修饰动物模型的建立及应用

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时间:2019-06-29

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1、第二十二章常用分子生物学技术的原理及应用ThePopularTechnologyinMolecularBiology:PrincipleandApplication生物科学与技术学院第一节分子杂交与印迹技术MolecularHybridization&BlottingTechnology核酸分子杂交(nucleicacidhybridization)一、分子杂交与印迹技术的原理复性RNADNA核酸分子杂交的原理带有某种标记的核酸单链作为探针,在一定条件下,按碱基互补配对原则与互补的核酸单链退火形成双链杂交体,鉴定靶序列的存在、分子大小或进行靶序列的相对定量分

2、析。核酸分子杂交的杂交动力学核酸分子杂交核心序列形成自发过程(一)印迹技术(二)探针技术探针(probe)探针的来源基因组DNA探针cDNA探针RNA探针寡核苷酸探针二、印迹技术的类别及应用(一)DNA印迹技术(Southernblotting)(二)RNA印迹技术(Northernblotting)(三)蛋白质的印迹分析(Westernblotting)其他斑点印迹(dotblotting)原位杂交(insituhybridization)DNA点阵(DNAarray)DNA芯片技术(DNAchip)核酸杂交技术(一)SouthernBlot原理用途:检测

3、样品中的DNA及其含量,了解基因的状态,如是否有点突变、扩增重排等。SouthernBlot操作步骤:DNA琼脂糖电泳印迹转移预杂交杂交(变性探针)洗膜放射自显影或显色斑点印迹杂交(Dotblot)斑点印迹优点-----简单、迅速;核酸粗提、多样品检测缺点-----不确定分子量、特异性不高,假阳性原位杂交(InSituhybridization)标记的核酸探针与组织切片或细胞中的待测核酸中的互补序列杂交。1969,Pardue--爪蟾核糖体基因探针1970,Orth---兔乳头状瘤病毒cDNA探针WesternBlot原理操作过程SDS-PAGE电泳转膜(P

4、VDF或硝酸纤维素膜)封闭一抗洗涤酶标二抗反应洗涤显色或化学发光显影Hours04816WesternblotanalysisofthecleavageofCaspase-3/Bcl-2.Cellsweretreatedwith20Mofgossypolfor4,8and16h.Aftertreatment,cellswereharvestedandlysedinlysisbuffer.50ugofproteinwasloadedineachlaneandtheexpressionofactinwasdetectedasaloadingcontrol.注意

5、的问题蛋白质电泳常用SDS-PAGE非变性PAGETris-Tricine胶中电泳聚丙烯酰胺具有神经毒性,操作时要戴手套三种印迹技术的比较分子杂交实验①②③目录放射自显影照片目录DNA芯片:(Bio-chip、DNAarrays、Oligonucleotidemicrochip)特点:高度并行性,多样性,微型化和自动化。DNA芯片AssayFormatsNormalSample1.ExtractgenomicDNAfromtissue4.HybridizetoChip5.WashandImage2.LabelGenomicExpression1.Extrac

6、tmRNAfromtissue2.ProducecDNAbyRT&Label4.HybridizetoChip5.WashandImage3.MixwithlabeledreferenceDNA3.MixwithlabeledreferencecDNATumorSampleDNAmicrarrayrobotenclosedinatemperatureandhumiditycontrolledenvironment.ResearchUse—— FromSequencetofunction计算Ratio值(=Cy3/Cy5)在0.5-2.0之外的定义为在两样本中

7、有明显差异表达。进而获取初步功能信息。Clustering芯片杂交结果示意图DNA点阵目录DNA芯片技术的主要应用①分析基因组、发现新基因②基因表达的研究③DNA序列分析④基因诊断⑤基因药物设计第二节聚合酶链反应PolymeraseChainReactionPCR技术发展简史(1)PCR的最早设想(2)PCR的实现1985年美国PE-Cetus公司人类遗传研究室的Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应。(3)PCR的改进与完善耐热的DNA聚合酶TaqDNA聚合酶于1988年saiki从嗜热水生菌thermusaquaticsYT-1株中直接分离出来

8、。该菌株于1969年从美国黄石国家森林公园火山温泉中

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