资源描述：
《DNA分子标记在真菌系统分类与鉴定中的应用》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第21卷第4期内蒙古民族大学学报(自然科学版)Vol.21No.42006年8月JournalofInnerMongoliaUniversityforNationalitiesAug.2006DNA分子标记在真菌系统分类与鉴定中的应用X于秀英,张宁(内蒙古民族大学农学院,内蒙古通辽028042)摘要:近年来分子生物学技术的发展,为从核酸分子水平上研究真菌的遗传本质,为真菌的进化研究、系统分类和鉴定开辟了新的途径.概述了几种主要的DNA分子标记的基本原理和特点,以及在真菌鉴定与分类中的应用.关键词:DNA;分子标记;真菌;鉴定;分类中图分类号:R
2、34文献标识码:A文章编号:1671-0185(2006)04-0411-05ApplicationofDNAMolecularMarkersinSystematicClassificationandIdentificationofFungiYUXiu-ying,ZHANGNing(InnerMongoliaUniversityforNationalities,Tongliao028042,China)Abstract:Withtherapiddevelopmentofmolecularbiology,DNAmolecularmarkerest
3、ablishedanewmethodinstudyinggenomeessence,evolution,classificationandidentificationoffungi.Inthispaper,wesummarizesthebasicprinciplesandcharacteristicsofafewtypesofmolecularmarkers,aswellastheirapplicationindiscerningandclassifyingfungi.Keywords:DNA;Nolecularmarker;Fungi;Ide
4、ntification;Classification真菌传统鉴定方法是通过对其形态学、生物学、生理学的描述,对照已有的研究资料确定其分类地位,但真菌的形态特征复杂,而且少数形态特征和生理生化指标随着环境的变化而不稳定,因此,在传统的真菌分类中常引起分类系统的不稳定或意见分歧.进入八十年代以来随着生物技术的发展,核酸技术为植物病原真菌检测开辟了一条新的有效途径,它可用于真菌种的鉴定,但是更多的是用于亚种、变种、专化型和〔1〕生理小种水平上的鉴定.DNA分子标记大多以电泳谱带的形式表现,依其所用的分子生物学技术,大致可以分为以Southern杂交技
5、术为核心的分子标记和以PCR技术为核心的分子标记.1基于Southern杂交技术的分子标记此类标记技术是利用限制性内切酶酶解及凝胶电泳分离不同的生物DNA分子,然后用经标记的特异DNA探针与之进行杂交,通过放射自显影或非同位素显色技术来揭示DNA的多态性,主要有RFLP和VNTR.1.1RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)限制性片段长度多态性RFLP出现最早,也称为第一代DNA分子标记,其原理是检测DNA在限制性内切酶酶切后形成的特定大小的DNA片段.由于不同来源DNA的特定的限制性内切酶酶切位
6、点分布不同,每一种DNA与限制〔2〕性内切酶酶切所产生的片段大小都是特异的,从而产生多态性.X收稿日期:2006-06-11作者简介:于秀英(1973-),女,内蒙古敖汉旗人,讲师,硕士,从事植物病理学研究.412内蒙古民族大学学报2006年研究表明RFLP可有效地检测植物病原真菌的种内遗传分化,可用于区分病原真菌的近缘种、小种、专化型,也可用于比较不同地理区域病原的群体遗传结构及病害的流行趋势.Forseter和Kinscherf用Phytophthora属的几个种的14个分离体的mtDNA作材料,根据条带差异,提出P.megasperma包
7、括了〔3〕几个生物学种的观点.另外,近年来在植物病害的早期诊断上,PCR-RFLP得到了大量应用.如张宝俊〔4〕等应用PCR-RFLP检测程序成功地检测出处于侵染初期和潜育期的枯萎病菌,秦旭升等运用PCR-〔5〕RFLP标记检测南瓜疫病菌也获得了成功.1.2VNTR(VariableNumberofTandemRepeats)串联重复变异值真核生物DNA存在大量的串联重复序列的高变异区,可采用VNTR标记技术区分小卫星或微卫星序列的差异.VNTR基本原理与RFLP大致相同,但要求限制性内切酶的酶切位点必须不在重复序列中,以保证小卫星或微卫星的序
8、列的完整性,也可使卫星序列所在片段含有较少无关序列,通过电泳可充分显示不同长度重复序列片段的多态性.分子杂交所用DNA探针核苷酸序列也必须是小卫星或微
