DiscoveryStudio药物发现与生物大分子计算模拟平台

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1、个人电脑上的全新分子建模环境，专业的生命科学分子模拟软件『PDF资料下载1DiscoveryStudio™（简称DS）,棊于Windows/Linux系统和个人电脑、面向生命科学领域的新一代分子建模和模拟环境。它服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家，应用于蛋白质结构功能研究，以及药物发现。为科学家提供易用的蛋白质模拟、优化和药物设计工具。通过高质量的图形、多年验证的技术以及集成的环境，DS将实验数据的保存、管理与专业水准的建模、模拟工具集成在一起，为研究队伍的合作与信息共亨提供平台。建立在最新的流程管理平

2、台PipelinePilot棊础上的DS让数据的共享和交流变得更为方便和简洁。DS中的部分功能流程（protocols）可以在PipelinePilot中进行编辑和组合，编辑组合而得的新流程可以导入DiscoveryStudio中使用，这样使得科研流程的方便共亨成为可能。同时，PipelinePilot这个开放平台技术还为使用者整合自己的或第三方的软件工具提供了接口。科研人员可以在一个统一的平台上完成从基因到先导化合物设计的一系列工作，并且可以通过web形式共•亨研究成果。DS的服务器•客户端模式使得科研人员能够最方便PL最大限度地实现讣算资源共亨。D

3、S目前的主要功能包括：蛋白质的表征（包括蛋白■蛋白相互作用）、同源建模、分了力学计算和分了动力学模拟、基于结构药物设计工具（包括配体■蛋白质相互作丿IJ、全新药物设计和分子对接）、基于小分子的药物设计工具（包括定量构效关系、药效团、数据库筛选、ADMET）和组合库的设计与分析等。DS可以应用于生命科学以下研究领域：新药发现，生物信息学，结构生物学，酶学，免疫学，病毒学，遗传与发育牛物学，肿瘤研究。DiscoveryStudio功能模块简介三、Accelrvs软件应用于生命科学Accelrvs软件应用于生命科学DiscoveryStudio功能模块简介-

4、基本界面和显示模块DiscoveryStudioStandaloneDiscovervStudioVisualizerClient-蛋白质模拟模块DSMODELERDSProteinRefineDSProteinHealthDSProteinFamiliesDSS巳auenc巳Analysis-基于结构的药物发现和设计模块DSFlexibleDockinqDSLigaridFitDSLiqandScoreDSLibDockDSCDOCKERDSProteinDockinqDSLudiDSDeNovoEvolutionDSLiqandFitCAP/DSL

5、udiCAPDSGOLDinterface-基于药效团的药物发现和设计模块DSCatalvstConformationDSCatalvstHvDOthesisDSCatalystSBPDSCatalvstScoreDSCatalystShapeDSCatalvstDBBuildDSCatalvstDBSearchDSDeNovoLigandBuilderHvdoDBPCDB(PharmaCoreDB)-基于小分子的药物发现和设计模块DSQSARGFAConwonentVAMPDescriptorsComDorient/DMol3DescriptorsC

6、onwonentDSLibraryDesianDSADMETDSTOPKAT-分子力学和分子动力学计算模块DSCHARMmDSCHARMmLiteDSCFF(高级U类力场)DSMMFF(MerckMolecularForceField)-分析模块DSBiouolvmerDSAnalysis基本界面和显示模块•DiscoveryStudioStandalone可视化界面，是利用DiscoveryStudio软件进行分子设计和模拟的基础，支持服务器■客户端安装在同一台机器上的运行模式。与PipelinePilotServer结合在一起，提供化学/牛物学数据

7、显示、模拟/分析、构建三维分子、展示动态变化、三维作图及许影Jt•它功能。是服务器■客户端运行模式中、客户端的可视化界面，用于访问和使用服务器端的DiscoveryStudio软件。必须与服务器端配置的PipelinePilotServer协同工作，为川户提供无与伦比的数据、工作流程和计•算资源共享。蛋白质模拟模块・DSMODELER只耍给出未知结构序列与另一个已知三维结构责口的比对，利用工业标准的快速同源模建方法，便可门动并快速产生优化的蛋白同源模型。对于靶标发现及蛋白家族功能结构分析，MODELER是一个理想的解决方案。用MODELER还可以模拟蛋

8、白突变，进行loop区模建及基于结构的比对并构建有配体结合的蛋白结构模型。结nSequence