综合性血液病分子诊断体系

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1、综合性血液病分子诊断体系的建立和实践刘红星lhongxing@gmail.com陆道培血液•肿瘤中心分子诊断室我们一直在进步更强的团队力量更好的硬件支持更多的新项目优化的项目设置血液病诊断和治疗已经进入分子生物学时代分类标准:1985FABWHO200120081960年1973年1985年1995年1997年2001年2008年2011年鉴定Ph染色体鉴定t(9;22)易位鉴定BCR-ABL1STI571临床试验FDA批准ImatinibBCR-ABL1定量标准化会议1985~1988年Mullis等发明PCR技术HGP,1985年提出,1990

2、年启动2000年,人类基因组草图完成2003年,HGP完成,后基因组时代开始第二代测序技术荧光定量PCR技术第一台毛细管基因测序仪生物信息:检测技术:第二代测序临床应用定量PCR临床应用定性PCR临床应用基因组学的研究推动疾病分子标记的发现和临床应用97.3%的AML患者携带其中一种或以上的基因突变预后差:FLT3-ITD、MLL-PTD、ASXL1、PHF6预后好:CEBPA、IDH2、NPM1伴IDH1/IDH2突变伴DNMT3A、NPM1突变、MLL易位患者,采用大剂量的柔红霉素治疗可提高生存率PrognosticRelevanceofInt

3、egratedGeneticProfilinginAcuteMyeloidLeukemiaJayP.Patel,etal.,NEnglJMed2012;366:1079-89肿瘤的突变组每一个肿瘤的发生都是一个基因团伙在犯罪每一个肿瘤基因组都是不同的基因突变的组合白血病分子诊断只根据一种融合基因分类的患者仍有异质性AML1-ETOVS.AML1-ETO+KIT突变只检测一种突变也是不够的NPM1VS.FLT3VS.NPM1+FLT3新的突变出现提前可能预示临床进展急变、耐药等对肿瘤突变组的全面了解有助于指导个性化治疗分子诊断的发展趋势及挑战Lucy

4、A.Godley,DOI:0.1056/NEJMe1200409分子诊断临床应用遇到的问题临床医师如何认识新的项目?实验室如果向临床医师推荐新的项目?如何提高突变的检测灵敏度?如何降低检测费用?提高发现分子标记的速度?综合性血液病分子诊断体系融合基因筛查定量监测MRD耐药、疾病进展监测基因突变筛查定量监测MRD原癌基因表达谱定量监测个体差异相关的药物代谢、药物不良反应等其它项目:移植后嵌合状态;IG、TCR克隆性;BCR-ABL1变异分析等孟德尔遗传病:先天性免疫缺陷、范可尼贫血等“活在当下”与“追本溯源”用初治时的石蜡、形态涂片标本进行基因突变筛

5、查从实验方案和流程设计上加快报告速度新技术的应用和技术创新融合基因和基因突变筛查→针对性监测降低总体检测费用,争取宝贵时间内容将不断增加,价格一般不再调整综合性血液病分子诊断体系高通量基因测序的应用降低单位检测成本肿瘤“突变组”分析变为可能深度测序–突变MRD监测IG、TCR免疫组库分析白血病融合基因和基因突变检测V2.3版31种融合基因筛查新的融合基因筛查项目AML融合基因筛查(13种)AML1-EAP(1);AML1-ETO(1);AML1-MDS1(2);CBFB-MYH11(8);DEK-CAN(1);NPM-ALK(1);NPM-MLF1

6、(1);NPM-RARA(2);PLZF-RARA(2);PML-RARA(5);SET-CAN(1);TEL-ABL1(2);TLS-ERG(5)ALL融合基因筛查(10种)BCR-ABL1(6);E2A-HLF(3);E2A-PBX1(2);NPM-ALK(1);NPM-MLF1(1);SET-CAN(1);SIL-TAL1(1);TEL-ABL1(2);TEL-AML1(2);TLS-ERG(5)MPN融合基因筛查(23种)AML1-MDS1(2);BCR-ABL1(6);FIP1L1-PDGFRA(5);TEL-ABL1(2);18种PDG

7、FRBfusiongene;TLS-ERG(5)MLL融合基因筛查(11种)MLL-PTD;MLL-AF1p(4);MLL-AF1q(4);MLL-AF4(12);MLL-AF6(4);MLL-AF9(8);MLL-AF10(18);MLL-AF17(1);MLL-AFX(4);MLL-ELL(8);MLL-ENL(4)融合基因筛查的特点和意义从分子水平快速鉴定患者基因异常节省时间和总体费用大多数情况下,某一患者只有一种融合基因阳性提供按WHO2008标准分类的依据预后判断和指导用药提供灵敏的MRD监测指标病例:格列卫治疗FIP1L1-PDGFRA

8、白血病男,43岁,贫血,血小板低,嗜酸粒细胞增多31种融合基因筛查:FIP1L1-PDGFRA阳性格列卫每周200mg→每

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