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时间:2019-06-18
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1、第一章基因组概论细胞内的遗传物质1.染色体(chromosome)和染色质(chromatin):细胞内的一种形态结构,易被碱性染料染成深色,由核酸和蛋白质组成。2.基因组(genome):细胞中一套完整单体遗传物质的总和。3.基因(gene)-基因组的功能单位。基因(gene)的分子生物学定义合成有功能的蛋白质或RNA所必需的全部DNA序列(除部分病毒RNA),即一个基因不仅包括编码蛋白质或RNA的核酸序列(编码序列),还应包括为保证转录所必需的调控序列(非编码序列)。&本质:DNA或RNA&产物:蛋白质或RNA转录单位(transcript
2、ionunit)蛋白基因鉴别标准1开放阅读框架(openreadingframe,ORF)始于起始密码子并终于终止密码子的一串密码子组成的核苷酸序列2密码子偏爱3序列保守性4转录产物5基因失活总结:1、DNA与染色体的关系:2、DNA分子的特点:3、DNA与基因的关系:4、DNA是DNA是组成染色体的主要物质相对分子质量很大,分子由两条长链组成,盘成螺旋状(双螺旋)基因是DNA分子上起遗传作用的一些片段(相当于火车与车厢的关系)一种遗传物质,但不是唯一的一种。染色体>DNA>基因基因组(genome)(P10)是指生物体全套单倍体遗传信息,包括所
3、有基因和基因间的区域。对人类而言:22+X+Y+mtDNA46,XY&细胞中一套完整单体遗传物质的总和。基因总数基因组中基因数目与生物进化程度和复杂程度的不对称性——N值矛盾(Nvalueparadox)基因大小基因组中基因大小(bp)与生物进化程度和复杂程度的不对称性——C值矛盾(Cvalueparadox)基因组计划以获得某物种基因组全序列为主要目标的科学计划——基因组计划基本原理:人类基因组DNA打碎拼接基因组测序计划海量DNA序列数据DNA序列是生命的真谛,这个世界上发生的一切事情都与这一序列息息相关。人类基因组计划(HGP)199
4、0年启动目标:测定人类基因组的全部DNA序列,了解基因及其功能国际大合作:美国、英国、日国、法国、德国、中国投入:30亿美元结果:2003年完成精细图,产生约32亿个数据(碱基)人类基因组计划(humangenomeproject,HGP)遗传图谱(geneticmap)(连锁图linkagemap)用遗传标签确定基因排列顺序物理图谱(physicalmap):确定排列距离序列图谱(sequencemap):碱基排列顺序9/21/2021复旦大学图书馆文献检索教研室检索字段限制分子类型选择基因位置限定序列片段限定数据更新,日期限定功能栏核酸序列检
5、索9/21/2021复旦大学图书馆文献检索教研室序列存取号基因定义数据库标识符9/21/2021复旦大学图书馆文献检索教研室代码物种来源参考文献特性9/21/2021复旦大学图书馆文献检索教研室原序列复制后,可到BLAST中进行相似性对本AGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATC
6、GAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGCGATGCATGACCTAGCAAGAAGTTGCATG
7、ACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACTGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATG
8、ACCTAGCAAGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAATGCATGACCTAGCAGCATCGCGATGCATGACC
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