抑制性差减杂交_ssh_技术在分离植物差异表达基因中的应用_黄鑫

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1、分子植物育种,2006年,第4卷,第5期,第735-746页MolecularPlantBreeding,2006,Vol.4,No.5,735-746新思路、新技术、新方法NovelThinking&Technology抑制性差减杂交(SSH)技术在分离植物差异表达基因中的应用黄鑫1,2戴思兰1孟丽1,2郑国生2*1北京林业大学园林学院,北京,100083;2莱阳农学院生命科学院,青岛,266109*通讯作者,gszheng@lyac.edu.cn摘要抑制性差减杂交技术(SSH)是基于抑制PCR作用的cDNA差减杂交,是在转录水平上研究差异基因表达的技术。该技术在

2、一个循环过程中完成差异表达基因丰度的均等化及目标群体和对照群体中相同基因的去除,从而实现差异表达基因的高度富集。一个典型的SSH过程,可在一个差减杂交过程中将稀有基因序列富集上千倍。本文通过详细分析该技术在植物差异表达基因分离中的应用发现:SSH技术主要用于分离组织特异性表达和诱导型表达的基因。首先,SSH技术广泛应用在分离植物发育过程中不同发育阶段和不同组织器官中的组织特异性表达的基因,为揭示植物生长发育过程的分子机理提供了有效手段;另外,在不同植物中,该技术被大量应用于分离各种生物及非生物胁迫条件下诱导表达的抗性相关基因,可以揭示植物抗逆的分子机理。目前,SSH

3、技术已开始应用于分离与次生代谢产物合成相关的基因。SSH技术是分离植物差异表达基因,揭示植物复杂生命现象分子机理的有效方法,将在植物差异表达基因研究中得到更广泛的应用。关键词抑制性差减杂交(SSH),植物,差异表达基因TheApplicationofSuppressionSubtractiveHybridization(SSH)onIsolatingPlantDifferentGenesHuangXin1,2DaiSilan1MengLi1,2ZhengGuosheng2*1CollegeofLandscapeArchitecture,BeijingForestry

4、University,Beijing,100083;2CollegeofLifeScience,LaiyangAgricultureCollege,Qingdao,266109*Correspondingauthor,gszheng@lyac.edu.cnAbstractSuppressionsubtractivehybridization(SSH)isatechniqueforthestudyondifferentgenesexpressionontranscriptionallevel,whichisacDNAsubtractivehybridizationba

5、sedonthesuppressionPCR.Itcombinesnormalizationandsubtractioninasingleprocedure.ThenormalizationstepequalizestheabundanceofcDNAswithinthetargetpopulationandthesubtractionstepexcludesthecommonsequencesbetweenthetargetanddriverpopulations.Inamodelsystem,SSHtechniqueamplifyraresequencesove

6、r1000timesinoneroundofsubtrac-tivehybridization.TheapplicationofSSHonisolatingplantdifferentialexpressiongeneswerereviewedinthispaper.TheauthorsproposedthatSSHwasmainlyusedtoisolatetissuespecificgenesandinducibleexpressiongenes.Firstly,theSSHwasusedtoisolatetissuesororgansspecificexpre

7、ssiongenesindifferentdevelopmentstagesofplant.Thesegenesprovideevidenceforexplainingthemolecularmechanismofplantdevelopment.ThenSSHwaswidelyusedtoisolategenesrelatedtoresistanceunderbiologicalorabiologicalstressindifferentplantsandthemolecularmechanismoftheresistancewasprimarilyeluci

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