五种螟蛾线粒体基因组序列的测定及螟蛾总科系统发育研究

五种螟蛾线粒体基因组序列的测定及螟蛾总科系统发育研究

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时间:2019-03-20

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1、分类号Q969密级学号122006硕it学位论文(学术型)题目五种暢蛾线粒体基因纽序列的测定及慎蛾总科系统发育研究曰作者宋曰耳眷指导教师尤平教授-级学科名称二级学科名称动物学,提交日期二〇—五年五月????学位论文原创性声明本人声明所呈交的学位论文是我在导师的指导下进行研巧工作巧取得的研巧成果。尽我所知,除文中已经注明引用的内容和致谢的地方外,本论文不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研巧成果,也不包含本人或他人已申请学位或其他用途使用过的成果。对本文

2、的研巧做出重要贡献的个人和集体,均已在文中作了明确说明并表示谢意。本学位论文若有不实或者侵犯他人权利的一切相关的法律责,本人愿意承担任。作者签名:日親年(T月日学位论文知识产权及使用授权声明书本人在导师指导下所完成的学位论文及相关成果,知识产权归属陕西师范大学。本人完全了解陕西师范大学有关保存、使用学位论文的规定,允许本论文被査巧和借巧,学校有权保留学位论文并向国家有关部口或巧构送交论文的纸质版和电子版,有权将本论文的全部或部分内容编入有关巧据库进行检索,可采用任何复制手段保存和汇编本论文。本人保证毕业离校后,发表本论文或

3、使用本论文成果时署名单位仍为陕西师范大学。保密论文解密后适用本声明。作者签名:曰期:^月曰氏年勺摘要頓蛾总科是鱗翅目的第二大类群,其大多数种类都是农林及仓储害虫,特别是钻虹类頓蛾。大面积的虫害给农林业造成严重的经济损失,因此頓蛾类昆虫的防治一直是相关研究的重点。随着分子生物学研究技术的发展,线粒体基因组的研究在嗔蛾总科中逐渐开展,但主要集中在单个的线粒体基因细的特点分析,很少有对螺蛾总科昆虫的线粒体基因组特点及系统发育关系进行全面深入的分析。LA-PC民w本研究通过技术结合引物步移法,对褐巢頓//>p巧知〇reg加〇、黄

4、纹'sew沁■妃银草峽P卿喊unkrr卿e//o、巧斑薄翅喫扔6巧65ywnc/a妃、搭黑纹野頓?如口notfessfrw化和立caV曲(3的线粒体助英野頓M,并jTO基因组序列进行测定对上述5种新序列进行注释分析。联合GenBank中己释放的20种腹蛾总科昆虫的线粒体基因组数据,对嗔蛾总科昆虫线粒体基因组进斤比较分析,并蛋白质编码基因(PCGs)为数据集,W雅库己果蛹Omw抑舶姑6口为外群,利用最大似然法和贝叶斯推理法对頓蛾总科的系统发育关系进行重建并探讨分析。所得主要结论为:1.褐巢頓、黄纹银草頓、双斑薄翅鳴、澄黑纹野頓巧豆

5、芙野曠线粒体基因组全序列长度分别为15212bp、15231bp、15438bp、15255bp和15200b,其中豆p芙野頓为目前已测頓蛾总科昆虫完全序列中最短的物种。线粒体基因组的组成和结构与己报道的換蛾总科昆虫一NA致,为闭合环状双链D分子,包括13个蛋白一质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和个A+T富集区。与鱗翅目骗Met"ea"幅蛾等原始类群昆虫相比-A,tRNA基因的排列顺序有差别,即由tRNAtRNMeteMt"eSi"---tRNAtRNAtRNAtRNA。变为Ab2.双斑薄翅頓

6、全线粒体基因组,除A+T富集区非编码区外,在基因tRNA^^as和tRNA、ND3和tRNA之间分别存在ii4bp和62b的基因间隔,其均为插pPm入的串联重复序列;在tRNA和ND6之间存在长达88b的基因重叠序列。p3.5种嗔蛾线粒体基因组的碱基组成均具有明显的AT偏向性,其中褐巢頓的AT含量较低,为78.65%燈黑纹野螺的AT含量最高,为81.%%豆英野頓、黄;;纹银草頓和双斑薄翅螺的at含量分别为80.%%、79.40%和81.08%。4.蛋白质编码基因的起始密码子的使用情况;5种頓蛾的COI基因均WCGAI起始,其余基

7、因则WATN起始;终止密码子的使用:5种頓蛾的coil基因都W单独的T终止,黃纹银草換的ND5基因不完全终止密码子TA终止,其他的PCGs则W完全终止密码子TAN终止。二S"5.5种曝蛾的tRNA级结构,除基因tRNAAGN的二级结构缺DHU臂外,()其余2一1个tRNA均能形成典型的兰叶草结构。且tRNA二级结构存在定数量的--碱基错配-,包括UU和GU两种类型,主要为GU错配。6.5种頓蛾的A+T富集区具有极高的AT含量、、,褐巢暢黄纹银草嗔双斑薄通換、穫黑纹野螺和豆英巧換分别为94.86%、90.99%、94.30%、94.

8、51%和93说%。并

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