报告人黄理明导师林东昕教授.ppt

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1、报告人：黄理明导师：林东昕教授染色体6q13拷贝数多态与胰腺癌发病相关中国医学科学院肿瘤研究所胰腺癌临床及流行病学特点临床特点：1、病程短，进展快，预后差；2、目前最有效的治疗方法就是早期根治性切除；3、起病隐匿，根治性切除率仅20%。流行病学特点：1、发病水平与社会经济状况有一定关系；2、我国胰腺癌的发病率和死亡率均呈上升趋势。WangL,etal.2005胰腺癌发病的危险因素确定的危险因素可能的危险因素年龄糖尿病吸烟不良饮食习惯慢性胰腺炎某些职业性暴露遗传性胰腺炎胆囊炎或胆囊切除史胰腺癌发病的遗传因素研究人群病例数量对照数量基因基因功能高加索及美国人309964GSTT1香烟致癌

2、物代谢高加索及德国人52235UGT1A7香烟致癌物代谢高加索、西班牙、365379NAT1香烟致癌物代谢非洲及北美人群高加索及美国人309964XRCC1碱基切除修复多人群GWAS38513934ABO血型抗原中国人163337MTHFR/TS叶酸代谢中国人397907FasL/CASP8死亡受体通路中国人393786COX2前列腺素合成拷贝数多态的定义拷贝数变异：copynumbervariation,CNV>1kb的DNA片段获得（插入或重复）和缺失包含碱基数>SNP拷贝数多态：copynumberpolymorphism,CNP人群中发生的频率>1%拷贝数多态与疾病关联研究G

3、ENETYPELOCUSPHENOTYPENBPF23Loss/Gain1q21.1neuroblastomaunknownLoss2p24.3prostatecancerFCGR3Loss1q23.3Glomerulonephritis,systemiclupuserythematosusLCE3B/3CLoss1q21psoriasisLPALoss/Gain6q25.3AlteredcoronaryheartdiseaseriskCCL3L1/CCL4L1Loss/Gain17q12ReducedHIVinfection;reducedAIDSsusceptibilityCYP

4、2A6Loss19q13.2AlterednicotinemetabolismSNP芯片病例和对照的基本资料VariablePatients(n=420)Controls(n=817)P*No.(%)No.(%)Sex0.659Male265(63.10)505(61.81)Female155(36.90)312(38.19)Age(y)0.5034022(5.24)40(4.90)41-60174(41.43)367(44.92)>60224(53.33)410(50.18)*Two-sided2test.染色体6q13拷贝数多态与胰腺癌发病风险的关系CopynumberPat

5、ients(n=420)Controls(n=817)OR*(95%CI)PNo.(%)No.(%)2copies144(34.28)364(44.55)1.00(reference)1copy233(55.48)362(44.31)1.75(1.33–2.31)7.56×10-50copy43(10.24)91(11.14)1.07(0.68–1.69)0.780or1copy276(65.72)453(55.45)1.61(1.24–2.11)4.41×10-4*Datawerecalculatedbylogisticregression,adjustedforsex,agean

6、dsmokingstatus.breakpointMappingchr6:74,648,791chr6:74,659,169CNV精确定位芯片粗略定位：chr6:74649185-74658419长度：9235bpPreModPredictedRegulatoryModules(hg17,Build35)BLASTNalignhumanandmousegenomeHumanMouse生物信息学分析功能研究假设FeukL,etal.2006**100020003000400050006000SV40promoterPredictedRegulatoryModuleP-targetP-c

7、ontrol报告基因实验P<0.01初步结论染色体6q13拷贝数多态与胰腺癌发病相关该拷贝数多态的具体定位：chr6:74,648,791-74,659,169该区段可能包含一个负调控元件主要参考文献1.WangL,etal.ThechangingpancreaticcancermortalityinChina(1991-2000).ChinJInternMed,2005,44(7):509-513.2.LochanR,etal.Geneticsuscep