基因表达2蛋白质翻译

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1、第五章蛋白质翻译(ProteinTranslation)翻译:指将mRNA链上的核苷酸从一个特定的起始位点开始,按每三个核苷酸代表一个氨基酸的原则,依次合成一条多肽链的过程。蛋白质合成的场所是蛋白质合成的模板是模板与氨基酸之间的接合体是蛋白质合成的原料是核糖体mRNAtRNA20种氨基酸主要内容第一节蛋白质翻译系统----遗传密码、tRNA、核糖体第二节蛋白质的合成第三节蛋白质的运转----起始、肽链延伸、肽链的终止及释放、前体加工----翻译-运转同步、翻译后运转第一节蛋白质翻译系统(TranslationSystem)一、遗传密码二、tRNA三、核糖体一、遗

2、传密码——三联子(一)三联子密码mRNA链上每三个核苷酸翻译成蛋白质多肽链上的一个氨基酸,这三个核苷酸就称为密码子(coden)或三联子密码(tripletcoden)。mRNA5´-GCUAGUACAAAACCU-3´(二)密码破译遗传密码的破译,即确定代表每种氨基酸的具体密码。破译工作始于1954年,至1966年20种氨基酸对应的61个密码子和3个终止密码子全部被查清。(三)遗传密码的性质1、简并性由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象称为简并(degeneracy)。减少了变异对生物的影响对应于同一氨基酸的密码子称为同义密码子(synonymouscodo

3、n)。其特征为:第一、第二位核苷酸往往相同,而第三位核苷酸的改变不一定影响所编码的氨基酸。简述密码的简并性(degeneracy)和同义密码子(synonymouscodon)武汉大学2003年试题2、普遍性与特殊性蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。线粒体与核DNA密码子使用情况的比较3、连续性编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码子间既无间断也无交叉。基因损伤引起mRNA开放式阅读框架(openreadingframe,ORF)内的碱基发生插入或缺失,会导致整个阅读框架移位(fr

4、ameshift)。4、摆动性转运氨基酸的tRNA上的反密码子需要通过碱基互补与mRNA上的遗传密码子反向配对结合,在密码子与反密码子的配对中,前两对严格遵守碱基配对原则,第三对碱基有一定的自由度,可以“摆动”,这种现象称为密码子的摆动性(wobble)。mRNA上的密码子与tRNA上的反密码子配对示意图tRNA上的反密码子与mRNA上的密码子的配对与“摆动”分析二、tRNA的结构、功能与种类tRNA在蛋白质生物合成过程中起关键作用。tRNA不但为每个三联密码子翻译成氨基酸提供了接合体,还为准确无误地将所需氨基酸运送到核糖体上提供了运送载体,所以它又被称为第二遗

5、传密码。原核生物中大约有30-45种tRNA,真核细胞中可能存在50种tRNA。(一)tRNA的结构最常见tRNA分子有76个碱基,相对分子质量约为2.5×104,不同的tRNA分子可有74~95个核苷酸不等。tRNA的稀有碱基含量非常丰富,约有70余种。每个tRNA分子至少含有2个稀有碱基,最多有19个,多数分布在非配对区,特别是在反密码子3´端邻近部位出现的频率最高,对于维持反密码环的稳定性、密码子和反密码子之间的配对很重要。1、tRNA的二级结构不同tRNA在结构上存在大量的共性,由小片段碱基互补配对形成三叶草形分子结构,有5条根据结构或已知功能命名的手臂

6、和4个环。D臂/环(Darm/loop)D臂是根据它含有特殊的碱基D(Dihydrouracil,二氢尿嘧啶)命名的;一般有2–3个D碱基;茎区长度常为4bp;氨基酰tRNA聚合酶结合反密码子臂/环(anti-codonarm/loop)茎区长度常为5bp的配对;环区含有反密码子(anti-codon);负责对mRNA上的密码子的识别与配对。额外臂/环(Extraarm/loop)长度可变性大,从4nt到21nt不等;有些tRNA没有额外臂/环;连接两个区域(D-反密码子臂和TψC-受体臂)。TψC臂/环(TψCarm/loop)特殊的碱基ψ(假尿嘧啶);茎区长

7、度常为5bp的配对;负责和核糖体上的rRNA识别结合;受体臂(acceptorarm)tRNA的5´与3´-末端7bp碱基配对形成的杆状结构和3‘端未配对的3-4个碱基所组成;3´端的最后3个碱基序列永远是CCA,最后一个碱基A的3´或2´自由羟基(-OH)可以被氨酰化;负责携带氨基酸。2、tRNA的三级结构研究酵母tRNAPhe、tRNAfMet和大肠杆菌tRNAfMet、tRNAArg等的三级结构,发现都呈L形折叠式。酵母tRNAphe的三级结构示意图(根据X-射线衍射数据绘制)。a和b表示用不同方法构建的模型。D臂和反密码子臂的杆状区域形成了第二个双螺旋。

8、“L”形三级结构组成特点

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