基因组学课件8.比较基因组学.ppt

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1、比较基因组学中英联合实验室Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比较基因组学的产生伴随着基因组的研究,相关信息出现了爆炸性增长,迫切需要对大量基因组数据进行处理,比较基因组学作为一门重要的工具学科应运而生。比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之间的全方位基因和基因家族的比较分析，构建系统发育的遗传图谱,来揭示基因、基因家族的起源和功能及其在进化过程中复杂化和多样化的机制。E

2、valuationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021果蝇基因组果蝇基因组全长180mb，2/3是euchromatin，1/3是heterochromatin；BlastSearch确定有14113个转录产物（功能基因）。Science,287:2185-2195(2000)Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfil

3、e5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比较基因组学定义利用不同物种基因组之间功能区域顺序上、组织结构上的同源性克隆新基因揭示基因功能阐明物种进化关系、基因组的内在结构Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比较基因组学的应用揭示非编码功能序列发现新基因发现功能性SNP阐述物种间的进化史阐明人类疾病过程的分子机制Evaluat

4、iononly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比较基因组学与进化古细菌---产甲烷球菌与原核生物共同之处：染色体组织与结构：环状基因组、基因的操纵子结构等能量产生和固氮基因与有很高的同源性与细胞分裂有关的蛋白质、20多个编码无机离子运输蛋白的ORF与细菌基因同源调控模式类似于原核生物与真核生物共同之处：细胞遗传信息传递，尤其是转录和翻译系统分泌系统说明该细菌与真核生物亲缘关系较近。Evaluation

5、only.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比较基因组学与进化比较基因组学提供的结果表明，在进化系统树上，古细菌与真核生物亲缘关系比原核生物更近。自养生物的三个分支，细菌、古细菌和真核生物中，细菌的分化发生较早。Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyL

6、td.9/2/2021比较基因组学的具体应用方法和策略序列的比对分析确定基因组序列的进化关系基因共线性synteny：染色体片段的分析物种序列的优化选择对DNA序列的信息注释Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021基因组成的相似性基因共线性synteny：基因排列顺序的一致性宏观共线性：遗传连锁图上锚定标记排列次序的一致性微观共线性：物理图上基因序列的一致排列进化距离非常近的物种间

7、保持很好的微观共线性在进化过程中，基因共线性被各种因素所破坏，进化距离越远的物种之间基因共线性越差，两个物种之间的共线性程度可以作为衡量它们之间进化距离的尺度Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021高度保守和高度变异X染色体极为保守，人类和猫的X染色体具有纵贯全条的共线性在保守性较低的区段，基因进化速率快于整个基因组的平均进化速率它们在种间基因组中很少表现共线性，甚至在同一物种的不

8、同生态型之间这些区段也会发生较大变异当用基因共线性程度估算物种分化