与highwire简介ppt课件

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1、生物学文献检索—PubMed与Highwire简介常民changmin@lzu.edu.cnPubMedhttp://www.pubmed.govhttp://www.pubmed.orghttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBINationalLibraryofMedicine，NLMNationalInstitutionofHealth，NIHPubMed简介PubMed由创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术

2、信息中心(NCBI)，目前美国国立医学图书馆（NLM）、国际MEDLARS成员（中国为第16个成员国）及合作的专业组织共同研制开发，是目前国际上公认的检索生物医学文献最具权威、利用率最高、影响最广的数据库，也是我国教育部、卫生部认定的科技查新必须检索的国外医学数据库。PubMedPubMed是查找众多与生物医学健康主题密切相关信息的优秀数据库系统。PubMedcomprisesmorethan21millioncitationsforbiomedicalliteraturefromMEDLINE,lifesciencejournals,andonlinebook

3、s.Citationsmayincludelinkstofull-textcontentfromPubMedCentralandpublisherwebsites.PubMed收录了全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊，从1950年至今已超过一千五百万记录。1997年6月起提供全免费服务，数据周二至周六每天更新.PubMed-Entrez检索系统Entrez是NCBI的为用户提供整合的访问序列，定位，分类，和结构数据的搜索和检索系统。Entrez同时也提供序列和染色体图谱的图形视图。Entrez是一个用以整合NCBI数据库中信息的搜寻

4、和检索工具。这些数据库包括核酸序列，蛋白序列，大分子结构，全基因组，和通过PubMed检索的MEDLINE。Entrez的一个强大和独特的特点是检索相关的序列，结构，和参考文献的能力。杂志文献通过PubMed获得，PubMed是一个网络搜索界面，可以提供对在MEDLINE上的九百万杂志引用的访问，包含了链接到参与的出版商网络站点的全文文章。PubMed数据来源1MEDLINE(1966~至今)2PreMEDLINE3Publishersuppliedcitations4Oldmedline(1951~1965)5InProcessCitations：每天收录，尚

5、未经规范处理的数据。[pubmed-inprocess]MEDLINE收录了全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊，目前文摘条目1300万篇，年报道量近40万条，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，每周更新。内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。记录标注[PubMed-indexedforMEDLINE]PreMEDLINE临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向Medline移加一次。记录标注[PubMed-inprocess]PublisherSuppliedCitation出版商

6、直接向PubMed递送的电子文献。其中有一部分在Medline中未收录。记录标注[PubMed-assuppliedbypublisher]www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed常用工具WelcometoPubMed使用帮助更多服务检索词输入框在靠近页面上部的地方，，即是供我们输入所需查询内容的检索框。　　在检索框中输入查询词，然后单击“Search”按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面，你还可以选定所要检索内容的数据库范围，除NCBI的数据库以外，可供选择的还有：PROTEIN,Nucl

7、eotide,STRUCTURE,POPSET等等。如何使用PubMed在主界面的下方框（如上图），有：·SingleCitationMatcher输入期刊的信息可以找到某篇的文献或整个期刊的内容。·BatchCitutionMatcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。·ClinicalQueries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。·Topic-SpecialQueries这一部分为特殊要求设置的，主要仍是健康和医疗。·MeSHDatabase可以用它来分层流览MeSH表。·Journ

8、alsDatabase期