健康儿童与轮状病毒感染儿童肠道菌群结构的比较研究

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2、菌群结构的比较研究张关玲,杜惠敏,郭美蕻,陈俊仪.,庞小燕,赵立平(1.上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与生态基因组学实验室,上海200240;2.上海交通大学附属新华医院,上海200092;3.上海交通大学附属幼儿园,上海200240)【摘要】目的比较分析轮状病毒感染个体与健康个体肠道菌群结构的差异.方法采集11例轮状病毒感染个体及6例健康个体的粪便样品,提取粪便样品中细菌的混合DNA,先通过ERIC.PCR结合分子杂交的技术分析两组个体之问肠道微生物组成的相似性;再扩增粪便样品中菌群的16SrRNA基因,利用PCR

3、.TGGE技术分析肠道菌群的组成情况.结果轮状病毒感染个体与健康个体相比,肠道菌群中Gc含量较低的菌明显减少,同时肠道菌群有宿主专一性.结论轮状病毒感染会导致儿童肠道内菌群结构失调.【关键词】轮状病毒;ERIC.PCR;PCR—TGGE;肠道菌群【中分类号】R378【文献标识码】AComparisonofmicrobialcommunitystructureinhealthyandrotavirusinfectedchil.drenZHANGMei—ling,DUHui—ming,GUOMei—hong,CHENJun—yi,PA

4、NGXiao—yan,ZHAOLi—ping(1.LabofMolecularMicrobialEcology,ShanghaiJiaotongUniversity,Shanghai200240,China;2.ShanghaiJgaoTongU-nlversltyAffiliatedXinhuaHospital,Shanghai200092,China;3.ShanghaiJiaoTongUniversityAffiliatedKindergarfen,Shanghai200240,China)【Abstract】Objecti

5、veTocomparethecompositionofthemicrobialeomnmnityinhealthychildrenandrotavirusinfectedchildren.MethodsFecalsamplesfrom11rotavirusinfectedchildrenand6healthychildrenwerecollected.ThetotalgenomicDNAwasextractedfromeachsample.Molecularhybridizationwasperformedwithamixedpr

6、obefromthela—beledERIC—PCRproductofonesample,andPCR—TGGEanalysisofamplified16SrDNAV3regionswascarriedout.Re-suitsLow—GCbacteriawerelessinrotavirusinfectedchildrenthaninhealthyones.Intestinalmicroflorawashost-specif-ic.ConclusionRotavirusinfectioncouldcausestructuralsh

7、iftsoftl,egutmicroflora.【Keywords】Rotavuims;ERIC—PCR;PCR—TGGE;Intestinalmicroflora腹泻病是影响婴幼儿健康成长的一大威胁因素,发展中国家5岁以下儿童由于急性腹泻导致的死亡率高达25%~30%,腹泻病的致病因素有很多,包括病原菌,细菌和病毒.其中轮状病毒感染是婴幼儿秋冬季腹泻的主要原因….轮状病毒属于呼肠病毒科轮状病毒属,电镜下为直径65~75nm的二十面体,有一核心,含有病毒核酸,周围包绕两层壳体,轮状病毒的核心由11个不连续双股RNA组成J.人体肠道

8、内固有的微生物可以帮助宿主消化食物,代谢药物和有害外源复合物,产生一些必需氨基酸和维生素,并有助于阻止病原体侵入胃肠道,以及刺激免疫系统对致病菌产生免疫反应等等J.当轮状病毒侵袭宿主导致腹泻以后,肠道内菌群结构组成发生变化,宿主固有的微生物保护屏障

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