dna分子标记在木耳属真菌中的应用研究进展_杨晓兵

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1、第8卷第3期菌物研究Vol18No132010年9月JournalofFungalResearchSep.2010DNA分子标记在木耳属真菌中的应用研究进展XXX杨晓兵,宋慧,刘麒,李胜南,潘祖桐(吉林农业大学生命科学学院,长春130118)摘要:介绍了目前已在木耳属真菌中广泛应用的几种DNA分子标记技术(RFLP、RAPD、AFLP、ISSR、SRAP、SCAR、ITS、IGS),以及这些标记在木耳属真菌系统发育、分类研究、种间和种内鉴定、遗传多样性分析等方面的应用,并展望了这些标记技术在木耳属真菌中的应用前景

2、。关键词:木耳属;系统发育;遗传多样性;基因定位中图分类号:Q949132;S64616文献标识码:A文章编号:1672-3538(2010)03-0181-06ApplicationProgressofDNAMolecularMarkersinAuricularia**YANGXiao-bing,SONGHui,LIUQi,LISheng-nan,PANZu-tong(CollegeofLifeScience,JilinAgriculturalUniversity,Changchun130118,China)A

3、bstract:AcoupleofDNAmarkingtechnologies(RFLP,RAPD,AFLP,ISSR,SRAP,SCAR,ITS,IGS)areanalyzed.ThesemarkershavebroadapplicationsinAuriculariainthefollowingareas:phyloge-ny,categorization,inter-&intra-speciesidentification,geneticdiversityanalysis,etc.Theprospectso

4、fthesemarkersarealsoforecast.Keywords:Auricularia;phylogeny;geneticdiversity;genelocation全世界共有木耳属真菌约15个种,几乎所有标记技术具有操作简单、时效性强等优点。自[1-2]的种在我国都有分布,其中栽培最广泛的是黑1974年Grodzicker等创立限制性片段长度多态性木耳[Auriculariaauricula(L.exHook.)Underw]。(PFLP)技术以来,已有数十种DNA分子标记相继黑木耳质地滑嫩、脆鲜,

5、营养丰富,是我国传统的出现。根据原理不同,分子标记大致分为以下出口产品,产量占世界总量的96%以上,居世界3类。(1)基于分子杂交技术的分子标记,如[3]之首。东北三省作为黑木耳主产区,种质资源RFLP;(2)以PCR为基础的分子标记,包括随机扩[4]十分丰富,在全国黑木耳生产中占有重要地位。增多态性DNARAPD扩增片段长度多态性但是,目前我国菌种管理相对落后,同物异名、同(AFLP)、简单重复序列间区(ISSR)、相关序列扩名异物等现象比较严重,制约了我国食用菌种质增多态性(SRAP)等;(3)以DNA序列分

6、析为支资源的开发利用,因而构建并完善一个管理统一、撑,如SSUrDNA、LSUrDNA、内转录间隔区(ITS)、规范的菌种数据库具有重要意义。基因内间隔区(IGS)等。常用标记如下:DNA分子标记是反映生物个体或种群间基1基于分子杂交技术的标记)RFLP标记因组某种差异的特征性DNA片段。相对于形态鉴定、生化标记(主要是同工酶标记),DNA分子RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymor-X作者简介:杨晓兵,男,硕士研究生,主要从事食药用真菌分子标记遗传多样性的研究。收稿日期:201

7、0-04-25XX通讯作者:宋慧,E-mail:songhuinongda@163.com182菌物研究2010年phism)是Grodzicker于1974年发明,1980年由列上,使得引物之间的区域得到扩增,PCR产物的[5]David等再次提出的发展最早的DNA标记技多态性可以作为物种鉴定的依据。其优点是不需术。基于不同个体的等位基因之间碱基的缺失、要分子杂交等复杂的操作步骤,简便迅速,成本重排、插入等,造成限制性酶切位点发生改变的原低,灵敏度高,但是随着其广泛应用,其稳定性较理,通过检测DNA限制性内切酶

8、酶切产生的片段差的特点也逐渐突显出来,因而在利用RAPD标长度的多态性,来确定不同个体之间的亲缘关系。记时,应尽量使用同一批次的药品、试验材料和试这些差异同样可以作为木耳属真菌分类的依据来验仪器,甚至是相同试验人员操作。目前,RAPD鉴别不同菌株之间的遗传关系。技术已广泛应用于蕈菌种间与种内遗传多样性分RFLP技术的基本步骤包括:DNA的提取、限析、分类鉴定和系统发育研究

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