青虾泛素特异性蛋白酶9基因Usp9全长cDNA序列的克隆及表达分析.pdf

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1、中圊患雩c丕报2015,31(17):28—37ChineseAgriculturalScienceBulletin青虾泛素特异性蛋白酶9基因Usp9全长cDNA序列的克隆及表达分析袁晖,周巧,张世勇,傅洪拓12,孙盛明,乔慧,张文宜(‘南京农业大学渔业学院,江苏无锡214081:2中国水产科学研究院淡水渔业中心,江苏无锡214081)摘要:本研究首次克隆了青虾的Usp9(ubiquitin—specificprotease9)基因全长cDNA序列,并在青虾中使用荧光定量PCR技术首次检测了Usp9基因在不同组织和发育阶段中的表达变化。青虾

2、Usp9基因cDNA全长1259bp,包括162bp的5’UTR,978bp的开放阅读框以及l16bp的3’UTR。氨基酸序列比对分析显示,青虾Usp9蛋白与太平洋牡r~i(Crassostreag)、凤仙花熊蜂(Bombusimpatiens)~灰短尾负鼠(Monodelphisdomestica)的蛋白相似度分别为99%、97%和95%。应用MEGA5.1软件对青虾与其他物种的Usp9氨基酸进行系统进化树分析,结果表明,青虾Usp9与同为甲壳纲的钩额型蚤状潘聚为一支,具有最近的亲缘关系。采用荧光定量PCR技术检测了Usp9基因的时空表达

3、,水温28℃时,Usp9基因在青虾发育的后幼体发育期第5天PL5出现表达高峰。Usp9基因在6种成体组织中均有表达,表达水平依次为:脑>腹神经>精巢>卵巢>肌肉>肠。而在雌雄组织差异表达分析表明,精巢中Usp9基因表达量比卵巢的比值为2.86,脑组织中雄虾的表达量比雌虾为2.27,差异均为极其显著<0.01)。这表明Usp9基因的表达和雄性偏向基因趋势是一致的(雄性表达:雌性表达≥1.5)。本研究为进一步开展青虾Usp9基因功能等相关研究奠定了基础,并可为青虾性别的遗传调控机制研究提供参考。关键词:青虾;泛素特异性蛋白酶9;基因克隆;时空表

4、达中图分类号:S9文献标志码:A论文编号:2013-1284Full-LengthcDNACloningandSpatial_-TemporalExpressionAnalysisofUbiquitin—-SpecificProtease9GeneinOrientalRiverPrawn,MacrobrachiumnipponenseYuanHui。,ZhouQiao,ZhangShiyong,FuHongtuo,SunShengming,QiaoHui,ZhangWenyi(FisheriesCollege,№ngAgricultureU

5、niversity,WuxiJiangsu214081;FreshwaterFisheriesResearchCenter,ChineseAcademyofFisherySciences,WuxiJiangsu214081)Abstract:Inthisstudy,thefull—lengthcDNAsequencewasclonedandspatial—temporalexpressionpatternofUsp9wasdetectedbyquantitativereal—timePCR(qRT—PCR)forthefirsttimefr

6、omthetestisoforientalriverprawnMacrobrachiumnipponense.Thefull—lengthcDNAsequenceofgsp9is1259bp,containinganopenreadingframeof978bp,162bpof5’一untranslatedregion(UTR),116bpof3一UTRwithapoly(A)tail.Thededucedaminoacidsequenceof脚9shares99%,97%and95%similaritytoCrassostreagigas

7、,BombusimpatiensandMonodelphisdomestica,respectively.ThephylogenetictreebasedonotherspeciesUsp9proteinsshowedthatUsp9fromtestisofMnipponensesharedtheclosestrelationshipwithDaphniapulex.qRT—PCRanalysisdemonstratedthattheexpressionlevelsof【尽D9innipponensereachedthepeakinthe5

8、dayofthe基金项目:江苏省高技术研究项目“青虾新品系的选育”(BG2007328);中央级科研院所基本科研业务费专项“青虾精巢均一化构建及表达序列标签分析”(2Ol1JBF

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