功能基因组学的研究方法.pdf

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1、生物技术通讯LR44R8MSIKS‘4RQEI‘L‘Fab.B"*I.)cABP&##&*#"文章编号!"##$%###&’&##&(#)%#*#"%#)综述功能基因组学的研究方法师科荣P王爱国’中国农业大学动物科技学院，北京"###$)(摘要：基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学。功能基因组学时代对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析。本文综述了功能基因组学的研究内容与方法，主要包括：差异显示反转录GQ8、基因表达序列分析（MJFR）、微点阵、遗传足迹法、反求遗传学、蛋白质组学和和生物信息学等新方法。关键词：功能基因组学；研究方法

2、中图分类号：^02文献标识码：J!"#"$%&’(")’*+#*,,-.&)/*.$01".*(/&#MEST,%:.-+PUJIFJ;%+A.（Q.BB,+,.CJ-;/6BM<;,-<,6-94,<5-.B.+V，Q5;-6J+:;

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4、.C+,-,,N]:,77;.-’MJFR(P/;<:.6::6V7P+,-,@;

5、传递途径；发育的功能，如参与形态建成等>)?。是在"$23年才由45./678.9,:;<=为一新刊物命名而首先提当然，对于一段HIJ序列的功能分析我们可以简单地利用软出的>"?，十多年来它已被科学界广泛接受。现在，基因组学的研件（如KLJM4I-和KLJM4N）与F,-K6-=中公布的基因序列究正从测序和建立图谱向基因组功能研究方向发展。有人把进行同源性比较。比较的结果可能有以下几种情况：!与生理基因组研究的发展过程分为两部分：前期的结构基因组学和生化功能已知的基因具同源性；"与生化功能已知的基因（7@:A<@A:6B+,-./;<7）和后期的功能基因组学

6、（CA-<@;.-6B+,D具同源性，但该基因的生理功能未知；#与其它物种中的生化-./;<7）。也就是说，结构基因组学代表基因组分析的早期阶和生理均未知的基因具同源性；$虽与生化和生理功能均已段，以建立生物体高分辩率遗传、物理和转录图谱为主；功能知的基因具同源性，但对该基因的功能了解尚不深入。基因组学代表基因分析的新阶段，是利用结构基因组学提供直接研究基因的功能可以通过如下途径：!研究基因的的信息系统地研究基因功能，它以高通量、大规模实验方法及时空表达模式确定其在细胞学或发育上的功能，例如在不同统计与计算机分析为特征>&?。随着人类基因组计划（EFG）的顺

7、细胞类型、不同发育阶段、不同环境条件下以及病原菌侵染过利进行，生物、医学等的研究已进入了后基因组时代>*?。如果说程中/8IJ和O或蛋白质表达的差异；"研究基因在亚细胞结构基因组学提供了巨大的HIJ和蛋白质数据，那么功能基内的定位和蛋白质的翻译后调控等；#利用基因敲除（=-.<=%因组学的一个任务就是如何借助新技术和新方法充分利用数.A@）技术进行功能丧失’B.77%.C%CA-<@;.-(分析或通过基因的过据库去研究基因功能。量表达（转基因）进行功能获得’+6;-%.C%CA-<@;.-(分析，进而研究目的基因与表型性状间的关系；$通过比较研究自发或诱"基

8、因功能的含义发突变体与其野生型植株在特定环境条件下基