真核基因组DNA的分离纯化

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1、真核基因组DNA的分离纯化核酸包括DNA、RNA两种分子,在细胞中都以与蛋白质结合的状态存在。真核生物的染色体DNA为双链线性分子,原核生物的染色体DNA、质粒及真核细胞器DNA为双链环状分子;有些噬菌体DNA为单链环状分子;大多数生物体内RNA分子均为单链线性分子并具有不同的结构特点,如真核生物mRNA分子多数在3'端带有polyA结构。分离纯化核酸总的原则:①应保证核酸一级结构的完整性(完整的一级结构是保证核酸结构与功能研究的最基本要求);②排除蛋白质、脂类、糖类等其他分子的污染。③无其他核酸分子的污染(如抽提DNA分子时应去除RNA分子)。分离核酸应注意以下

2、几点:①减少化学因素对核酸的降解,②减少物理因素对核酸的降解:③防止核酸的生物降解:进行核酸分离时最好新鲜生物组织或细胞样品,若不能马上进行提取,应将材料贮存于液氮中或-70℃冰箱中。核酸提取的主要步骤:一般为破碎细胞,去除与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂类等生物大分子,去除其他不需要的核酸分子,沉淀核酸以去除盐、有机溶剂等杂质,最后得到纯化的核酸。一、外周血白细胞DNA提取(NaI法)【实验目的】掌握NaI法提取外周血白细胞DNA的原理和方法。【实验原理】从全血制备白细胞DNA,可用双蒸水溶胀红细胞及白细胞膜,释放出血红蛋白及细胞核,使核酸处于易提取状态,加NaI

3、破核膜并使DNA从核蛋白中解离,用氯仿/异戊醇抽提使蛋白质沉淀完全(异戊醇去泡沫),DNA存在于上层水相中,以37%异丙醇沉淀DNA,离心弃去异丙醇,并重复操作一次,即可获得白细胞DNA。【实验材料】1、高速离心机。2、各种所需试剂【实验方法】1.取新鲜抗凝血100μl置EP管中,离心10000r/min×1min。2.弃上清,加ddH2O200μl,摇匀20s。3.加6mol/LNaI200μl,缓慢倒置摇匀20s。4.于管内加氯仿/异戊醇(24:1)400μl,摇匀20s,离心12000r/min×12min。5.吸取上层水相360μl置一新Ep管中,加纯异丙

4、醇200μl,摇匀20s。6.室温放置15min,离心14000r/min×12min。7.小心弃去上清,再加37%异丙醇1ml(勿摇动),离心14000r/min×12min。8.小心弃去异丙醇,晾干。9.加50μlTE缓冲液溶解DNA,以琼脂糖凝胶电泳鉴定或-20℃保存。【注意事项】1.标本必须新鲜,提取前细胞应保持完整。所用EP管、吸嘴等器物及ddH2O、试剂等应高压灭菌,操作尽量在4℃以下进行。2.混匀试剂、吸取上清等操作时应避免动作剧烈。3.弃异丙醇时动作应轻,切忌甩干,以免DNA丢失。4.0.54~1倍的异丙醇可选择性沉淀DNA和大分子rRNA和mRN

5、A,tRNA及多糖不产生沉淀。一般不需在低温条件下放置。其缺点是易使盐类与DNA共沉淀;在DNA沉淀中的异丙醇难以挥发除去,所以常规需要70%的乙醇漂洗DNA沉淀物。

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