生物有机化学复习提纲

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时间:2018-07-09

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1、一、鞠建华:绪论、酶1.生物有机化学(BioorganicChemistry):有机化学和生物化学的交叉学科,运用有机化学的理论和方法在分子水平上研究生命现象的化学本质。2.你还了解哪些天然产物或者分子具有哪些生物学功能?3共价键、氢键、配价键、离子键、疏水作用、范德华作用力4化学键,范德华力,氢键比较5R/S构型生物分子立体效应的影响主要表现在:影响反应的活性和方向性;生物分子间的相互作用等。1.对反应活性的影响——邻基效应(proximityeffects)2.对反应立体选择性的影响(酶促反应的立体选择性例子)生物体内的基本有机反应1.水解反应:包括酯键、酰

2、胺键和糖苷键的水解。2.缩合反应:生成酰胺键、酯键、糖苷键的反应,其它缩合反应(羟醛缩合反应、克莱森酯缩合反应、迪克曼缩合)3.磷酰化反应4.氧化和还原反应5.烷基化反应(脂肪酸碳链增长反应)6.加成反应(亲电加成反应、亲核加成反应、环加成反应即迪尔斯-阿尔德反应)7.消除反应8.分子重排反应(克莱森重排、频哪醇重排、法沃尔斯基重排)9.异构化反应n酶(enzyme)是一类由活细胞产生的,对其特异底物具有高效催化作用的生物催化剂。n生物催化(biocatalysis)是指利用酶或者生物有机体(细胞、细胞器、组织等)作为催化剂进行化学转化的过程。举出生活中,酶应用

3、的具体例子。1.医用:胰蛋白酶——用于促进伤口愈合和溶解血凝块,还可用于去除坏死组织,抑制污染微生物的繁殖。2.日用:加酶洗衣粉3.食用:凝乳酶——奶酪生产的凝结剂,并可用于分解蛋白质。乳糖酶——降解乳糖为葡萄糖和半乳糖,获得没有乳糖的牛乳制品,有利于乳品的消化吸收。4.美容:酶对生物催化的贡献与一般化学催化剂的异同?酶为什么需要形成活性中心?共性:在反应前后没有质和量的变化;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,而不改变反应的平衡点;作用机制都降低反应活化能不同点:酶效率高;底物特异性;酶在体系内处于不断变化中;催化作用由多种因素调节;对反应条

4、件严格为什么酶的催化效率远远地比非催化剂或一般催化剂高?酶原:酶分子没有活性的前体物质。酶原的激活:在一定条件下,酶原像有活性的酶转化的过程。别构调节:指小分子化合物与酶蛋白分子活性中心以外的某一部位特异结合,引起酶蛋白分子构像变化、从而改变酶的活性。抑制剂:引起酶活力降低的别构效应剂。激活剂:引起酶活力增加的别构效应剂。举例说明,研究酶抑制剂的现实意义?医学:磺胺药是二氢叶酸合成酶的竞争性抑制剂,进而减少菌体内四氢叶酸的合成,使核酸合成障碍,导致细菌死亡新药研发:农业:苯磺隆:磺酰脲类除草剂,抑制乙酰乳酸合成酶(ALS)的抑制剂,通过抑制ALS,阻碍侧链氨基酸

5、如缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸的生物合成,导致杂草生长受破坏而死。畜牧业:脲酶抑制剂不但能抑制瘤胃内脲酶活性,降低瘤胃中氨的浓度,而且可使氨的释放速度平稳,有利于微生物合成菌体豆角、决而提高反刍动物对尿素的利用率,并提高饲料转化率X-衍射晶体学手段研究酶的意义?v测定酶分子的三维结构,明确其三维构件及结构域分布。v从原子级别,理解酶催化的机制。v基于酶分子三维结构的药物设计。酶作为药物靶向目标,为药物前期开发提供了数据支持。相比于化学合成,酶催化的合成有什么优势?化学合成:涉及糖分子中羟基的保护与脱保护,步骤多,产率低。糖苷合成酶:催化糖苷合成,一步反应得到目标产物

6、。u聚酮类化合物是一大类由细菌、真菌和植物将低级羧酸通过连续的缩合反应产生的天然产物,具有多样的碳骨架结构:u聚肽类化合物是一类不以mRNA为模板,不需核糖体、tRNA的参与,由非核糖体肽合成酶(non-ribosomalpeptidesynthetases,NRPSs)催化合成的天然产物。其氨基酸原料除了20种蛋白质源的氨基酸外,还含有大量的非蛋白源氨基酸。AT(acyltransferase,酰基转移酶):负责将低级脂肪酸以CoA酯形式通过酰基携带蛋白ACP的辅基;AT结构域对底物识别的特异性决定碳链延长单位的组成,AT结构域的数量和相应的模块决定聚酮体链的

7、长度ACP(acylcarrierprotein,酰基载体蛋白):在聚酮链延伸中起到酰基转移的携带作用KS(ketoacyl-ACPsynthase,酮脂酰-ACP合成酶):在聚酮链的延长中,起到催化新进入的酰基-ACP与已延长的聚酮中间体之间的缩合作用,使聚酮链得到进一步的延长KR(ketoreductase,酮基转移酶):参与聚酮链形成过程中酮基的还原,使酮基变为羟基DH(dehydratase,脱水酶):参与聚酮体碳链羟基的脱水;ER(enoylreductase,烯醇还原酶),参与聚酮体碳链烯醇式结构中双键的还原反应TE(thioesterase,硫脂酶

8、),通常位于PKS合酶C

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