转录后加工课件.ppt

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1、转录后加工转录后的加工(posttranscriptionalmodification)(1)减少部分片段:如切除5′端前导序列,3′端拖尾序列和中部的内含子;(2)增加部分片段:5′加帽,3′加poly(A),归巢和通过编辑加入一些碱基;(3)修饰:对某些碱基进行甲基化等。第一节tRNA和rRNA的加工一.原核的tRNA和rRNA的加工参与蛋白质合成的tRNA和rRNA都不是最初的转录产物(1)它们的5′端都是单磷酸,而原始的转录产物5′应是三磷酸;(2)分子比初始转录物小;(3)tRNA含有特殊的碱基,这些碱基只有通过一些化学修饰才可以得到。表13-1E.coli中含有

2、的小分子核酸酶酶基因底物功能RNasePrnpAtRNA5′端内切RnaseOrnpBRnaseBN?tRNA3′端外切RnaseDrndtRNA3′端外切RnaseT?tRNA3′CCA外切RnaseⅢrncrRNA和mRNA内切RnaseR?rRNA和mRNA外切RnaseErne5SrRNA内切RnaseⅠrna大部分RNA内切RnaseⅡrnbRNA外切多核苷酸磷酸化酶pnpRNA外切RnaseHrnhRNA-DNA杂合链内切《GENES》IV,1990.B.Lewin,Table14.2(一)tRNA的加工tRNA的加工分成3个阶段(1)“斩头”,形成5′末端;(

3、2)去尾,形成3′-OH末端。缺-CCA的tRNA要用tRNA核酸转移酶加-CCA。(3)修饰:通过甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等进行修饰,如氨基酸臂的4-硫尿苷(4tu),D臂的2甲基鸟苷(2mG),TψC臂的假尿苷(ψ)和反密码子环上的2异戊腺苷(2ipA)真核tRNA内含子的特点:①位置相同,都在反密码子环的下游;②不同tRNA的内含子长度和序列各异;③外显子和内含子交界处无保守序列;④内含子的剪切是依靠RNase异体催化;⑤内含子和反密码子配对形成茎环。有何意义?二真核的tRNA和rRNA的加工真核tRNA的基因和原核不同:(1)真核的前体分子tRNA是单顺反

4、子,但成簇排列,基因间有间隔区;(2)真核tRNA基因一般都比原核tRNA基因多得多,如酵母约有400个tRNA基因;(3)5′端单磷酸核苷酸,表明已被加工过;(4)tRNA的前体分子中含有内含子。真核tRNA内含子切除的特点:(1)没有交界序列,也没有内部引导序列;(2)剪切反应的信号是二级结构,而不是一级结构;(3)是依赖于蛋白质性的RNase,而不是核糖拟酶或snRNP;(4)反应的本质不是转酯反应。酵母tRNA前体内含子3’和5’端的剪切是由内切酶的不同亚基催化的。亚Sen34,Sen15剪切3’端,Sen54可能通过量度成熟结构的距离来决定5’端剪切位点的位置。真

5、核tRNA的加工和原核的区别(1)真核tRNA前体中无二聚体和多聚体;(2)增加了剪接内含子的过程;(3)都要加CCA。真核细胞中rRNA的加工途径(1)切除5′端的前导序列;(2)从41S的中间产物中先切下18S的片段。Hela细胞的切点在18S和5.8S之间的ITS(内部转录间隔序列);L细胞的切点在18S序列和ITS的交界处,称为先成熟。(3)部分退火,形成发夹结构;(4)最后修正。第二节前体mRNA的加工mRNA前体分子的加工主要是真核mRNA,原核的mRNA一般不经过加工。真核mRNA的加工一般要经过四步:(1)5′加帽;(2)3′加尾;(3)切除内含子;(4)修

6、饰:对某些碱基进行甲基化。原核生物mRNA的加工二真核mRNA前体的加工(一)核内不均一RNA(heterogenousnuclearRNA,hnRNA)平均分子长度为8-10Kb(2Kb~14Kb)左右。比mRNA的平均长度(1.8-2Kb)要大4-5倍。hnRNA仅有总量的1/2转移到细胞质内,其余的都在核内被降解掉。hnRNA是mRNA的前体,证据是:(1)hnRNA和mRNA有相同的序列;(2)hnRNA在体外能作为模板翻译蛋白;(3)两者5′端都有帽子结构;(4)表明二者为相同的聚合酶所合成;(5)两者的3′端都有多聚腺苷有尾巴。hnRNA的结构的特点(1)5′端

7、有帽结构;(2)3′端有poly(A)尾巴;(3)帽结构后有3个寡聚U区,每个长约30nt;(4)有重复序列,位于寡聚U区后面;(5)有茎环结构,可能分布于编码区(非重复序列)的两侧;(6)非重复序列中有内含子区。1.加帽(1)剪接前加帽如呼肠病毒,牛豆病毒(2)剪切后加帽如疱疹病毒和口炎病毒帽子的类型在末端鸟苷的第7位上存在单个甲基化位点的称O型帽子(capO);在次末端核苷酸的核糖上的2′-0位点上还有一个甲基位点的称1型帽子(cap1);此外,在第三个核苷酸的核糖上(2′-0)有甲基化位点的称2型帽子(cap

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