S855.3学号%0123巧Q四川巧业大学碱:ir学位论文-r?,...1.四川猪流行性腹泻病毒流行株S基因的分子特征与S棄白抗原性的初步分析邓丽搪导教师黄小波教授_—义也田教授曹H杰教授预防兽医学'专业名称研巧方向动物传染病'^:,皆,2015年6月.'-Vf...■中‘.卢‘''..?*-i...:..SichuanA.ricu11ura1

2、gUniversityDISSERTATIONSubmittecHn化rtialFulfillmentof化eRequirementforMASTERDegreeMolecularcharacteristicsanalysisofporcineepidemicdiarrheavirusfieldstrainsSeneinSichuanandgpreliminaryanalsisoftheantienicitofSroteiny

3、gypByDenLigDirectedbyProf.HuanXiaobogProf.WenXintianProf.CaoSaniejYaanSichuan,June2015本研究受下列基金项目资助特此表示感谢国家自然科学基金项目(项目编号;No.31072144)NationalNaturalScienceFoundationofChina(NNSFOC,PROJECT:No.31072144)论文独创性声明

4、本人郑重声明:所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知,除了文中特别加W标注和致谢的地方外,学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得四川农业大学或其它教育机一构的学位或证书所使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。么,研究生签名:〇年月日//9P夕7/关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定,目P:学校有权保留并向国家有关部口

5、或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅,可W采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。^论文不保密。□本论文保密,在年解密后适用本授权。""(请在W上□内划v)研究生签名;年少月/方日/导师签名1心/年^月日本1^(^/^摘要猪流行性腹泻(PorcineEpidemicDiarrhea,PED)是由猪流行性腹湾病一毒(Porcine时idemicDiarrhea

6、Vims,PEDV)弓旭的种髙度接触性肠道传染疾病。自2010年W来:PEDV,感染已成为全球养猪业共同关注的问题。及时掌握PEDV流行毒株的分子特征,对指导该病具有重要意义。S基因编码的S蛋白是PEDV的重要结构蛋白,在诱导机体产生中和抗体和提供免疫保护等方面起关键作用,S基因较易发生变异。本研究对四川2014年PEDV流行毒株的S基因(包括S基因全序列和部分序列)进行克隆、测序和分子特性分析。,初步分析了流行株的S基因抗原性(包含COE区的抗原区域)研究内容如下:(

7、1)四川PEDV流行株S基因的克隆与分子特征分析WRT-PC艮检测了四川14个地区的17个猪场的102份发病仔猪腹泻样本,猪场PEDV阳性率法到100%(17/17,样品PEDV阳性率为88.2%99/102)。PEDV多为单独感染。根)(PEDV-CV777株序(GenBan据列k登录号:AF353511)设计3对引物扩增完整的S基因,选取2014年四川地区PEDV代表样品扩増了9株S基因全序列和18-S-株1区(起止位点:l1389nt),采用RTPCR扩增S基因、克隆、测序和序

8、列分析。1811结果表明:S基因S1片段变异较大,株流行株S片段全长为39抓P,-6-^T^编码46个氨基酸,存在大量核巧酸的突变、插入及缺失,多WC、TC、-^-^GT、TG等突变形式存在。9株完整S基因中,8株全长为4161咕,编码1386个氨基酸,1株为4125bp,编码1374个氨基酸。PEDV四川流行株么间核巧酸序列同源性及氨基酸序列同源性均较高-L株及CV777疫苗株等的同,与SC-1源

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