幽门螺杆菌 γ谷氨酰转肽酶基因的克隆及序列分析

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时间:2018-07-08

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1、幽门螺杆菌γ谷氨酰转肽酶基因的克隆及序列分析:唐炜,张尤历,王文兵,陈慧娟【摘要】目的:克隆不同疾病的幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,Hp)γ谷氨酰转肽酶(Gammaglutamyltranspeptidase,GGT)基因,并进行序列分析。方法:从人胃黏膜组织中分离培养获得Hp,提取其基因组DNA,对GGT基因进行PCR扩增,克隆进pMD18T载体,进行测序和生物信息学分析,并与基因库中公布的标准株26695和J99的GGT氨基酸序列进行比对分析。结果:成功克隆了分别于

2、慢性胃炎,胃溃疡,十二指肠溃疡和胃癌的4种Hp菌株GGT片段,并进行了序列分析。4种病源的HpGGT序列大小均为1704bp,编码567个氨基酸,理论分子质量是61kDa,等电点是9.3,在N端具有信号肽,含有ATP蛋白激酶结合结构域和γ谷氨酰转肽酶保守结构域。序列比对分析显示,不同的Hp菌株GGT具有很高的保守性。结论:GGT在Hp中高度保守,具有分泌作用,可能对宿主细胞产生影响。该基因的成功克隆为进一步研究其功能打下了基础。【关键词】幽门螺杆菌;γ谷氨酰转肽酶;基因克隆;序列分析;信号肽[

3、Abstract]Objective:Tocloneandanalyzetheγglutamyltranspeptidase(GGT)geneofHelicobacterpylori(H.pylori).Methods:ThestrainsofH.pylorihumangastricmucosaedium.TheGGTamplifiedbyPCRfromH.pyloriDNAaticsmethod.Thesequencesinoacidsinalandthereyltranspeptidases

4、ignature.Thesequenceanalysisshoinoacidsequencesinoacidandhasanimportantroleinhostcells.Cloningthisgeneyltranspeptidase;genecloning;sequenceanalysis;signalpeptide自从1983年ashall由人胃黏膜分离出幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,Hp)后,Hp感染与慢性胃炎(chronicgastritis,CG)、胃溃疡(gast

5、riculcer,GU)、十二指肠溃疡(duodenalulcer,DU)和胃癌(gastriccancer,GC)等疾病的关系逐步被人们所认识[1]。国际癌症机构已将Hp列为Ⅰ级致癌因子[2]。γ谷氨酰转肽酶(Gammaglutamyltranspeptidase,GGT)是一种催化肽基转移作用的酶,广泛存在于原核和真核细胞中[3],在动物体内主要存在于肾、肝、胰等脏器,在谷胱苷肽的新陈代谢中起到了重要的作用[4]。Hp分泌的GGT通过抑制CD4+T细胞的增殖,从而抑制了CD4+T细胞对Hp

6、的清除作用,可见GGT对Hp的定植有一定的作用[5]。GGT参与诱导Hp介导的程序性细胞死亡,可能是一个较好的抗肿瘤因子[6]。但程序性细胞死亡的持续发生,破坏了新细胞生成和细胞消亡之间的平衡从而产生病理作用[7],凋亡调节基因的转变和突变的频繁发生,反而增加了胃癌发生的危险性[8]。有关GGT的生物学机制和在体内的效应还需要进一步的研究。本实验采用PCR技术分别扩增出了于胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡和胃癌的4种H.pylori菌株的GGT片段,并进行克隆和序列测定、序列分析,以了解GGT基因在致病

7、过程中的变化情况,为进一步研究GGT的生物机制提供了依据。1材料与方法1.1材料 临床Hp菌株由本院内镜室活检标本分离培养获得。Hp基础培养基、微需氧环境发生袋、选择性抗生素及厌氧培养罐购自德国Merck公司。改良布氏肉汤培养基由上海腹泻疾病控制中心提供。无菌羊全血购自金坛欣迪公司。大肠埃希菌E.coliDH5α为江苏大学生命科学研究院实验室保存。pMD18T载体、LATaq酶、质粒抽提试剂盒为TaKaRa公司产品。酵母提取物、蛋白胨为OXOID公司产品。其他常规试剂为市售分析纯。1.2实验方

8、法1.2.1Hp的培养活检组织标本经快速尿素酶试验证实Hp阳性,结合胃镜和病理结果分析诊断为慢性胃炎(5例),胃溃疡(5例),十二指肠溃疡(5例)和胃癌(5例)。将于这4种疾病类型的活检新鲜组织用接种环均匀涂于固体琼脂培养基,在微需氧环境下,37℃培养约3~5天后收集细菌。1.2.2Hp基因组DNA提取刮取培养96h的菌落,按以下步骤提取DNA:用500μlPBS液重悬细菌,4℃,12000r/min离心10min;弃上清,100μlTE液重新悬浮细菌,加入500μlGES液混匀,

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